藥師佛全稱是“藥師琉璃光如來”，又稱藥師如來、大醫王佛、醫王善逝、十二願王，為東方淨琉璃世界的教主。所謂“藥師”即醫生。鳩摩羅什譯《大智度論》雲：“多病人，應多藥師。”唐代梁肅《藥師琉璃光如來畫像贊並序》雲：“藥師者，大醫之號；琉璃者，大明之道。所以洗盪八苦，振燭六幽，巍乎其有功。”
據佛經記載，過去世界有電光如來出世，說三乘法度眾生。當時有一位梵士養育有二子，大的名叫日照，小的叫月照。梵士見世間濁亂，因而發菩提心，要教化世界諸苦眾生。電光如來聽聞他發願要給重病眾生帶來福利，於是稱他為醫王。後來醫王潛心修佛，終成正果，成為東方藥師如來，他養育的二子也成為藥師如來身邊的兩大菩薩日光遍照菩薩和月光遍照菩薩。
藥師佛弘法利生工作是秉持在行菩薩道時所發的十二大願而來的。這十二大願是：一願自身光明熾然，照耀無量無數無邊世界，並有三十二相、八十種好；二願自身身如琉璃，光明廣大；三願眾生用物，無所乏少；四願行邪道者，歸依大乘；五願遵循戒律；六願眾生形象端正；七願眾病悉除；八願若厭女身，轉女成男；九願解脫一切外道纏縛；十願王法所繩，亦得解脫；十一願上妙飲食，飽食其身；十二願貧無衣服，皆令滿足。這十二大願滿足了眾生世出世間的諸般願求。
2-1-1 藥師佛第六大願
兩俗人跪對一佛二菩薩。據榜題，此畫面是表示第六大願：願眾生形象端正。唯文字與原經文相比多有脫落和錯字，內容也不完整。俗人服飾清晰，可供研究古代服飾史參考。
宋 莫高窟55窟 北壁
2-1-2 藥師佛
藥師佛左手託缽，右手執錫杖。佛的蓮花座、背光對稱工整，具有裝飾效果。晚期敦煌壁畫中，託缽、執錫杖的藥師佛較多，特別是在回鶻、西夏洞窟中。
五代 莫高窟6窟 北壁
2-1-3 第十二大願
圖中說法會由一佛二弟子二菩薩組成，主尊託缽。榜題完整地保留下來，知是表示第十二大願：貧無衣服，皆令滿足。在十二大願圖像中，主尊一般作說法印，託缽的形象極少見。
中唐 莫高窟231窟 北壁
2-1-4 第九第十大願
條幅畫中的各願以低緩的山丘相分隔，並呈S形分佈，二者結合使畫面出現生機。據榜題，此是表示第九第十大願：願解脫一切外道纏縛；王法所繩，亦得解脫。
宋 莫高窟55窟 北壁
世人如果想要幫助病人擺脫病痛的折磨，只要為此人齋戒七日七夜，全力供養比丘僧，每天禮拜供養藥師琉璃光如來，誦讀四十九遍《藥師經》，造七身藥師如來像，每像前各放置七盞燈，每盞燈要大如車輪，連續燃燈四十九日，再造長四十九尺的五色彩幡，就可達到祛病救災的目的。
藥師世界是極樂國。藥師經對藥師世界大加讚美，將藥師世界描繪為：“彼佛國土，一向清淨，無女人形，離諸欲惡，亦無一切惡道苦聲。琉璃為地，城闕、垣牆、門窗、堂閣、柱樑、斗栱，周匝羅網，皆七寶成，如極樂國。”藥師世界如西方極樂國，藥師佛是其教主。因此，藥師佛既是拯救苦難的救世主，也是淨土世界的教主。
世人若想脫離苦海，抵達藥師佛的淨土世界，只要謹守不殺生、不偷盜、不淫慾、不妄語、不飲酒等八項齋戒一年，就可以此善根，在臨命終時，有文殊師利菩薩、觀世音菩薩、得大勢菩薩、無盡意菩薩、寶檀華菩薩、藥王菩薩、藥上菩薩、彌勒菩薩八大菩薩乘空而來引路，抵達藥師佛的淨土世界，在種種雜色眾寶中自然化生。
2-1-5 藥師五尊像
藥師佛並二弟子、二菩薩，均為立像。藥師佛左手託缽、右手作說法印，有榜題：“南無藥師琉璃光佛觀自在菩薩眷屬聖神贊普二為先亡父母”。此窟原建於初唐，歷代有所重修，甬道南龕建於中唐。
中唐 莫高窟220窟 甬道南龕
2-1-6 齋僧、樹幡、燃燈
一宅院內一偏房安置佛像，為佛堂；正堂有數僧人餐飲，為齋僧；院內設燈輪，一女子在添油；院內近大門處樹立長杆，上懸神幡。
中唐 莫高窟358窟 北壁
2-1-7 寶池與化生
下方有寶池、蓮花，其中一朵蓮花中有一童子，表示化生。另一童子正從寶池往寶樓閣上攀登，生動可愛。
中唐 莫高窟361窟 北壁
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