1.在政治上占据主动
首先，拒绝迁都。皇太后召集大臣议事，有些官员主张顺应时局，南逃迁都，在关键时刻兵部侍郎于谦历言：“言南迁者 ,可斩也。京师 ,天下根本 , 一 动则大事去矣 , 独不见宋南渡事乎”。
于谦的建议得到了大多啥臣子的拥护。守城抗战，以稳军民之心。
第二，另立新帝。瓦剌军手里有明英宗，作为政治筹码，囤货居奇，即使朱祁镇无能，也是个皇上，还是极大地政治作用和影响力。
但国不可一日不君，朝局稳定，人心才可稳。
于谦将孟子“民贵君轻”思想理论落实落地，提出“社稷为重，君为轻”，主张立朱祁钰为皇上，遥尊朱祁镇为太上皇，这样明英宗便在瓦剌军手中失去了政治价值，而明朝则在这场战役占据了政治上的主动。
2.整顿内政
将土木堡之变的祸首王振余党超级灭族，以宽慰人心。
招纳人才，提拔文武官员，于谦认为非常之时行非常之事，将在土木堡之变中战败逃回并获罪的原大同副将石亨，免罪释放并委以重任。
同时，改革军制，创建团营制，提高作战效率，更加适合此次保卫战役。
3.调配兵力资源，明确作战统一战线
由于明王朝刚刚战败，军力不济且大部分折损，于瓦剌的军事力量相比，简直是悬殊至极，再加上明朝大部分军力都部署在西南和浙闽一带，路途遥远且必须防止边境其他部落入侵，调动起来异常困难。
急调京城周边各地备操军、备倭军和运粮大军到京师，史书上有记载当时有二十二万大军集聚京城，但后来有史学家考证，考虑到空间距离，人数不可能有如此之多，而且大多数都为战斗力不足的新兵和旧兵。
同时要求官员前往京城周边招募士兵，紧急训练，已补兵力不足。
组建民间武装力量，发动京城内所有民宗拿起武器，对抗瓦剌军。
于谦制定以京都为中心，以宣府 、大同 、居庸关 、古北口 、紫荆关为屏障的抵抗战略。
否定了石亨禁闭九门，固守城池的战术，主动出击，绝不示弱，亲率重兵设伏于德胜门，形成依靠京城为营，以战为守，分掉援军的战术格局。
在作战的主要方向上，隐藏主力部队，伺机而动；
在次要方向上，避开敌军主力，采取小股军队袭扰，多处出击，迷惑敌军。
同时，假装战败诱敌深入德胜门，神机营火器齐发，射杀瓦剌军数万人，使其兵败于城下。
4.保障后勤供给充足
兵马未动粮草先行，粮食的充足是战争胜利的前提保证。
当时京城内的粮食不足二十万军队的日常所需，在京城东郊的通州有数百万石粮食储备，但无法短时间内运送到京城内，但于谦则采用一切手段运粮，以保证军队不至于因为粮草短缺而不战自败。
重赏之下必有勇夫，除了官府自有车辆昼夜运粮外，还动员百姓前往通州运粮，除常规运费外，额外另有每次白银一两奖励，于是这种鼓励模式下，运粮队伍不停不歇，将所有通州粮草运到京城，稳定军心，保障充足的供给。
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