古零在唐宋之前属于思恩羁縻州管治。由于历来是瑶族和壮族、苗族等少数民族聚居地，虽然名义上是思恩州属地，然而朝官涉足不多，也没有驻兵营堡，因此文书记载较为匮乏。清代前期，金鉷的《广西通志》记载有：“古零土司多狼苗，谓之土人。”（狼即壮族别称之一，至今客家话尚有用“狼家”指代壮族人）。现在古零仍然保留后不少少数民族传统文化遗产：干栏建筑遗迹、壮族三声部民歌、活跃的师公戏和《传扬歌》经文等等。
古零地区在明代初期，曾设立有古零（陵）、那学、通感、下畔四个营堡。是官方为了防御少数民族和其他盗寇。其中古零堡属于，岑瑛管治下思恩军民府的十三个堡之一。
■明代嘉靖三十一年，1552年，两广总督应槚修纂的军事著作《苍梧总督军门志》。红圈部分即古零旧地。
“古零堡，在司治左劳山下，不知建自何时，相传古设堡于此地，尚堪模拟。”（《古今图书集成》），另外《隆山县志》又有补充：“古零堡城，距县城五十里，在群贤乡（今古零镇）北东村前，明洪熙年间，土州牧岑瑛剿蛮到此，筑堡以守。”
明代名臣于谦曾记录有，古零在明代前期，部分地区属于宾州（今宾阳）、上林县管辖。由于岑瑛的思恩府扩大疆域，古津村（推测为今古寨乡的古今村，笔者注）的壮族村民覃潘赵接受其管辖，并出任官职。景泰三年(1452年)，迁江县（今来宾）的叛乱势力韦多烹，率领宜州、都安和忻城等地一万多兵众前来围攻宾州城。古零地区和上林县的村民们不肯顺从，在那学堡与叛军对抗。而后遭叛军报复，攻入古津、那劳等村落。杀死覃潘赵的弟弟覃公盘等三十余人，掳去村民一百九十四人。（《于谦集·奏议卷六》）
从上述记录除了能看出古零的领地变迁，亦可看出，本地覃姓、韦姓等姓氏很多是土著居民，不一定是覃氏土司官族后裔，或从外地迁徙而来的汉族移民。据古零籍民族文化学者梁庭望先生所考证，覃姓对应的是古代壮族的黄牛图腾部落，而韦姓则对应水牛图腾部落（参见《壮族风俗志》，注意黄牛和水牛的壮语发音。另外亦有评论推测韦姓对应生殖崇拜）。这个话题过于宽泛，此处不深入讨论。
收录王守仁文集的《王文成公全书》，其中《处置平复地方以图久安疏》这篇对嘉靖七年后思恩地区的行政说明
到了明朝嘉靖五年(1526年)，因为不满“改土归流”政策,原属岑猛部下的田州府（今田阳县）土官卢苏，和思恩府丹良堡（今为平果县）土官王受，率几万兵众叛乱，史称“思田之乱”。这场叛乱深刻的影响马山县，甚至左、右两江地区的历史进程。
在思恩府担任千夫长，忠于朝廷官军的土官覃益，带人连夜将官印和思恩知府吴期英，护送到了宾州。后来覃益又参与的王守仁（王阳明）平定“思田之乱”，以及忻城、上林地区的“八寨之乱”。因而立下战功。受封为古零土巡检司第一任巡检官，世代沿袭。今天覃氏后人仍有纪念覃益的节日，谓为“公益节”。另外，须值一提得是，位于古零杨圩之东，离杨圩街四公里远的罗降隘，原先石壁上曾刻有明代总兵王守仁手迹“罗降”二字。60年代因为修公路的原因，石壁被炸毁而不复存在。
雍正十一年，即1733年，金鉷主持修纂的《广西通志》，古零土司插图页
光绪十五年，1889年，苏宗经修纂的《广西通志辑要》古零土司插图
从覃益起，至民国四年（1915年）实行“改土归流”政策，废除古零土司制度，将其辖地分割成隆山（今马山县东部）和上林两县管辖。这一期间共经历十六代土巡检司官管治古零地区，历时387年。改流前夕，古零土司拥有的疆域涵盖了今天马山县古零镇、加方乡、古寨乡，和上林县镇圩乡及西燕镇、塘红乡、澄泰乡、大丰镇、三里镇部分地区。
《古今图书集成》对古零土司的地理形势俯瞰：
“……割裂邻境攒合为治。西踞刁律，东控青木，南由罗降以直抵郡城。龙角虎头峙列，纱帽溪水朝拱，回环周匝，以山为篱，竞奇耸秀，形胜可观。”
和其他土司官族常择地搬迁官府驻地不同，古零土司四百年里几乎没有太大变动。司治最初设在德明屯，至明朝中后期，第四世土官覃大钦将官署两度搬迁，最终定居在纱帽山前，今古零中学校内。而且建立土司官署没有动用太大人力资源，这在众多重捐杂税，苛诈乡民的土司集团里显得十分难得。“古零原无衙宇，历来司官自行捐资，构椽而居。共置署宇三进，前为大门，中为大堂，二堂后为廨舍。”
在古零土司官署西南方向约一公里处，拉社屯的后山上，古代曾设有古零司兵营，名为“金刚寨”。相传此处曾为侬智高女将得驻兵处，侬军在此组织当地土民抵御宋军，并“擂鼓而进”。这个典故真实性难以考证，但它后来和当地的民俗文化结合，发展成为马山的文化遗产之一：壮族会鼓。亦有史料记载，金刚寨的建立者是岑瑛。
■光绪二十四年，即1898年，北洋机器制造总局算学堂绘制《广西舆地全图》，兴隆土司辖境图。上图黄色为笔者上色，注意古零司有飞地
《古今图书集成》同时也对土司时代的风俗环境记录在册。笔者试译成白话：古零处在偏僻深山之间，四时季节冷热变幻不定，因此农作物收成较晚。当地的村民们性格淳朴温和（与之不同的是，周围几个土司属地的村民们则显得很暴戾，旧城、下旺、白山都是腰不离刀，兴隆和定罗则是“禀性剽悍，稍有争论（拂意）即相斗杀”），多数人从事耕种和纺织农活，甚少经商，所以贫困人口占多数。家中没有积蓄。古零的村民们所穿的衣着，衣服短裙子长，男女经常赤足不穿鞋子，到了深冬也缺少厚衣物御寒。村民所居住的房屋，必定是干栏房架子楼，生病时不善求医，反而求助师公道士祈祷鬼神。饮食方面缺少茶水和食盐，喜好吃酸和辣。
“……僻处荒陬，叠山围绕，四时寒燠，难调五谷迟发少收。民朴性软，知耕褥而不事商贾，故多贫窭。无积贮。衣短裙长，男女跣足不履，冬无重裘，居必架楼。病则祷鬼，食无茶盐。味喜酸辛。”
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