研究感情的木木
您好，非常高兴回答您这个问题，在回答之前，我需要纠正您一个小小的口误，没有下书省，只有门下省，下面我会一一告知您各个机构的不同，并于现代部门对照以便于您理解。
1.中书省：中书省，古代官署名。魏曹丕始设，掌管机要、发布政令的机构。沿至隋唐，遂成为全国政务中枢。隋初称为“内史省”，后改为“中书省”。
宋代中书省与门下省合并为一个机构“中书门下”，掌握行政大权，长官为“同平章事”即宰相，其与掌管军事大权的枢密院合称“二府”。
元代以中书省总领百官，与枢密院，御史台分掌政、军、监察三权。门下、尚书两省皆废，故中书省较前代尤为重要。地方行政由中书省外派的“行中书省”即“行省”掌握。
明初沿用，洪武十三年废丞相、中书省，由皇帝直接统领六部。明永乐帝时设内阁，机要之任开始归“内阁”。负责起草诏令，明宣宗后拥有票拟奏章的“票拟权”。
您可以理解为现代的全国人大，拥有立法权，国家重大政策方针的制订，他们的功能非常相似。
2.尚书台：官僚机构。南朝宋得名，前身为“尚书台”。由汉代皇帝的秘书机关尚书发展而来。是魏晋至宋的中央最高政令机构，为中央政府最高权力机构之一。
“尚书省”的组织机构于隋朝定型。以唐代制度为例：有吏部、礼部、兵部、刑部、户部、工部等六部，下辖吏部、主爵等24司。六部尚书都以所在“部”为名，而郎官以所在“司”为名。负责执行诏令。
相当于现在的国务院，主要为权力执行机构。
3.门下省：门下省”为官署名称。东汉时即设侍中，秩比二千石，属于少府，职掌为侍从皇帝左右、赞导众事、顾问应对，皇帝外出，则侍从参乘。
门下省原为皇帝的侍从机构，南北朝时权力逐渐扩大，北朝政出门下，成为中央政权机构的重心。隋唐时与中书省同掌机要，共议国政，并负责审查诏令，签署章奏，有封驳之权。
其长官称侍中，或称纳言、左相、黄门监，皆因时而异。其下有黄门侍郎、给事中、散骑常侍、谏议大夫、起居郎等官。
明清时期都察院和六科廊合称科道，拥有大部分门下省的权力。
相当于现代的全国政协，最高人民法院，最高人民检察院，监察委等单位的合体。
以上三个机构，合称三省。
4.内阁：内阁的诞生，主要是伴随着朱元璋废除宰相制度的产生，因为皇帝的精力有限，明朝以前有宰相帮忙辅佐政务，明朝后，内阁的产生实际上是填补了宰相职能空缺。明朝内阁是明朝建文四年（1402年）至崇祯十七年（1644年）的皇帝咨政机构，此后权力逐渐增大，后形成为明朝行政中枢。内阁辅臣的人数为一人至七人不等，辅臣奉使出外办事，多自称阁部。
起初，内阁大学士只具有顾问身份，皇帝为最终决定的权力，而大学士很少有参决的机会。到明仁宗、明宣宗时期，地位日益受尊崇。自此，内阁的权力日益增大，到明世宗中叶，夏言、严嵩等人执掌内阁，地位赫然为真正的宰相，亦可压制六部。
然而，虽然首席内阁大学士（或称内阁首辅）有票拟的权力，但却不得不依赖于内部太监送达批红[1]。首辅大学士的职权如同以往的丞相，但必须与宦官合作，才能执掌大政，如张居正结合冯保。
相当于现在的国务委员以及中共中央政治局常委。
5.军机处：军机处是清朝官署名，也称“军机房”、“总理处”。是清朝时期的中枢权力机关，于雍正七年（1729年）因用兵西北而设立。雍正帝以内阁在太和门外，恐漏泄机密，始于隆宗门内设置军机房，选内阁中谨密者入值缮写，以为处理紧急军务之用，辅佐皇帝处理政务。雍正十年（1732年），改称“办理军机处”。设军机大臣、军机章京等，均为兼职。乾隆帝时期复设军机处，从此成为清朝的中枢权力机关，一直到清末。
军机处总揽军、政大权，成为执政的最高国家机关。完全置于皇帝的直接掌握之下，等于皇帝的私人秘书处。同时，军机处在权力上是执政的最高国家机关，而在形式上始终处于临时机构的地位。
另外，军机处在办公场所和官员设置上没有正式的规定，也无品级和俸禄。需要强调，军机处虽然是国家最高权力机构，但归根结底听命于皇帝，成为封建皇权的统治工具。宣统三年（1911年）四月责任内阁成立后军机处被撤销。
军机处和内阁区别在于军机处没有实权，而内阁是拥有实权的权力机关。清朝时期的内阁制度沿袭了明朝，到康熙年间才确立，雍正执政时期，为了避免内阁权力过盛，威胁到皇权，就设立了军机处，但军机处只是听从皇帝指令的机关。
相当于现在的中央军事委员会。
6.上书房行走：上书房行走，实际上就是清朝时候皇子、皇孙师傅的副手。
清代把不设专官的机构或非专任的官职称为行走，故称其为上书房行走。其既非正式官名，亦非额设职官，只是一种差使，其编制仍在原供职衙门，俸禄待遇及升迁转补也按原衙门品级及俸次。
相当于现在的国务院的一个文书或者科员。
讲完您列举的几个官职，我再重点跟您说说与三省制度相配合的六部制。
三省在中央的名称一直有所变化，直到明朝彻底废除，三省的职能全部并于内阁及都察院，而六部一直到封建王朝结束都存在。
吏部
中国古代官署。吏部掌管全国官吏的任免、考课、升降、调动等事务。下设四司：明清为文选清吏司、验封司、稽勋司和考功司。司的长官为郎中，副长官为员外郎，其属官有主事，令史，书令史等。文选清吏司掌考文职之品级及开列、考授、拣选、升调、办理月选。验封司掌封爵、世职、恩荫、难荫、请封、捐封等事务。稽勋司掌文职官员守制、终养、办理官员之出继 、入籍、复名复姓等事。考功司掌文职官之处分及议叙，办理京察、大计。
相当于中央组织部，以及部分纪委的职能。
户部
户部，中国古代官署名，为掌管户籍财经的机关，六部之一，长官为户部尚书，曾称地官、大司徒、计相、大司农等。明清时期户部掌全国疆土、田地 、户籍、赋税、俸饷及一切财政事宜。其内部办理政务按地区分工而设司。各司除掌核本省钱粮外，亦兼管其他衙门的部分庶务，职责多有交叉。
相当于民政部、财政部、国土局及央行的结合体。
礼部
中国古代官署。南北朝北周始设。隋唐为六部之一。历代相沿。长官为礼部尚书。考吉、嘉、军、宾、凶五礼之用；管理全国学校事务及科举考试及藩属和外国之往来事。礼部下设四司，明清皆为：仪制清吏司，掌嘉礼、军礼及管理学务、科举考试事；祠祭清吏司，掌吉礼、凶礼事务；主客清吏司，掌宾礼及接待外宾事务；精膳清吏司，掌筵飨廪饩牲牢事务。
相当于教育部、文化部、外交部的结合体。
兵部
官署名。隋始置，六部之一，掌管选用武官及兵籍、军械、军令等。源于三国魏五兵制。曹魏始置五兵（中、外、骑、别、都）尚书，另有有关军事的驾部、车部、库部等曹。各曹设郎。隋始合为兵部，以尚书为主官，侍郎为次官。迄至清末，历代沿袭，职权则不尽相同。宋、辽、金、元兵部不辖兵政。明代兵部尚书号为“本兵”，权最重，凡武卫官军选授简练，均为其掌。清光绪三十二年（1906年），废兵部，改设陆军部。
相当于现在的国防部。
刑部
中国古代官署。主管全国刑罚政令及审核刑名的机构。隋文帝定六部制度，初沿北齐置都官，主官为尚书；次官，炀帝定为侍郎。后代均以刑部掌法律刑狱，与最高法院性质的大理寺并列。明清两代，刑部作为主管全国刑罚政令及审核刑名的机构，与督察院管稽察、大理寺掌重大案件的最后审理和复核，共为“三法司制”。刑部的具体职掌是：审定各种法律，复核各地送部的刑名案件，会同九卿审理“监候”的死刑案件以及直接审理京畿地区的待罪以上案件。
相当于司法部、公检法部门的结合体。此外，明清还设有大理寺和都察院，前者主要职责是复核刑部准备判处死刑的案件，后者负责对审判机关、百官进行监督，又有监察委的职能。
工部
中国封建时代中央官署名，为掌管营造工程事项的机关，六部之一，长官为工部尚书，曾称冬官、大司空等。工部起源于周代官制中的冬官，汉成帝置尚书五人，其三曰民曹。后汉以民曹兼主缮修、功作、盐池、园苑之事。西晋以后置田曹掌屯田，又有起部掌工程，水部掌航政及水利。后周依《周官》，置冬官府，长官为大司空。隋代开皇二年始设立工部，掌管各项工程、工匠、屯田、水利。
相当于建设部、水利部的结合体。
开始的时候，六部叫做六曹，即六个办事机构。六部的长官为尚书。六部的设置成为后代封建国家中央政权的固定制度。
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