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最影响黑衣组织的并不是小五郎,而是柯南。
无论是剧场版还是电视版,小五郎很多时候没有参与到破解黑衣组织的案件中,倒是柯南,能判断出是否是黑衣组织所为。
以剧场版《纯黑的噩梦》为例,在最后的对决里,小五郎只是在现场躺在车里睡觉,琴酒他们根本不能在泱泱人群中发现小五郎。与柯南一起的还有赤井秀一与安室先生,这些人才是黑衣组织的对手。
虽然柯南寄宿在小五郎家,但小五郎和柯南共同面对琴酒的次数很少,而且柯南也不是单独行动,这就让琴酒对这个小孩没有什么怀疑,从而不在意小五郎,毕竟小五郎没有什么威胁。