1. 急性腎炎 當過敏性紫癜性腎炎發生於皮疹已經消退時要與急性腎炎相鑑別。此時追問病史，包括回顧皮疹形態、分佈、關節和胃腸道症狀有助於本病的診斷。缺乏上述症狀，早期有血清補體降低有助於急性腎炎的診斷。必要時可做腎活檢做鑑別。
2. Coodpasture綜合症 當過敏性紫癜性腎炎常伴有出血、咳血時應注意與此病鑑別。由於本病有典型的皮疹和關節炎，胃腸道症狀。血清IgA增高等，鑑別並不困難，必要時做腎活檢，兩者有截然不同免疫熒光表現，Coodpasture綜合症免疫熒光為典型的IgG沉積。
3. 狼瘡性腎炎 由於系統性紅斑狼瘡可有皮疹、關節炎和腎損害，應該與此病鑑別，但兩者皮疹形態和分佈上均有顯著區別，診斷並不困難。兩者腎活檢有不同之處，如免疫熒光檢查，狼瘡性腎炎雖然也有IgA沉積，但常有大量的其他免疫蛋白沉積，且有C1q沉積，腎小管毛細血管壁白金環樣變也有助於鑑別。兩者皮膚活檢也不同，狼瘡性腎炎可見狼瘡帶，而過敏性紫癜性腎炎可見IgA沿小管壁沉積。
4.多動脈炎 此病臨床上類似過敏性紫癜性腎炎，但血清IgA多不增高，皮膚與腎活檢也無IgA沉積，免疫熒光除纖維蛋白外均為陰性，見於5~15歲兒童。
5. IgA腎病 在臨床上與過敏性紫癜性腎炎不同，但組織性檢查卻十分相似，均可有皮膚小血管IgA沉積，近幾年有報道僅有的區別是過敏性紫癜性腎炎在腎組織上常存在單核細胞和T淋巴細胞，而IgA腎病腎組織卻無此類細胞。
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