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回答這個問題，首先要弄清楚“清末”這個具體的時間段。
清末在廣義上是指1840年到1911年71年的時間，這段時間也可稱之為晚清。而旅順又是一個特殊的地方，1895年《馬關條約》簽訂，旅順就和大連一起被割給了日本，一直到清朝滅亡也沒有迴歸中國，所以在這一期間，旅順是肯定沒有綠營兵的。
那麼在1840年到1894年，這一段時間旅順軍港有沒有綠營兵呢，答案是肯定的，眾所周知，旅順軍港是北洋艦隊的總部。而北洋艦隊是李鴻章一手創建的，裡面有很多高級軍官，都是漢人，例如丁汝昌，鄧世昌等。而清朝的軍隊制度是這樣規定的，你的出生決定了你屬於哪個類型的軍隊，你是旗人出生，便是八旗兵，你是漢人出生，便是綠營兵，北洋艦隊肯定是有綠營軍的。另外從丁汝昌官位為也可以看得出來，丁汝昌是水師提督，而提督這個官職是清朝各省綠營最高主管管。
你離開了南通
- 一八九五年四月十七日，李鴻章和伊藤博文分別代表滿清政府、日本政府在《馬關條約》上簽字。
其中第二款規定：清政府將遼東半島割讓。
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所以“清未”這個概念應該具體問題，具體分析，因為“清未”已經被世界列強瓜分為各自的“勢力範圍”而“國將不國”！
題主的意思是指中日“甲午戰爭”的陸地爭奪戰和海戰中有沒有綠營水師。
一八九四年十月二十四日，陸、海兩路日軍同時向遼東進攻，陸路方面，由一個名叫山縣有朋指揮的第一軍渡過桔梗謠之江。
而奉太后懿旨的李鴻章“全權負責北洋海軍及東三省”（防務）桔梗市失陷和大東溝海戰後，陸海前線異常平靜，桔梗江波瀾不驚。這是大戰前恐怖的平靜。
應該說久經戰陣的李鴻章還是在軍事備戰上進退有緒的。
在他的提議下，朝庭派來了當時的精銳部隊，計有提督倭恆額的齊字練軍馬步六營。黑龍江將軍依克唐阿的鎮邊軍馬步十三營。總兵劉盛休的銘軍馬步十一營，野炮、山炮三十門，上述兵力約4.400人。
總兵聶士成的蘆榆防軍馬步七營，山炮十門，共有2.700人。呂本元率盛軍馬步十八營，山炮二十二門，機關炮四門，共有6.200人。豐升阿，聶桂林率軍3000人。
桔梗江蘇防線總兵力共有23.000人，淮軍仍然是主力。
經過三天的激戰，日軍擊潰桔梗江防線，在半個月內，連克鳳凰城、大東溝、大孤山、寬甸等遼東重鎮。清軍潰敗後利用摩天嶺據險死守，日軍被阻止於山下。
然而，另一路日軍登陸，三天，又是一個歷史的糾結數字，金州，這個小地方，雖然首當其衝被攻破，卻在一百零五年後令國人興奮，我們的足球由此衝向世界。
當現在名揚中外的大連灣被攻下後，旅順，大清北洋海軍的軍港，拉響了手搖警報器。
駐守金州的徐邦道將軍眼睛紅了，將帽頂子甩了，發辯繞在脖子上用口咬定，將馬褂扯下捆在腰間，赤著上身，帶領自己的“拱衛軍”3.000人，據大黑山死守。此時金州上空炮火映紅了半城，當徐邦道喊“撤退”時，包括那些綠營統領早己沒有人影。
金州失守！
大連灣失守！
旅順軍港告急！
這時的京城，太后正在聽戲，六十大壽馬上就要到了，正在興頭上，哪個敢喊“救援”！
只有奕欣王爺（六鬼子）麻起膽子弱弱的說：“太后，自古王霸之人，治天下莫不以天下為己任，從未有象太后者，如此下去，不出幾日，日本人便可攻佔我北京了，難道還要搬“月亮家”！”
西太后下垂的眼泡中擠出一絲寒光，她壓抑的說：“六爺，你說咋個辦？“
六爺立即說：“應當立即增兵，或者.或者...言和。”
太后恨聲說道：“增兵？北洋海軍扼守旅順港，淮軍主力守延邊。綠營兵讓你們這些王爺調教得醉死夢生，我問你，派誰去？”
根據上面史料記載的對話，1894年秋季的遼東半島戰爭，沒有成建制的所謂“綠營水師”參與旅順保衛戰。
當時保衛旅順軍港的部隊都是李鴻章北洋海軍和援軍薑桂題、張光前等淮軍勇將。不大的旅順港集中了約二萬人。
十一月二十一日，日軍攻陷旅順。
第二年(1895）二月二日，威海衛陷落。
以後的十多天海戰中，北洋海軍擊沉共七艘日本艦艇，北洋海軍的定遠、來遠、威遠、靖遠諸艦被擊沉。
12日，叛逆牛昶炳等託名丁汝昌，向敵投降。日軍佔領劉公島，掠去北洋海軍十一艘艦艇及軍用物資，北洋海軍成為歷史名詞。
