牛磺酸廣泛存在於哺乳動物、鳥類、魚類和水生無脊椎動物的組織細胞內。有研究發現，牛磺酸不僅具有良好的誘食效果，而且能夠提高機體內各種消化酶的活性。此外，牛磺酸還具有促進動物生長和調節機體滲透壓等作用，作為飼料添加劑已在養殖業中得到大規模的應用。
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作為誘食劑
牛磺酸可作為魚蝦類誘食劑。牛磺酸可以顯著提高海鱸的攝食量。飼料中添加適量的牛磺酸能夠提高虹鱒的攝食量。一定量的牛磺酸可以顯著提高鰤魚的攝食量。牛磺酸對歐洲鰻魚、草魚幼魚、北極紅點鮭和河鱒等也有很好的誘食效果。
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提高生長性能
EM菌在水產養殖中的使用效果被廣泛認可。但是EM菌發酵好的原液使用起來成本較高，而且經過廠家經銷商長時間儲存，菌的活力也會下降。近幾年市場上比較受到養殖戶歡迎的是EM菌菌種。養殖戶購買回去後可以自己擴培。自己發酵的EM菌菌液使用起來成本低，而且現發酵的的菌液數量多活性好。那麼在選擇EM菌菌中的時候大家要關注菌種的好壞。一般而言，判斷菌種好壞有一個最簡單的指標pH值。因為EM菌種的乳酸菌含量最多，EM菌菌液的pH值較低說明乳酸菌含量豐富，也就意味著整體的EM菌活性較高。一般而言pH值在3.5以下就算是好菌種，如果可以達到3以下就算是質量特別好的EM菌種了。
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提高消化酶的活性
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提高抗缺氧能力
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調節滲透壓
牛磺酸被證實是海洋魚類（尤其是洄游魚類）維持和調節滲透壓的重要物質，對魚體細胞膜、心臟、肝、腸道、中樞神經和骨骼肌等組織起滲透壓調節作用。有研究報道，餌料中添加0.03、39.90、52.80和71.60mg/g牛磺酸，可以顯著改善黃尾魚血清滲透壓和組織滲透壓。
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增強機體免疫力
牛磺酸可以通過提高動物機體內超氧化物歧化酶和溶菌酶的活性來增強機體的免疫能力。牛磺酸是肝合成膽汁的重要原料之一，當其缺乏或含量不足時，肝分泌膽汁將減少，導致綠色肝綜合症的發生，降低機體免疫力。有研究表明，牛磺酸能夠提高黃顙魚體內溶菌酶的活性以增強機體免疫力。
補鈣的產品有非常多品種。例如離子鈣、有機鈣和無機鈣等。各種鈣都有不錯的效果。但是，如果將上述鈣加工為可溶於水的乳化鈣，就更容易溶入水，有利於小龍蝦、螃蟹和南美白對蝦等水產動物的吸收，同時還可以拿來拌喂飼料，補鈣效果更好，迅速幫助硬殼。
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提高抗氧化性能
牛磺酸能夠提高機體組織細胞膜的抗氧化性，同時可以與體內強氧化劑和自由基結合阻止氧化還原反應，從而保護動物免遭氧化傷害。有研究表明，在日糧中添加適量的牛磺酸可以提高歐洲鱸魚的抗氧化性能，提高歐洲鱸魚前腸中過氧化氫酶的活性。在高脂飼料中添加700～1200mg/kg牛磺酸可顯著提高草魚幼魚的抗氧化能力。在飼料中添加適量的牛磺酸能夠顯著提高泥鰍肝的抗氧化性能。在基礎飼料中分別添加1000、2000和3000mg/kg牛磺酸，製成飼料，投餵異育銀鯽8周，魚體內過氧化氫酶和谷胱甘肽過氧化物酶含量顯著增加。牛磺酸能夠顯著降低石首魚肝的氧化損傷。
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調節機體內分泌
牛磺酸在動物內分泌系統中起著重要作用，可以作為神經調節劑，影響下丘腦－垂體激素的分泌水平。有研究表明，牛磺酸能夠作為抑制劑，抑制催產素和血管加壓素的分泌，也可作為刺激物質，刺激促性腺激素釋放激素和促黃體素的分泌，同時牛磺酸對生長素的分泌也具有調節作用。
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提高機體穩定性
有研究報道，牛磺酸可以通過影響caspase－1/NF－κB/JNK/p38途徑來調節過敏性炎症反應，同時還可以抑制過敏性炎症反應。牛磺酸可以降低多芳烴對虹鱒魚肝的損傷。牛磺酸可以緩解鯽魚因高氨帶來的生理紊亂。
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牛磺酸在水產應用中存在的問題
牛磺酸在水產養殖中的應用前景廣闊，但有些問題仍需要解決。首先，在不同水生動物及其不同生長階段，對牛磺酸的需求量是不同的。其次，牛磺酸與飼料中其他營養成分是否會發生協同和拮抗作用，目前尚無研究報道。第三，現階段牛磺酸在水產中的應用研究範圍主要集中在海水魚類，淡水魚類的研究較少。第四，養殖期間是否會殘留在動物體內，同時體內殘留是否會對動物機體產生不良影響尚不明確。
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