2020年2月26日，韩国首尔，为防止感染冠状病毒，一名妇女戴着口罩急匆匆地走过传统市场，在她身后，一家消毒服务公司的员工正在消毒。
摄影：KIM HONG-JI, REUTERS
2020年的今天，全球正在遭受着，又一波恐怖的传染病，而且在以惊人的速度，从中国，再到全球的蔓延，回想我们人类过去的几万年的发展历程，从古代轻易就毁掉一个村的瘟疫，到后来的天花病毒，只是一个欧洲，就死了5亿人！要知道，当时的世界总人口也就17亿左右，这一下，都快死了三分之一的人了。
我们人类的历史，一直说是一部侵略和被侵略的战争史，成王败寇，就像中国的抗日战争，直接改变了中国和日本的关系和命运。但今天我想说的是，病毒同样改变了人类的文明进程，有一个人因为战争而死，就会有两个人因为患病而死。
今天，想从进化的角度，尤其是病毒进化的角度，来看看它对我们人类的影响和改变。
01
首先，还是要和大家再介绍一下病毒。
我还是最喜欢邴钟兴老师的比喻，它把病毒比喻成，我们日常的费列罗巧克力，别说，还真的很形象。
外面的花生仁就是病毒的蛋白质外壳，里面咬开，会有一颗杏仁，就是病毒里最重要的物质，遗传物质，可以是DNA，可以是RNA，甚至有些病毒根本没有遗传物质，它只不过是一层蛋白质外壳，也可以帮助他们进行侵染。这就是病毒的构成。
以下这些都是不同形态的病毒。
那病毒的存在，和地球上所有的物种一样，只有一个目的，存活下去。
因为我们前面说到，病毒结构其实超级简单，它只有遗传物质核酸（DNA或RNA），有些甚至都没有，外面再加一个蛋白质衣壳，所以病毒是无法独立进行代谢和生长，它只能利用由感染的机制，进入宿主，利用宿主的细胞系统进行自我复制。
同时，它也借助宿主细胞代谢产生的能量才能生存和增殖，所以如果宿主死光了，病毒也就完蛋了。
病毒就是要通过这种方式老延续自己的基因，病毒和宿主的关系有些类似捕食者和猎物，前者依赖于后者存活。两者的数量变化会呈现出先增先减、后增后减的模式，形成一个循环：
病毒出现→宿主减少→病毒减少→宿主增多→病毒增多，实现动态平衡。
而这个平衡一旦被打破，要不就是我们人类死亡，要不就是病毒被消灭。
比如：大名鼎鼎的天花病毒，就是这样被灭掉的。爱德华·琴纳医生从挤奶工的身上得到启发，发明的牛痘接种疫苗并大范围普及，让天花病毒，成为了首个被人类战胜的病毒。
02
那么，在病毒依赖宿主生活这样的一个模式下，我们为什么会死亡呢？
这就是我们人类，或者说是所有物种的一个自私的“自我保护机制”在起作用了。
每种生物的基因都希望自身永久延续，宿主不想把能量白给病毒用，更不能容忍病毒在细胞内增殖，就动用免疫系统对付病毒了，最常见的就是炎症。而病毒为了确保自己能安全借宿，也会表达一些毒蛋白对付宿主，使免疫机制不能正常运行，直至细胞裂解、凋亡。
宿主死于病毒感染，一部分是病毒表达的毒蛋白直接导致的，也有一部分是宿主过激的炎症造成的。
炎症非常厉害，不仅消灭病毒，也消灭被病毒感染的细胞，如果炎症反应以严重损害机体为代价仍没有消灭病毒，那么病毒卷土重来或者发生继发性细菌感染，就能要了宿主的命。
而我们所说的野生动物，比如蝙蝠的免疫机制就比人类要聪明的多。
蝙蝠的炎症是被削弱的，它不指望彻底灭了病毒，只要抑制住病毒过度增殖就可以了。而且蝙蝠细胞内干扰素水平日常就非常高，即使病毒表达的毒蛋白破坏了一部分干扰素，剩下的也足够抑制病毒了。
正因为如此，蝙蝠才能携带如此多的可怕病毒而不生病，有埃博拉病毒、马尔堡病毒和多种冠状病毒等。
蝙蝠并非百毒不侵，它只是经过长期演化已经适应了这些病毒而已，它感染外源性病毒也会生病的，比如狂犬病毒。
03
病毒的终极进化
《进化论》达尔文认为，生物之间存在着生存争斗，适应者生存下来，不适者则被淘汰，这就是自然的选择。生物正是通过遗传、变异和自然选择，从低级到高级，从简单到复杂，种类由少到多地进化着、发展着。以上三点，即是我们常听到的"物竞天择，适者生存"，现代基因学的诞生，为此提供了重要的证据，事实上，物竞天择，竞的是"基因"。
这次新型冠状病毒肺炎，很多科学家培育毒株，来研制攻克病毒的疫苗，为了尽快结束这场灾难。但是，病毒的变异速度太快了，尤其是像RNA病毒，可能疫苗刚做好，病毒就已经大面积转移变异了。
当地时间3月2日，中国医学科学院北京协和医院、中国疾控中心、加州大学洛杉矶分校、匹兹堡大学、湖南大学五家合作单位的研究人员共同在生物科学预印本网站bioRxiv在线发表了一项针对新冠病毒演化过程中的突变、重组和插入的重磅研究（“Mutations, Recombination and Insertion in the Evolution of 2019-nCoV”）。
研究通过分析病毒的突变，解释新冠病毒为何传染性能显著增强。
人类新冠病毒（2019-nCoV）和蝙蝠RaTG13病毒蛋白之间的差异在2005年至2012年之间已经开始出现点突变。同时新冠病毒，还在不停的发生重组。
结果表明，2019-nCoV的S蛋白可能从穿山甲冠状病毒衍生出来，而不是蝙蝠冠状病毒RaTG13。而在2019- nCoV的进化过程中，RaTG13样冠状病毒和穿山甲样冠状病毒病毒株之间可能发生了重组。
而这些证据，也许可以解释新冠病毒相比SARS、MERS相关的β冠状病毒传染性显著增加的原因。
就像之前有部电影《感染》里的一样，病毒发生重组，感染和死亡人数惊人。
经过几千万年的自然选择，病毒与蝙蝠和平共处，这就是最终进化形态了吗？还不是。
有一类病毒叫内源性病毒，它直接整合到宿主的基因组中去了，建立终身感染，随着宿主基因复制而复制，并遗传给子代。
这类病毒不会对宿主产生任何危害，宿主也完全接纳它了。
内源性病毒是一类逆转录病毒。有细胞生物的遗传物质都是DNA，DNA转录成RNA，再翻译成蛋白质，参与代谢活动。内源性病毒的遗传物质是RNA，它有两个酶特别厉害，逆转录酶把RNA逆转录成双链DNA，整合酶负责将双链DNA整合到宿主基因组中，形成沉默的原病毒，潜伏在细胞中。
多数内源性病毒已经因基因突变而失活，无法再重新组装成病毒了，事实上它们也不需要再组装了。
有的内源性病毒甚至在宿主细胞内承担一定功能，成为了转座子。
转座子是一类特殊的基因序列，又叫跳跃基因，可以单独复制或断裂成环，对后续基因表达起重要调控作用。
人类DNA有5~8%来自病毒
本质上，生物的繁殖演化，只是一些DNA排列组合不断演变而已，其实 生物在利用病毒的DNA来帮助自己演化，这是很常见的事情。
比如说，这段基因导致这个生物死去，它就失败了，但是其他留下来的生物，从进化论的角度，它获得了更有利于繁殖后代的能力，同时也把改造过的基因传递下去。
所以，为什么说病毒，推动了人类的进化进程。在人与病毒的几万年的纠葛中，我们随时有可能会挂掉，我们人类一直都是在与病毒不断博弈的过程中，不断获得新的认识。
我们知道的都是一些已知的病毒，我们见过它才能提供正确的治疗方法去消灭它，但是遇到了未知的病毒，就像这次新型冠状病毒，我们对它一无所知，虽然它很像是SARS，但它对 科学家、医生的考验非常强大。
怎么样在最短的时间里研制出正确的解药，如何在最短的时间内降低死亡率，这都是对医生、对医疗体系一次严峻的考验 。
生物进化虽然是有方向的，由自然选择决定，但进化永远不以生物体意志为转移。
进化从来不是美妙的，这其中要有大量的不适者被淘汰，有可能就是我们人类。请问谁愿意做这个被病毒淘汰的不适者？未来病毒会朝着什么方向去进化？他的感染力和致病力又会怎样？我们又将经历什么大型感染？我们无从得知。
因此，虽然病毒不想消灭我们，我们一定要消灭病毒。
这必将是一场持久战，敬畏生命，敬畏病毒，加油，人类！
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