活性生物製劑不會產生象抗菌素一樣的毒副作用，活性生物製劑利用細菌之間的拮抗作用，以優勢的有益菌群抑制有害菌群的繁殖，通過有益生物菌來淨化水質和改良底質。示範戶在養殖過程中，合理使用活性生物製劑，能夠有效降低南美白對蝦發病率，降低養殖示範戶養殖風險，提高示範戶養殖效益，南美白對蝦養殖過程中主要使用以下幾種微生物：
（一）、生物製劑的功用
1、光合菌群：淨化養殖水體，提高水質。
2、乳酸菌群：乳酸菌具有很強的殺滅病菌能力，抑制致病菌活動，有害線蟲也逐漸消失。
3、酵母菌群：利用氨基酸、糖類及其它有機物質，產生促進其它有效微生物增殖所需要的基質，提供給養保障。
4、放線菌群：產生各種抗生物質，可以直接抑制病原菌。並創造出其它有益微生物增殖的生存環境。放線菌和光合細菌組成混合，其淨菌作用會成倍增加。另外，被放線菌分解的物質容易被動物吸收，從而增強動物對各種病害的抵抗力和免疫力。
5、醋酸桿菌：它從光合細菌中攝取糖類固態物，一部分還給光合細菌，形成好氣性和嫌氣性細菌結構的共生態。
6、枯草芽孢桿菌：屬於強有機質分解菌 ，能切斷小分子氨、阻斷H2S產生途徑；硝化小分子的氨類,調節水體的菌相平衡和藻相平衡。徹底淨化水質。
芽孢桿菌的作用已被公認。但是，我們在使用時經常發現不同的產品會有不同的效果。有的產品用量少效果好，有的即使大量使用也不見效。為什麼呢？因為微生物製劑核心技術在於菌種的好壞和菌種的數量。很多養殖戶誤認為重量多數量就多。其實並非如此，先進的發酵技術和製劑技術可以使每克產品中的菌總數量達到500億以上。一般的小廠家受制於技術和設備的制約很難達到。同時菌種的好壞更是決定了產品的使用效果。芽孢桿菌是帶有孢子的桿菌總稱，芽孢桿菌的種類多達上百種。有的適合人類腸道，有的適合水質改良，有的適合垃圾處理。也就是說並不是所有的芽孢桿菌都適合水產養殖。因此，建議大家在選擇產品的時候選擇高含量的產品，因為只有大廠家才能做出高含量的產品，同時他們也會在菌種庫當中選擇適合水產養殖的菌種進行生產。
（二）、生物製劑的作用：
（1）利用細菌之間的拮抗作用，以優勢的有益菌群抑制有害菌群的繁殖，通過有益生物菌來淨化水質和改良底質，從而達到防病治病的目的;
（2）使水體的微生態得到平衡，有利於蝦、蟹及魚類的健康生長;
（3）能分解蝦類的殘餌、排洩物及水中或池底其它有機物或無機物，尤其是能快速分解NH3、NH4+、NO2-、 NO3-、H2S等對蝦類生長有害的物質，使水質得到改善;
（4）由於有益菌除了含有蛋白質、B族維生素、生物素、葉酸外，還含有大量的促生長因子、輔酶Q10和抗病毒物質，因此能提高蝦的免疫能力，增強蝦對病害的抵抗力，達到防病和治病的 目的。
（三）、生物製劑使用方法用10mg/L的生物製劑連續全池潑灑，10-15天為一療程。
（四）、生物製劑使用注意事項
（1）先用含氯消毒劑處理水質，殺滅有害細菌，2-3天后再用10mg/L生物製劑 改良水質；
（2）使用生物製劑之後不久就潑灑消毒劑將會造成失效；
（3）大量換水之後應補充潑灑生物製劑；
EM菌在水產養殖中的使用效果被廣泛認可。但是EM菌發酵好的原液使用起來成本較高，而且經過廠家經銷商長時間儲存，菌的活力也會下降。近幾年市場上比較受到養殖戶歡迎的是EM菌菌種。養殖戶購買回去後可以自己擴培。自己發酵的EM菌菌液使用起來成本低，而且現發酵的的菌液數量多活性好。那麼在選擇EM菌菌中的時候大家要關注菌種的好壞。一般而言，判斷菌種好壞有一個最簡單的指標pH值。因為EM菌種的乳酸菌含量最多，EM菌菌液的pH值較低說明乳酸菌含量豐富，也就意味著整體的EM菌活性較高。一般而言pH值在3.5以下就算是好菌種，如果可以達到3以下就算是質量特別好的EM菌種了。
（4）當養殖池中的生物製劑生物活性下降時應予以更新。（10-20天）視具體水體條件而定，方法同前；
（5）使用生物製劑必須有一定的濃度才有效，而且必須在蝦苗發病前堅持使用才有好的成效；
（6）水溫低於18 ℃時效果不佳。
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