清朝顺治皇帝的死因，是中国历史上的重大悬案之一，清室记载对此避而不言。 2004年4月20日，郑成功后人首次公布家传手抄本《延平王起义实录》，为顺治之死提供了又一种说法，而且是最耸人听闻的说法——顺治皇帝于1661年2月被郑成功一炮轰毙于厦门港。 史学界因此掀起轩然大波，众说纷纭。是真是假，谁也拿不出无懈可击的证据，成为迄今仍无法定案的历史之谜。
▲顺治帝是满清入关后的第一位皇帝
1661年2月，清朝派大将军达素集中广东、福建、浙江3省兵力攻打厦门郑成功的军队。经过激烈战斗，海门、高崎、钟宅3路清军都被郑成功军队击退。虽然没有任何正史提及顺治皇帝参与此次南征，但郑成功后人的《延平王起义实录》手抄本却披露，顺治正是在这次战役中被炮击身亡。在这份手抄本复印件里，与之相关的共有3部分：
第一部分为：“有人密启藩主以高崎之战伪帝顺治实在思明港被炮击没，达素秘密而不敢宣，及京中查无下落，召达素回京，达虏惧罪自杀。至是太子即位，宣顺治于正月崩者，伪虏之伎俩也。藩曰：余亦计之，但当时恍惚未敢再信。”即：有人密报郑成功，顺治皇帝是在厦门思明港被炮轰而死的，大将军达素不敢公布这一消息，京城中查不到顺治的下落，召达素回京，达素畏罪自杀。后太子即位，宣布顺治驾崩，这是朝廷掩盖的手段。郑成功说：“我也意识到了这点，但当时觉得恍恍惚惚，不敢相信。”
第二部分为：“初太师在京屡以书谕藩招抚。藩不肯，然虏顺治亦不之罪也。至是顺治崩，执政者与太师有隙，遂对虏太子谏以藩能击崩主父，我皇岂不能杀害其父乎。虏太子纳之，至是新即位而太师遂遇害。”文中所说太师即南明太师郑芝龙降清后，初到北京时，屡次写信劝郑成功投降都以失败告终，但顺治只是将他软禁，没有治罪。顺治死后，辅臣苏克萨哈与郑芝龙有仇，向太子建议“：郑成功可以用炮击死我们的先皇，皇上难道就不能处死他的父亲吗？”太子采纳了他的意见，即位不久后，郑芝龙就被处死。
第三部分为：“报伪朝顺治崩，太子即位，是为康熙。藩喜曰，伪朝大丧，且达素新败，虏必无暇南顾矣，我当速取公夷为根本地，然后再图北征。”该文的大意解释了郑成功攻台时机的选择，说清廷顺治皇帝驾崩，太子即康熙皇帝登基，郑成功方大喜，清廷处于大丧期间而且达素新败，清廷根本无暇南顾，郑成功可以乘机攻取台湾，作为根据地，然后作北征清廷的打算。这一点，虽未直接点出顺治死因新说，但“达素新败”“伪朝大丧”（郑氏政权的眼里，清朝为伪朝）也给支持新说者，提供了佐证。
▲《延平王起义实录》以日记形式记载了郑成功的一生
延平王是南明对郑成功的封号，《延平王起义实录》手抄本最早发现于厦门一郑成功后裔家中，由郑成功第9裔孙郑叔成抄于1912年。手抄本有278页，共计近8万字。全书以日记的形式进行记载，时间跨度40余年，涉及郑成功祖孙四代。郑成功研究专家、厦门郑成功纪念馆原副馆长张宗洽、中国社科院研究员刘小萌博士，福建省社科院历史研究所所长、研究员徐晓望和厦门大学台湾研究所副所长、研究员邓孔昭等专家学者曾对《延平王起义实录》进行鉴定，一致认为其提供的资料可信度较高。2012年3月，泉州明末遗臣王忠孝后人又拿出了3份证据，一份是明末遗臣王忠孝的文集，一份是蒙古族村《出氏族谱》，上面都有顺治帝死于厦门的文字。还有一份证据是一村落习俗顺治帝忌日祭祀祖先，证明清军与郑成功交战是在顺治十八年正月。
《出氏族谱》提及顺治被炮毙于厦门
《王忠孝》有关顺治被毙的文句
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