从微观层面来分析病毒在人类进化史中的作用，恐怕非常的难，但是呢，我们从宏观的视角来观察的话，会发现病毒真的改变了人类的生活。
新航路开辟之后，感染了天花病毒的印第安人
我们在日常生活中会发现一个奇怪的现象，人类会咳嗽、会打喷嚏，咳嗽和打喷嚏其实就是病毒诱导我们这么干的，人类患了普通的感冒、流行性感冒，都会咳嗽、会打喷嚏，这是病毒在利用人类的飞沫进行繁殖，诱使自己的宿主作出符合它们利益的动作，而这些动作我们人类自己是无法控制的，感冒了，如果故意抑制自己不咳嗽，那么，嗓子会感觉非常难受，咳出来才会感到舒服，打喷嚏更是如此，常常在不经意之间就打了一个喷嚏。人类感染了水痘病毒，皮肤还会痒，我们会不由自主地抓痒，抓痒的过程，就是水痘病毒进一步传播的过程，人类在近代以前是不知道病毒这种微生物的，感染了水痘病毒之后，皮肤会痒，为了缓解疼痛，还会叫别人给自己抓痒，这就有利于病毒传播到另外一个人的身上，这都是病毒为了自身的繁殖，而诱导人类做出一些符合它的利益的动作。人类感染了霍乱病毒，会腹泻，腹泻就是有利于病毒通过粪便和水源进行传播。因此，我们的身体其实不仅属于自己，还属于身上的微生物。我们不要误认为，我们可以控制我们自己的某些行为，例如咳嗽、打喷嚏、腹泻就是我们所不能控制的，我们身体上的微生物的数量超过了我们人体细胞的数量。
20世纪初西班牙流感发生期间，在美国，没戴口罩，不准上公交车
具有较长潜伏期的病毒，其实更聪明，它能够在潜伏期内不知不觉地进行传播，所以，病毒为了自身的繁殖，想出来各种办法。有些病毒，非常的凶猛，人体感染之后，很快就会发病，并且也会死亡，人类死亡之后，这些病毒也随之失去了“栖息地”而死亡，它们这样做，不是自取灭亡吗？这种“高度毒力”的做法，在有的时候对于病毒来说是有利的，它可以在不同的生物体之间传播，这个生物体死亡了，会有别的生物体感染，从长远来看，这种病毒是不会灭绝的。当然，高度毒力的做法有的时候对于病毒自身是不利的，假如病毒的目的就是把所有的细菌和多细胞动物都弄灭绝的话，那么，它自身也就失去生命力了，因为病毒自身是无法繁殖的。在长期的自然选择过程中，病毒有从“高度毒力”转换为“低度毒力”的趋势，以便于自己在宿主体内长期生活。病毒如果没有找到自然宿主，把所有的宿主都害死的话，它自己也会灭绝，宿主与病毒长期和平相处，这个宿主其实就是自然宿主。我们人类身上也有一些病毒，对我们是无害的，或者说它已经是我们身体上的微生物群落中的一个“物种”了。
病毒在人类身上是一种“寄生”的存在，但其实，它们并不是最大的“寄生虫”，人类身上最大的“寄生虫”其实是自己的胎儿，换句话说，哺乳动物身上最大的“寄生虫”就是自己的胎儿。胎儿的血型、基因与母亲是不一样的，免疫系统为什么不会攻击胎儿呢？要知道，我们的身体上一旦有异物入侵，免疫系统会就会攻击这些异物。免疫系统之所以不会攻击胎儿，是因为胎儿也欺骗了免疫系统。有的科学家认为哺乳动物进化出胎盘，就是因为哺乳动物的祖先感染了一种病毒而导致的，这种病毒把抵御免疫系统攻击的能力转移给了哺乳动物，并且落实到生殖功能上，这种情况的发生是有可能的，因为病毒可以进行“水平式”的基因交流。
分子生物学是从20世纪50年代开始发展起来的，因为我们人类对于分子层面的生命的结构与功能还知之甚少，所以，关于“病毒进化论”的一些说法，还有待于商榷，比如像哺乳动物进化出胎盘是由病毒感染而导致的结论，目前仍然缺乏确凿的证据。
那么，病毒在人类历史上扮演着什么角色呢？我们来举三个简单的历史事件：康熙皇帝之所以会登基，就是因为他感染过天花病毒，有了针对天花病毒的抗体，就不会再得天花了，如果不是因为天花病毒，也许就没有历史上的康熙皇帝了，这是病毒对历史的一个比较小的影响；新航路开辟之后，麻疹病毒和天花病毒还袭击了美洲大陆，印第安人因为没有抗体，而大规模死亡，从而使得欧洲人能够在很短的时间内征服整个美洲大陆，从这个意义上来讲，病毒也改变了地球上的人种分布；发生于1918年1月至1920年12月间的“西班牙流感”间接导致了第一次世界大战的提前结束，西班牙型流行性感冒在1918年春季首先在美国出现，之后传播到欧洲，当时的欧洲正处在第一次世界大战期间，西班牙流感在欧洲爆发之后，造成了一些青壮年的死亡，因兵源不足，各国被迫提前结束了第一次世界大战。
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