这部新的《黑凤凰》电影借鉴了原版漫画《黑凤凰传奇》的故事情节，故事情节在1976年至1980年神秘的《x战警》系列中慢慢展开。尽管这部电影给出了一个恰当的结局，但在漫画版的故事中，事情并没有那么简单。
《黑凤凰传奇》(Dark Phoenix Saga)是漫威漫画《x战警》(X-Men)系列故事中最具标志性、最受欢迎的一部，原因在于，它将漫威漫画团队的一名原成员设定为一个非常简单、非常史诗般的成长弧线:琴·格雷(Jean Grey)获得了近乎神一般的力量，最终却被它所毁灭，以至于她不仅背叛了自己的亲人，还犯下了种族灭绝的罪行，在导致一颗太阳变成超新星时，她杀死了一颗外星星球上的所有居民。最终，只有琴与生俱来的人性拯救了这一切，如果她不选择自杀重生，那她将有可能毁灭整个宇宙。
这个故事为粉丝们提供了一个机会，让他们可以在漫威或DC漫画中看到一个最受欢迎的角色展现了“绝对的权力会让人彻底堕落”的格言。谁能抗拒呢?
然而，这并不是最初的计划;作家克里斯·克莱蒙特(Chris Claremont)和艺术家约翰·伯恩(John Byrne)在《黑凤凰传奇》期间共同策划了《x战警》(X-Men)漫画系列。琴·格雷将会被外星人夺去能量，但仍然活着，他的想法是，这为未来黑凤凰的再次出现埋了伏笔。当时的漫威漫画总编吉姆·舒特并不喜欢这个想法，他要求重写，这就是“琴之死”作为最终结局的来源。
这是一个有意留下的结局，尽管克莱蒙特——他在《x战警》编剧的位置上又待了十年，在伯恩离开《黑凤凰》几个月后，他与许多艺术家合作——他在几个场合开心地调侃《黑凤凰》的回归，只是为了让粉丝血压升高。
1985年，《x战警》对漫威公司来说是如此的成功，以至于漫威为此增加了一个衍生游戏。原漫画团队计划推出一部名为《x因素》(X-Factor)的新漫画，讲述原漫画团队(野兽、独眼巨人、冰人、天使)重聚的故事。讽刺的是，在《黑凤凰传奇》第一集中引入的另一个变种超级英雄炫目者取代了已故的琴·格雷(Jean Grey)。
然而，约翰·伯恩有一个更好的主意:为什么不把琴·格雷从死亡中拯救出来，让原来的团队重新团结起来呢?严格地说，这不是他的主意;把琴带回来的灵感实际上起源于作家库尔特·布希克(Kurt Busiek)，当时他还是一名大学生，后来和作家罗杰·斯特恩(Roger Stern)分享了这个灵感，后者和伯恩分享了这个灵感。当时担任《神奇四侠》编剧兼艺术家的伯恩和《复仇者联盟》编剧的斯特恩一起向吉姆·舒特(Jim Shooter)提出了这个想法，后者也同意了。《X-Factor》也被列入了计划，推出了一套雄心勃勃的发行结构，整个三季都有一个故事，来恰当地解释琴·格雷(Jean Grey)是如何在所有人都看到她去世五年后依然健康地活着的。
在正式出版之前，舒特告诉漫威官方粉丝杂志《漫威时代》，故事情节“将成为漫威历史上一个真正的里程碑”。
《神秘x战警》不是《X-Factor》计划的一部分，这不是意外；琴·格雷的回归不仅破坏了《黑凤凰传奇》的高潮，实际上还破坏了《黑凤凰》最初出版时的整个故事情节。它认为，每个人都读到过的凤凰实际上根本就不是琴·格雷，而是凤凰力量本身创造的琴的克隆体；真正的”琴·格雷一直处于假死状态，直到她被《复仇者联盟》和《神奇四侠》发现。所有这一切都是在没有《神秘的x战警》编剧克里斯·克莱蒙特的参与下决定的——或者，事实上，是在不知情的情况下决定的。
当克莱蒙特发现后，他的第一个冲动是辞职以示抗议。(后来他声称，只因他记不住吉姆·舒特(Jim Shooter)的直拨电话号码，因此也没能辞职。)但是，他提出了替代方案但都被拒绝了。
然而，在决定出版《X-Factor》之后，不仅仅是琴·格雷的历史被改写了。该系列于1985年10月推出，克莱蒙特曾在《x战警》(X-Men)的第21期中，用《神秘的x战警》写出了斯科特·萨默斯(Scott Summers)，又名独眼巨人(Cyclops);他和妻子马德琳·普赖尔(恰好长得很像琴·格雷)以及刚出生的儿子一起离开了团队，进入了超级英雄的退休生活。在《x因素1》中，当萨默斯发现珍·格雷还活着时，他抛弃了妻子和孩子。
也许漫威没有人意识到，读者很难把一个抛弃家庭的男人视为一个特别的英雄人物，尤其是当《x因素》(X-Factor)对让马德琳或她的儿子出现在漫画中没有表现出什么兴趣时，他们更愿意看到斯科特·萨默斯自怜地说，“马德琳和孩子一直在我的脑海里，但我的生活被彻底颠覆了。”琴回来了。也许漫威的人在看到粉丝们的反应之前都没觉得这是个问题。不管怎样，我们必须做点什么来拯救斯科特·萨默斯。我们可以说，解决方案出乎意料。
马德琳最终出现在神秘的《x战警》中，就像斯科特·萨默斯决定回到他的家庭时，却发现他们失踪了。这是一个共同的故事情节的开始，一年多后，萨默斯发现马德琳·普赖尔实际上是由邪恶人创造的琴·格雷的克隆。更糟的是，她是一个克隆人，为了追求权力曾和一个恶魔做过交易，现在正打算牺牲她的儿子。
这是一个试图挽救萨默斯声誉的retcon——解决方案是琴·格雷吸收她的邪恶克隆人和凤凰城的假琴·格雷的记忆，并启动一系列事件，最终萨默斯的孩子会被送到遥远的未来，这样他就会成为凯布尔，所以我们只能说这个问题还没有定论。
by Graeme McMillan/小白翻译
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