諸葛亮在用人方面存在不少問題，用人的格局、手腕不如曹操、孫權、劉備。很多人說蜀漢後期人才凋零，但仔細數數，被諸葛亮冤殺、棄用的人才真是不少，組成一個獨當一面的軍團都綽綽有餘。李嚴和魏延都是能夠獨當一面的人，但在諸葛亮設計的組織架構中都成了輔助性的角色。魏延前期被劉備任命為漢中太守，還有一定的獨立性，等到諸葛亮坐鎮南鄭指揮北伐時，魏延已經降格為一個先鋒的角色了。
劉封是劉備集團中期成長起來的少壯派將領，也是劉備的養子。劉封先隨諸葛亮、趙雲、張飛的“二路兵團”進攻益州（當時二十餘歲），又隨劉備、法正進攻漢中，年紀不大，戰功不少。後來劉備派劉封配合孟達一起，攻佔上庸郡。當劉封拒絕孟達的勸降，回到成都後，居然在諸葛亮的建議下被劉備殺了。諸葛亮擔心劉封過於剛猛，今後劉備去世後難以控制駕馭，所以藉機除掉劉封。
龐統、法正去世以後，蜀漢一直沒有很好的軍事參謀人才，好像諸葛亮唱獨角戲。蔣琬、費禕長於政務，不善軍事，馬謖又言過其實，街亭一戰留下千古罵名。其實蜀漢有一位軍事才能突出的人才，卻沒有得到諸葛亮的認可和重用，最終還被逼死了，他就是彭羕。可就是這樣一位軍事人才，諸葛亮一直看不上他，說彭羕心大志高，難保以後會做出什麼來。
在諸葛亮的影響下，劉備對彭羕逐漸疏遠，後來把他調動到偏遠的江陽郡擔任太守。失落的彭羕，找馬超發牢騷，對馬超說了一句“你負責外面，我負責裡面，天下可以輕鬆平定”。沒想到被馬超檢舉揭發，彭羕在獄中向諸葛亮認錯辯解，都沒有用，最後被誅殺，年僅三十七歲。好端端的人才沒有用武之地，被逼得走投無路，真是浪費。
在蜀漢最後的幾次戰爭之中，領兵之將，不是軍二代就是官二代，真正在行伍出身一步步爬上來的少之又少，魏延算一個，可惜冤死，姜維也算一個，但是卻也是諸葛亮賞識提拔，還是降將身份。在漢末三國時期，就缺乏一定有效的人才選拔制度，當時的主要方式是徵辟、察舉，直到曹魏搞出九品中正制，也只是針對士族而已。
無論是在劉備和諸葛亮時代，基本上由於戰爭的頻繁，以及各種其他原因，早期的一些大將紛紛去世很早，年輕一代的也很多早夭。比如早期就跟隨劉備的將領，諸如張南，馮習，傅彤等，都是志慮忠純，作戰勇猛之輩。可惜夷陵之戰全被劉備消耗光了。中期大將魏延、張嶷等。年輕一代的，關興，張苞，諸葛喬等。
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