多年磨一剑!
兴农丰华数字育种云平台
隆重发布!
兴农丰华经过多年一线调研、研发、试用反复打磨的「 」(点击蓝字了解详情)上线啦!
本文重点给大家介绍一下平台的一个创新功能模块:
现代工程化育种制胜加速器--分子辅助育种系统!
一、分子育种现状
- 玉米新品种选育需要经历多年,从几万甚至几十万个个体中进行筛选,数据信息的采集、管理和分析工作量巨大;
- 分子育种数据呈爆炸式增长;
- 缺少适应我国玉米育种流程,能够整合利用分子标记的辅助育种系统,因此,需要一整套、成系列、易兼容的工具才能支撑大规模且高效的新品种选育。
二、兴农丰华分子辅助育种系统简介
确定育种目标如高产,通过训练群体估计分子标记遗传效应建立模型,然后将模型应用在育种群体中,估计出育种值,最终做出组配选择。
1. 数据补全
MAF控制:无效位点的剔除
singRate:无效样本的剔除
Imputation:缺失数据的填补
2. 简单分析标记筛选
3. 预测育种值
数据:50972*278
整体的70%为训练样本
整体的30%为验证样本
准确率r=0.71
4. 组配分析
↑↑↑主成分分析
↓↓↓遗传距离分析
聚类分析
三、服务优势
- 预测准确率高,可实现对育种中产量、株高、花期等重要农艺性状进行预测。
- 节约企业成本,随着育种分子数据增加,高效利用闲置的数据,有效缩小育种规模。
- 提高育种效率,传统育种通过自交系选组,组合测配代代筛选,利用分子辅助育种可在数小时内对品种进行筛选,大大提高育种效率。
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