清初，四川曾經有20年（清順治三年到康熙四年，即公元1646年-1665年）的省會沒有設在成都，而是在閬中。 很多人知道這一史實，卻不明就裡。其實，主要原因有三點：
第一個原因：當時，農民起義領袖張獻忠在成都建立了“大西”政權，清朝不可能在此時將省會設在成都
根據歷史記載，1636年，後金第二位皇帝皇太極正式改國號為“清”，從這個時候開始，才有了歷史上“清朝”這個說法。
但清朝在當時並沒有完全控制中原，四川一帶更是鞭長莫及，四川更是沒有收歸囊中，自然不存在設置省會一說。
皇太極
1644年，順治正式定鼎中原，清朝由地方政權變成了統一全國的中央政權。但儘管如此，清朝此時也沒能將四川納入統治範圍。
實際上，明朝滅亡之後，原來反抗明朝的張獻忠農民軍於1643年在黃州稱"西王"，同年，於武昌創建"大西國"，稱“大西王”；1644年，張獻忠於四川成都稱帝，國號仍為“大西”。這一時間，剛好於順治正式定鼎中原的時間重合。
張獻忠
張獻忠大西政權全盛時期，轄今四川和重慶大部地區，直到1647年張獻忠率敗亡西充鳳凰山止，清軍都沒有掌控過四川。
因此，清初至1647年，四川基本上是由張獻忠掌控的，清朝政府是不可能在成都設置省會的。
第二個原因：清初面臨李自成、朱由崧和張獻忠三股勢力的威脅，選擇地理位置較近的閬中為四川省會為當時最佳選擇
清初，順治雖已經定鼎中原，但一來立足未穩，二來僅僅戰據北方小半壁江山。而且，李自成、張獻忠雖反抗明朝，但他們和南明朱由崧政權皆視清朝為外來政權，為此，一些起義部隊的將領在清軍入關後，還投奔南明政權共同對付清軍。所以，李自成、朱由崧和張獻忠三股勢力的威脅不徹底剿除，清軍在四川是無法立足的，更不用說在成都設置什麼省會了。
李自成1644年稱帝建立大順，僅僅撐了一年時間，1645年就被清軍剿滅。這給了清軍揮師南下進剿張獻忠的基礎。清順治二年（1645年）年初，清肅王豪格大軍便集結漢中，準備大舉入川。
清初鬥爭形勢圖
入川之前，豪格先派間諜到四川各地誘降。
1645年3月，豪格派降清的原明總兵嚴自敏自漢中到閬中，去遊說把守朝天關的張獻忠部驍騎營都督劉進忠。劉進忠被說動，拉著張獻忠的精銳部隊降了清軍，掃平了清軍進攻保寧(閬中)的障礙。
就在豪格率軍準備攻打閬中之時，清政府任命的陝西總督孟喬勞當月上書朝廷說：“四川保寧府州縣，亦投降表到。八大王張獻忠偽巡撫吳宇英派專人前來表示投順，臣寫信給他，令其說張獻忠投降，並相機而行。”
可見，清軍還未入川，閬中一帶已或明或暗地依附於大清了。
豪格
1646年，清廷任命王遵為清四川首任巡撫，柯臣為清保寧府首任知府。此後，清軍以閬中為據點，同大西軍、南明政權進行四川爭奪戰，四川總督、巡撫、巡按御史均駐節閬中。
第三個原因：即便在張獻忠“大西”政權滅亡之後，南明政權和川人的抗清鬥爭仍達十多年之久，清廷也很難在此時設四川省會於成都
據歷史記載，張獻忠敗亡之後，清軍趁勢掩殺，張獻忠部孫可望、李定國、劉文秀等不敵而率餘眾南奔，降附於繼朱由崧後稱帝的南明桂王朱由榔。清軍留清四川巡撫李國英駐守保寧。
保寧府地圖
劉文秀是張獻忠的義子，投奔南明後很快成為一員大將。李國英駐守保寧後，劉文秀率軍反擊，李國英不敵，率大部退縮綿陽、廣元和劍閣一帶。保寧城裡只留千餘人把守。劉文秀率部包圍保寧城。
順治六年（1649年），李國英率軍再攻打保寧，失利。順治九年（1652年），豪格率清軍再次攻打保寧。已降清的吳三桂率部從閬中沙溪、蘭家壩一帶進攻保寧城，並以少勝多，將劉文秀守城的13支部隊全殲。至此，清軍才穩佔保寧。
清軍佔穩保寧後，在此設立了作為省級政府當有的四川巡撫衙門、四川布政使司衙門、四川按察使司衙門及四川學政衙門，任命傅一驥為閬中首任知縣，由此奠定臨時省城的格局，閬中成為了當時清政府在四川的軍政權力中心。
四川徹底平定之後，康熙四年（1665年），四川總督李國英上奏朝廷，稱“藩司應自保寧移駐成都”，獲康熙批准，原設保寧的四川政權機構自此全部遷往成都。
