锦鲤中的一些品种如大正三色、昭和三色、红白的价格是相当高的。选出的冠军常以数万、数十万的价格被买走。
优质资源少，物以稀为贵，锦鯉价格昂贵主要是优质的资源太少。锦鲤不像金鱼，金鱼一般有稳定的遗传，壁如水泡眼的后代还是水泡眼，珍珠鱗的后代还是珍珠鱗。外形是遗传的基本内容之一，后代在形体上的差异尚未达到划分品种的标准，而色彩的遗传就更复杂了。有些鱼像红金鱼，黑金鱼热带鱼当中的虎皮鱼、斑马鱼等，色彩大体上跟父母本一样，纵然有些不同也是个别的，这种遗传是稳定的。而五花金鱼、花色锦鲤的后代，色彩就不会跟父母本一模一样了。一对红白或三色的数十万的后代中，只有万分之几的优秀率，具备像亲本一样优秀的花纹。假如大正三色的后代都是大正三色，二段红白的后代都是二段红白，全是精品，数量太多，锦鯉就不值钱了。从这点上说，优质的锦鲤是值钱的。
受到皮下色素细胞组合的影响，色彩的遗传要比形状的遗传复杂的多，锦鲤中优异品种的出现，完全是偶然因素，大的优质锦鲤，价格因素，优美的花纹是干万亿个色素细胞排列组合的情形之。锦鲤的基因组来源复杂，其遗传具有多样性。
攀比之风锦鲤是富贵吉祥的象征，富裕阶层中的饲养、攀比之风也促使其价格居高不下。它们在别墅的池中，在大厅的水族箱中饲养，显示身份，彰显富贵，优质的锦鲤供不应求 。
人为炒作
锦鲤价格的高昂还有人为炒作的因素。日本商人很精明，其实这些锦鲤不过是花纹排列得非常美观、对称的红白花、红黑花鲤鱼，花纹浓艳而有特色的锦鲤，被他们一炒，其价格也就大于价值了。物以稀为贵是锦鲤价格高品的一个原因，日本人精明的早期炒作是价格高昂的另一个原因。
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