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电商的发展带动快递行业的发展，淘宝商家一般都是和快递合作的，快递成本低是包邮的首要前提。
同样，一些价格很低的商品还包邮，一种可能是商家为了冲销量，通过销量提高搜索权重，带动店铺其他商品的销量。另一种就是商家走的薄利多销的路子。
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淘宝商家和快递公司都是有合作的，寄件的价格极其优惠，远比我们这些普通客寄件10元起步按重加钱，所以既然都交了合同金，用包邮的优惠来赚取更多的订单量，何乐而不为，例如满减包邮等等买家看到包邮的标签也会有所心动，这不仅仅是种优惠跟是一种营销手法。买的多了，自然就赚了还会在意那微末的运费吗。
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这个可以从消费者和商家两方面来看。
首先，从消费者方面看，消费者心理是商家最初做出包邮选择的主要原因。我自己经常在浏览一款商品时会因为不包邮费而选择换一家买，不包邮就总会觉得心里不舒服。哪怕是很贵的东西，比如球鞋、珠宝、首饰之类的。就我个人来说，如果不包邮，会非常影响我的购物体验。同理，就像39.9的价格就是比40看起来舒适一样。
其次，商家方面，因为我自己之前做过微商，所以还是比较有发言权的。商家通常和某一家或多家物流公司长期合作，所以有时你想要指定快递而询问客服时，他会回答你自家都可以发什么快递，超出合作范围的物流不接受指定。而与物流公司合作后，单件快递的费用会非常非常低，我之前做微商时，工厂发出快递一单是一块钱人民币，这是在我们工厂规模比较小，物流量不算多的情况下。如果物流量多的话，价格应该还有空间，这与我们平时自己寄快递的费用差别非常非常大，我平时寄快递最低也要15块人民币。
并且跟实体店的房租、装修费用、人工费等等的投入到最终商品的售价相比，物流费用成本已经算是非常低了。所以这种合作其实是不太影响商家收入的，并且会留住大批消费者，所以何乐而不为呢？
还有其他方面的原因我不太了解的，希望其他回答者可以帮到你。
