1913年1月，民國第一次國會正式選舉開始。2月，兩院大選揭曉，國民黨獨得392席，梁啟超操盤的進步黨只拿下了223席。國民黨組閣已成定局。
3月初，袁世凱發電邀請宋教仁“速赴北京，商討國是”。宋教仁慨然應諾。
是年3月20日晚10點左右，黃興、陳其美、廖仲愷等親往上海火車北站，為宋教仁赴京送行。
晚10點45分，當宋教仁被黃興等人簇擁著剛進入月臺入口時，宋教仁背後突然閃出一人，掏出手槍就打。宋教仁猝不及防，背後中了一彈，彈穿入胸，直達腰部。其後的第二、第三槍，未打中宋，也未打中其他任何人。
槍聲響時，車站大亂，刺客乃趁機逃去。
宋教仁忍痛不住，靠在鐵柵欄上，悽悽然道：“我中槍了。”其後，宋教仁被火速送入滬寧醫院搶救。因傷勢嚴重，流血過多，宋教仁其間幾度昏迷。
宋教仁被搶救醒來後，第一件事就是讓黃興給袁世凱發電，電文是：
“北京袁大總統鑑：竊思仁自受教以來，即束身自愛，雖寡過之未獲，從未結怨於私人……遽爾撒手，死有餘恨。伏冀大總統開誠心，布公道，竭力保障民權，俾國會得確定不拔之憲法，則雖死之日，猶生之年。臨死哀言，尚祈鑑納。”
22日凌晨4時48分，“國民黨教父”宋教仁不治身亡，年僅31歲。
在這裡，需要說明的是，直到臨終，宋教仁也不認為自己是被袁世凱指使刺殺的。
宋教仁，1882年4月5日生於湖南省桃源縣。1904年2月，反清革命組織華興會甫在長沙成立，宋教仁即任副會長；同年，因長沙起義失敗，宋前往日本。1905年，宋加入中國同盟會，任司法部檢事長。
1911年10月10日，武昌起義爆發並獲得成功。次年初，民國成立，宋教仁被任命為法制院院長。同年8月，中國同盟會改組為國民黨，宋教仁被孫中山委為代理理事長。其後，宋到處演說為國民黨爭取多數席位。1913年2月，國會選舉接近尾聲，國民黨取得重大勝利。
宋教仁遇刺後，舉國震動，輿論譁然。國民黨人認為此案的幕後黑手，一定是袁世凱。
實際情況真是這樣嗎？
在這裡，我們先說槍殺宋教仁的刺客是誰。
宋教仁遇刺消息傳到袁世凱那兒後，袁極為震驚，隨即給江蘇都督程德全發急電，要求“迅緝真兇，窮追主名，務得確情，按法嚴辦”。
一個月後的3月24日，刺客武士英被抓捕。
刺客武士英
原來，經過調查，是時任江蘇巡查總長應桂馨花錢僱的殺手武士英。3月23日，上海租界巡捕房在上海湖北路一妓女家中抓到了應桂馨。第二天，巡捕又在應桂馨家將刺客武士英捉拿歸案。
應桂馨系浙江人，曾是同盟會會員，跟隨陳其美參加革命，擔任過總統府庶務科長。
刺客武士英則是山西人，曾在雲南當兵，任營長等職，退伍後流浪到上海，時年22歲，沒有職業。審訊時，武士英將殺人動機和一切責任全都大包大攬在自己一人身上，未牽涉第二人。武士英射向宋教仁的那顆子彈，彈頭有毒，可見武士英鐵了心要置宋教仁於死地。
讓人不解的是，又過了一個月，也即4月24日，刺客武士英在獄中突然中毒，死了。應桂馨在審判期間百般抵賴，沒有交待個所以然。
應桂馨
接下來，隨著“二次革命”，也即孫中山領導的“討袁之役”爆發，應桂馨趁亂於當年7月成功越獄。
二次革命失敗後，當年10月6日，國會選出袁世凱為第一任正式大總統。11月4日，袁世凱以“叛亂”罪名下令解散國民黨。
1914年1月19日下午，應桂馨在津京快車上遇刺身亡。“刺宋案”到這個時候，連這點線索也斷了。
當時，懷疑袁世凱是槍殺宋教仁的幕後黑手，主要理由是，宋教仁領導的國民黨在國會兩院選舉中大獲全勝，宋的威望大增，所到之處，歡迎者人如潮湧，可能讓袁世凱很是忌妒。這是其一。
其二，在民國兩院選舉前後，宋教仁在各地演講中，極力宣揚將總統改為沒有實權的虛位領袖，甚至宣傳奪權。這讓袁世凱怎麼想？會不會認為是對他總統職位的最大威脅？
最早提出袁世凱是殺害宋教仁幕後黑手的是國民黨元老黃興。宋教仁死後，黃興撰寫輓聯：“前年殺吳祿貞，去年殺張振武，今年殺宋教仁；你說是應桂馨，他說是趙秉鈞，我說是袁世凱。”這矛頭已直指袁世凱了。
但誰也沒有找到袁世凱是殺害宋教仁幕後黑手的有力證據。還有，據章士釗回憶，宋教仁遇刺的電報傳來，他正和袁世凱一起用餐。袁世凱看完電報後嘆息說：“遁初(宋教仁字遁初)可惜，早知如此，何必當初？”
袁世凱此話是真是假，不得而知。但不妨推測一下，即使宋教仁到京組閣，袁世凱身為總統，手握軍權，似乎犯不著去暗殺宋教仁。
那是不是國務總理趙秉鈞主謀殺了宋教仁呢？因為，國民黨選舉大勝，宋教仁赴京後，趙秉鈞的位子就得讓給宋教仁。這是趙不情願的，於是，趙就起了殺宋之心？當然，這也沒有什麼證據。
再作一設，袁世凱也許沒有殺宋之意，但袁的下屬中，是不是有“立功心切”，爭先為領導“分憂”者殺了宋教仁呢？也不能說沒有這個可能。
百年來，有關“刺宋案”一直眾說紛紜，莫衷一是。這個迷還有待歷史學家們去解開。
