日前，來自澳大利亞國家科學機構CSIRO的研究人員公佈了一種分析新冠病毒遺傳序列的新方法。
這些發現將幫助研究人員更好地瞭解病毒株的進化方式，並幫助研究人員識別新的病毒簇。
分析新型冠狀病毒的公開基因組序列全球數據將有助於我們快速瞭解這種複雜疾病。
以最初用於分析人類基因組的生物信息學算法為基礎，研究人員開發了一種新的可視化平臺來查明SARS-CoV-2病毒數千個基因序列之間的差異。
CSIRO首席執行官拉里·馬歇爾(Larry Marshall)博士表示，瞭解基因序列至關重要。
馬歇爾博士說：“我們對這種病毒瞭解得越多，就能越好地對付它。”
“這種對新冠病毒基因組序列進行的高度複雜分析已經幫助確定了哪些病毒株適合用於疫苗測試。目前，這些疫苗正在南半球唯一一個高生物遏制設施——位於基倫的澳大利亞疾病預防中心(Australian Centre for Disease防備)進行測試。”
澳大利亞麥考瑞大學的名譽副教授、CSIRO生物信息學小組組長，該研究論文的第一作者丹尼斯·鮑爾(David Hansen)博士說，隨著病毒的進化，這一序列變得越來越重要，因為它實際上會決定病毒的行為和病毒會導致哪種疾病。
鮑爾博士還說：“全球現在有大量的單個病毒序列。”
“對這些數據點之間的進化距離進行評估和可視化，將有助於研究人員瞭解病毒的不同菌株——包括它們來自哪裡，以及它們將會如何繼續進化。”
英國約克大學名譽教授、CSIRO的危險病原體組長S.S. Vasan教授是SARS-CoV-2病毒研究和疫苗評價研究工作的領導人，同時他也是這篇研究論文的通訊作者，他說，研究人員已經對新冠病毒第一批公開的181組基因組序列進行了分析，以瞭解病毒的變化會對病毒的行為和影響產生怎樣的後果。
Vasan教授說：“我們已經證實這種RNA病毒會進化成許多具有相同突變的獨特病毒簇，我們還對其進行了可視化。”
“目前我們不認為它會影響新冠病毒疫苗、治療方法和診斷方法的開發和評估，但隨著臨床前和臨床研究的進展，對這個信息進行監測非常重要。”
“為了實現這一目標，我們呼籲國際研究機構在去除身份識別信息之後共享嚴重病例和預後的細節，以及其他相關的元數據，如共病和吸菸情況，以及病毒的基因組序列。”
CSIRO的澳大利亞電子健康研究中心首席執行官大衛·漢森(David Hansen)說，這項研究工作表明瞭生物信息學、基因組學、疫苗學和病毒學等既有學科和新興學科交叉合作的重要性。
漢森博士說：“和這篇研究論文一樣遵循同行評議科學過程的公開出版物是CSIRO回應病毒的一個重要組成部分。”
鮑爾博士說：“數據可視化平臺的優勢就在於它突出了在病毒不斷變化和適應新環境的過程中仍在不斷進化的基因突變。我們對病毒進化的基因差異及其對疾病進展可能會造成的後果瞭解得越多，我們就能更好地通過診斷和治療來應對疾病。”
原文：https://medicalxpress.com/news/2020-04-team-evolving-strains-sars-cov-.html
