2019年12月底，sars-cov-2已在法國蔓延。
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https://doi.org/10.1016/j.ijantimicag.2020.106006
獲得權利和內容
高光
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2019年12月底，冠狀病毒已經在法國蔓延，一個月前（2019年11月），法國正式出現了第一批病例。
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早期社區傳播改變了我們對冠狀病毒流行的認識。
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這一新病例改變了我們對疫情的理解，模型研究應適應這一新數據。
摘要
據信，法國的冠狀病毒流行始於2020年1月底。我們在此報告一例病例，一名病人於2019年12月在我們的重症監護病房住院，我們的醫院位於巴黎北部，因咯血而沒有病因診斷，並對已儲存的呼吸道樣本進行了回顧性RT-PCR檢查，證實了對冠狀病毒感染的診斷。根據這一結果，看來冠狀病毒流行開始得早得多。
關鍵詞
COVID-19重症監護病房
導言
新冠狀病毒(SARS-COV-2)在中國於2019年12月發病後，在多個國家廣泛傳播，引起冠狀病毒病。1世界衛生組織(WHO)於2020年3月11日宣佈冠狀病毒大流行。3法國於2020年1月24日報告了首例與SARS-COV-2相關的感染病例.5這兩起案件都有去武漢旅行的歷史。6據我們所知，這2例病例被認為是法國第一例確診病例。冠狀病毒最常見的流感樣疾病(ILI)。7當中國面臨冠狀病毒爆發時，歐洲國家正與季節性流感作鬥爭。8臨床症狀的冠狀病毒與ILI相似，因此我們決定回顧性地在巴黎附近的重症監護病房(ICUS)收集的呼吸樣本中尋找SARS-COV 2。
方法-回顧性分析
選定記錄
我們回顧了在2019年12月2日至2020年1月16日期間因ILI而入院的ICUS患者的醫療記錄，並在入院時進行了陰性的RT-PCR檢測。我們在醫院採集的每一個呼吸樣本都被冷凍在-80°C的溫科-86°C冰箱中，並儲存了四年，以備進一步分析之用。根據病史，對有ILI症狀(發熱>38.5°C、咳嗽、鼻炎、咽喉痛或肌痛)和磨玻璃混濁的患者進行SARS-COV-2RT-PCR。示例選擇的說明可在圖1.
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圖1. 測試的選擇過程。
嚴重急性呼吸系統綜合症冠狀病毒-2
COVID-19的測試
於2020年4月6日至9日對14個選定的生物群落進行了SARS-COV-2RT-PCR檢測.RT-PCR嚴格按照Charité協議進行。11針對E基因，編碼SARS-COV-1和SARS-COV--2包膜蛋白，在QuantStudio7(熱裂變器)裝置上進行編碼。積極結果(圖2)根據製造商的命令使用基因查找器COVID 19 Plus RealAmp工具包(IFMR-45)確認。本試驗針對3個病毒基因(RdRp、E和N分別編碼病毒RNA依賴的RNA聚合酶、包膜和核衣殼蛋白)和細胞RNase P基因，以確定呼吸道標本的質量。
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圖2. Charite協議RT-PCR檢測結果。
病人的邊緣黃色，陽性和陰性的測試樣本，紫色)
結果：
在研究期間，58名因ILI入院的病人中有14名(24%)被納入我們的分析(表1)，其中一份樣本來自阿爾及利亞一名42歲的男子，他在法國居住多年，從事養魚業。他最後一次訪問阿爾及利亞是在2019年8月。他的一個孩子在症狀出現之前就出現了ILI。他的病史包括哮喘，II型糖尿病。他於2019年12月27日來到急診室，表現為咯血、咳嗽、頭痛和發燒，病情持續4天。初步檢查不明顯，CT掃描顯示下葉有雙側磨玻璃混濁(圖3)。入院時，他淋巴細胞減少，C反應蛋白和纖維蛋白原升高，而降鈣素Pro在正常範圍內。在急診室採集的痰標本中未檢出病原菌。該病人接受抗生素治療後進入ICU，直到2019年12月29日出院。
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圖3. 胸部計算機斷層掃描在基線處進行。
下葉出現雙側磨玻璃混濁
討論
我們報告在我國第一例報告病例前一個月觀察到一名感染冠狀病毒的病人。入院時，病人出現了臨床症狀和放射學模式，這是中國人以前經常看到的。12和意大利語13隊列。鑑定第一位受感染的病人具有很大的流行病學意義，因為它極大地改變了我們對SARS-COV-2及其在全國的傳播的認識。此外，由於缺乏與中國的聯繫，以及最近沒有旅行，這表明到2019年12月底，這種疾病已經在法國人口中傳播。
需要進行進一步的研究，以評估SARS-COV-2在法國領土上的實際發病情況，2019年末和2020年1月人口中SARS-COV-2汙染的實際程度，並探討當時可能發生的未被注意到的潛在死亡情況。據認為，截至2020年4月10日，冠狀病毒導致了86334例和12210例死亡。4在法國，但我們的發現表明，這些數字可能低估了冠狀病毒的實際負擔。最近的兩項研究表明，感染sars-cov-2的人中有18%至23%是無症狀的。16約55%的感染者是由不明原因的感染者引起的。17我們的結果有力地支持了這兩個假設，表明許多無症狀的患者在2020年1月期間沒有被診斷，並導致了這一流行病的蔓延。
此外，由於這些結果改變了我們對疫情動態的理解，這也意味著用於預測SARS-COV-2傳播的演變和結果的幾個模型可能基於有偏見的數據，需要根據疫情的實際情況進行調整。18
我們的研究有幾個侷限性。首先，由於所進行的分析具有追溯性，醫療記錄並非詳盡無遺，可能缺少一些相關資料。其次，由於rt-pcr的敏感性，我們不能排除假陰性結果。19以及一種可能破壞樣品質量的存儲技術。20為了避免任何假陽性結果，我們已經採取了所有通常的預防措施，我們還通過兩種不同的技術和工作人員證實了這一點。第三，我們只對少數樣本進行分析，我們選擇將選擇的記錄侷限於符合症狀和CT的ICU患者，儘管大多數患者實際上有輕微的症狀。第四，儘管文獻中描述了交叉汙染，但我們的分析侷限於當時多重PCR陰性的患者。9最後，我們在巴黎北部地區進行了一項單中心研究，該地區在這一流行病中面臨著特別沉重的負擔。21這些限制可以解釋為什麼我們只能在我們的人群中識別出一個感染了SARS-COV-2的人。
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