果樹和其他農作物一樣，重茬會表現一定的不適應性。 新栽幼樹成活率低，長勢弱，新梢生長緩慢，且節間短，葉片小而薄，根系生長髮育不良，容易腐爛。輕者，新栽果樹多形成小老樹，重者樹未進入成年既衰弱枯死。結果樹產量品質逐年下降，抗性減弱，易感染病。
例如，枝條潰瘍，尤其核果樹類樹種易得流膠病，木質部和韌皮部變褐，易得枝幹病，形成未老先衰，嚴重者樹體死亡等。這種現象被稱為“果樹再植病”（又名重茬病），果樹再植病主要發生在蘋果、梨、桃、杏及櫻桃等樹種上，葡萄也有發生，但以蘋果和桃表現最為嚴重。
果樹再植病發生的主要問題在於土壤。只有徹底改良土壤的理化性狀，提高土壤通透性，使土壤中的“水、肥、氣、熱”有利於土壤中好氣微生物的生存發展。好氣微生物多，有害物質就能被氧化（如旱地土壤施用尿素和硝態肥會產生亞硝酸鹽，就能被植物吸收利用）。從而大大減少土壤中的有害物質，防止根腐病，爛根病的發生。
徹底清園結果大樹應結合冬季深翻、施基肥，徹底清除老樹殘根，落葉，果園雜草，帶出園外，集中燒燬。
果園土壤消毒處理將事先挖好的定植坑回填時，可邊填邊噴藥效果最好。農藥可選用40%福爾馬林500倍，溴甲烷、甲醛等或用2.5%適樂時1000倍液對定植穴進行澆灌，株灌藥液15～25千克。
輪作到茬挖掉老樹後，果樹先行輪作倒茬，種植豆科類作物。一來可減輕原茬果樹寄生的微生物在土壤中的活量，二來也可趁機培肥地力，這種方法對防止再植病效果最好。
曬土或換土該方法是把地深翻曬土，既可通過改善土壤通氣狀況及減少植物毒素釋放，又可利用日照殺菌熟化土壤，也可把其他的熟土運來進行定植穴換土栽培。
噴施免深根在1畝的果園裡，用1瓶免深耕對水100千克直接噴施在地表，既可起到疏鬆土壤功效，又可大大減低耕作層成本，省工省力，使用該產品後果農普遍反映，效果非常好。
更換品種樹種的合理更換也可減輕再植病，而且長期栽植同一樹種會造成很需要的營養元素供不應求，而有些不需要或需要少的元素，又一直閒置有所浪費。但要換樹種時應慎重，蘋果茬最好選擇桃、杏樹，不宜選擇梨、葡萄樹，梨樹茬可選擇葡萄、桃、棗樹等，不宜選擇蘋果、山楂樹等，可選梨、杏、棗。
栽植時應選抗病、抗線蟲、抗連作的優良純正品種和砧木苗木要有一定高度和粗度（最好是達到一級壯苗），具體要求發育充實，整形帶內芽體飽滿，無機械損傷和病蟲害，直根有一定長度，側根並帶3～6條鬚根系。苗子必須經過嚴格檢疫，消毒後方可栽植。新栽的定植穴內要重點細緻消毒，定植穴必須與原定植穴錯開，即在原定植穴之間挖1米見方的新定植穴栽植。
當年定植的幼樹，樹盤不應少於1米，2～3年生以上樹盤要大於冠徑，嚴禁間作高稈作物及秋菜類作物可選擇低稈生長期短的豆科作物，或間作綠肥翻壓，增加土壤肥力。
應當增施有機質肥，改良土壤團粒結構，並做到測土配方施肥等。合理灌水等都是對重茬果樹所採取的積極措施，除抓好地下管理外，更應抓緊生長期病蟲害防治工作，以保證果樹健壯生長。
