上一篇談到，忽必烈與阿里不哥二人先後稱汗，造成了混亂。
從當時的情形來看，雖然忽必烈得到東道諸王的支持，但是西道諸王手中的實力要遠勝於東道諸王。毫無疑問，忽必烈在戰爭開始時是處於下風的。但是忽必烈在權謀上要更勝阿里不哥一籌。他深知宗王們之所以會有推戴自已與阿里不哥的不同，背後是各種錯綜複雜的權力與利益關係。只要能夠從“利”之一字入手，想要分化阿里不哥的陣營，並不是特別困難的事情。
於是忽必烈派出己方的察合臺系宗王阿必失哈前往察合臺汗國，希望爭取察合臺汗國的支持。阿里不哥也注意到忽必烈的異動，提前派出軍隊將阿必失哈截住，並將其送往漠北處死，察合臺汗國的大權落入阿里不哥派的察合臺系宗王阿魯忽之手。然而忽必烈正在擔心西北局勢發展逐漸對己方不利之時，他的弟弟，蒙哥汗派往西方攻打波斯地區的旭烈兀歸來，與阿里不哥產生矛盾，主動向忽必烈示好。於是忽必烈與旭烈兀締結了政治聯盟，後來在平定阿里不哥之亂以後，旭烈兀在波斯地區建立了伊利汗國。
另一方面，控制了察合臺汗國的阿魯忽也與阿里不哥出現了矛盾。就在阿里不哥與忽必烈之間爆發了和林之戰以後，阿里不哥兵敗和林，退往謙州，要求阿魯忽為他提供軍需物資和兵員戰力。阿魯忽並不願意對阿里不哥就此俯首聽命，侵吞了為阿里不哥籌集的物資，與阿里不哥交惡，並主動向忽必烈示好，希望以不再支持阿里不哥而倒向忽必烈，來換取察合臺汗國在此地的統治權。忽必烈當然欣然同意。
忽必烈取得了旭烈兀的支持，並將察合臺汗國從阿里不哥陣營中分化出來，是外交上的重大成功。此時金帳汗國與窩闊臺汗國都在背後支持阿里不哥，其中金帳汗國雖然沒有明確表態，在表面上仍然保持中立，似乎是在充當雙方斡旋人的角色，實際上在今天出土的金帳汗國的銀幣銘文中，仍將阿里不哥稱為大汗。
此後，由於四大汗國之間產生矛盾，互相攻擊，無暇參與忽必烈與阿里不哥之爭，終於使阿里不哥在孤立無援的情況下被忽必烈擊敗，只得宣佈投降。
阿里不哥投降之後，忽必烈並沒有馬上將他處死，而是將他幽禁起來，並準備召開忽裡勒臺大會，借處理阿里不哥的由頭，來要求四大汗國來承認自己的地位。可是此時四大汗國內部正展開激烈的戰鬥，就連與忽必烈關係最為緊密的旭烈兀都無法抽身前來。此事只得不了了之。
阿里不哥在投降之後兩年，突然暴病身亡，到底是忽必烈下手害他，還是自然死亡，我們都不得而知。但是我們大概可以知道，忽必烈對於阿里不哥一系並未趕盡殺絕。
下一篇談脫古思帖木兒之死的過程，以及蒙元帝國的的解體。