蓝藻中的项圈藻可快速产生致死因子，破坏养殖对象的鳃组织，干扰其新陈代谢的正常进行，麻痹神经，使其死亡。蓝藻中个别种不但活体带毒，而且死亡个体分解会产生生物毒素——蓝藻毒素（如微囊藻毒素）。蓝藻毒素量多时可直接造成养殖对象中毒死亡；或者即使数量少，也可通过食物链积累效应危害养殖对象，直至危害人体
蓝绿藻到底对养殖过程中都有什么危害：
1.蓝绿藻过多，抑制有益藻类的生长，也就会造成养殖对象生长缓慢。
2.蓝绿藻大量死亡的时候，会产生大量的藻毒素，会造成养殖对象大量中毒死亡。
3.蓝绿藻过多，会造成水体无法和空气接触，夜晚容易造成水体缺氧，使用养殖对象缺氧死亡。
4.造成PH值升高，一般会大于9.0，PH值升高之后，会更有助于蓝绿藻的生长。
5.会伴随氨氮超标，使养殖对象死亡。