一介布衣14
不知道你此处的“三非院校”是不是指非985、非211、非一流学科建设高校？暂时先按照这个定义来理解了。
从表面上看，很多考生和家长纠结院校和专业的问题，是觉得如果上了好学校，而专业却不喜欢，担心在大学四年的学习过程中自己痛苦，并且将来就业时不理想，该怎么办？或者为了学一个好专业，掌握热门技能，只能将学校档次降一格 ，选一个二流院校，最终却发现毕业时名校文凭才是就业的“敲门砖”，又该怎么办？
貌似两头都纠结！
其实你这个问题，想明白了就简单。首先，要看你的高考分数在哪个段位，如果属于高分考生，能上名校却非要为了某个二流院校的王牌专业而牺牲，那纯粹是没想开。如果是一个中低分段考生，你的成绩所能够得着的最好的学校也好不到哪去，即好学校与差学校之间本身也没甩开多大距离，那就不如奔着你喜欢的专业去努力了。
看你的提问，应该也有报考985高校的实力，那么我建议你优先考虑985高校。
为什么呢？因为既然你在这三个档次的学校中，对比的都是同一个专业，说明你的目标很明确，就想在这个专业上发展。那么就不存在专业不喜欢、不理想的问题。只需要考虑选择不同院校的利弊就可以了。
当前，不管是考研、出国还是就业，对你本科院校的出身还是很重视的，985高校，也就是现在的“一流大学建设高校”，光环效应不可替代。说句不好听的，如果你去找工作，又有几个企业的HR会拿着教育部的学科评估表去对比，这个学校的该专业是B级，那个是A级？主要还是看你的学校名气，只要听到你的母校很牛，马上就会对你高看一眼。
况且，你目前的想法，不见得十分成熟，如果你选择985或者211高校，则未来的纠错成本会相对低一些。你所在学校的整体氛围（师资、学风、平台）就是一笔巨大的财富，在潜移默化间对你的成长也能起到很大的助力作用。比如说你将来考研，可以选择清华、北大、浙大、复旦这样的顶级牛校，在这些院校中，你所学的专业全国排名再差也差不到哪去（本科时候考不上的清华、北大，考研的时候或许就能实现）。
退一万步讲，用一个能上985的分数，选一所你所说的“三非”院校，浪费的那些分数，你不觉得亏吗？
所以，不用再纠结了，能上985还是选985吧，选不了985，再考虑211。至于专业等级评定，B级和A+之间，没有你想象的那么大的鸿沟。说不定过几年专业排名又变了，只要不把它太当回事，它也就只是那么一回事了。
高考同期声
这个问题其实还是很有讨论的意义。大概说说我的看法。
国家推进实施双一流建设，其初衷其实就在于把高等教育的投入由对整个学校的支持变为对优势学科的支持。从目前教育部对双一流高校划拨的建设资金来看，主体上也是按学科来拨的钱。也就是说同样是985，同样入选了双一流大学，但如果入选的学科数不一样的话，拨款额度也是不一样的。因此，在高校圈子里，随后发布的第四轮学科评估结果更具有参考价值，A+学科将成为未来大家关注的焦点。
这是从高校角度来看，从学生的角度来看，在大学和专业的选择上，学科排名对报考硕士博士更有参考意义，但对高中生填报高考志愿来说，学科排名所占的权重并不大。为什么这么说呢？
第一，对大部分考研的人来说，研究生期间要接受的是学术训练，而学科排名着重体现了这个学科的学术水平，那当然是要尽量考这个学科最强的高校；而对本科生来说，在大学里接受最多的是常规教学、实践实习、第二课堂、人文熏陶等等，这些东西基本没有在学科评估中体现，所以，学科评估的好坏，对本科生来说远不如学校的好坏。
第二，对考研考博的人来说，自己的专业已经学了好几年了，大部分人是不会轻易换专业的，而且毕业后也是准备留在这个领域的，所以很多人更愿意选择A+学科。比如前面有答主说同一学科，在华中科大是A+，在清华是B，我认为考研考博一定要选前者，而不是后者。
而对高中生来说，他们的专业基础完全是空白，也不大有职业概念，除非有人有兴趣特别想学某个专业，大部分人对专业的概念仅限于理、工、文、管、医这个层面。他们也并不是非要学某个专业。所以，在报考志愿时，一定是优先选择清华而不是华科，至于专业，考上哪个是哪个。
至于题主说的三非高校A+，也就是说学科是A+，但没有入选双一流学科，这样的学校我不确定是否有，即便有，也绝对是个别。我个人认为，这三个学校排名，对高考来说，是1优于2，2远优于3。对考研考博来说，1和2差不多，皆可，3还是次之。不是说三非高校A+不强，而是觉得性价比不够高。要知道，如果学科评估能到A+，却不能进双一流学科，只能说明这个学科在国内还算不上数一数二，那报考的意义就不大了。
高校人才真经
先不说985与双非比较，先想想，都是985大学，如果能考上清华大学的光学工程，你是读清华大学还是华中科技大学？教育部17年学科评估，清华大学光学工程B+，华中科技大学A+
3个Z1
首先，工作之后很少有人看你的专业排名的，大部分都是看学校名气的，如果只是为了就业，还是选择名气大点的，如果你想深造，搞学术，搞科研，建议你还是选择专业性比较强的，这样你接触的资源比较多，导师比较专业，希望你有自己的选择。
知教
一杯清茶
貌似很好的假设，也非常的有讨论必要，看似就是选专业呢还是选名校。仔细想想，则不存在这样的情况，即使有，我想说，还有更好的选择。因为都已经明确了，同一专业，那我想说，就不要只拘泥你本地或者省会城市你了解的三所学校了，为什么不去选择985里同样录取分数线但是专业评级为A或者A-的呢？
Laco72777431
这个看你是读哪个阶段，哪一个专业。如果是本科，报考文科专业，肯定报考文科专业性强的高校，再次考虑学校层次。如果是本科，理工科专业，肯定报考985学校，这样后期发展的机会要大很多。如果是读研究生，肯定要去行业类专业性强的高校。
