人參的杯具
題主具有這樣的覺悟，讓人驚訝啊。
不過我想說，你提及的諸如官僚作風嚴重、體制僵化、導師不學無術等，更多的是碩士、博士層次考慮較多的內容，而且作風、體制問題在高校系統基本都是類似的，相對來說中科院讀研，學術研究氛圍相對自由些。比如導師，在大學基本只有個輔導員，少量學校的輔導員經常露面，大量輔導員一年見個幾次面，開學、放假各一次。
就個人而言，如果對體制、作風等特別敏感的話，儘量嘗試部分聯合作辦學，比如香港中文大學（深圳），只簡單提及個乙區，18年全國乙卷的10個省市（安徽、湖北、福建、湖南、山西、河北、江西、廣東、河南、山東）的一本線差異極大，同時不清楚文理科清楚，620實在沒法給你估算。如果是文科，部分省市的620分你也可以直接選擇香港大學、香港中文大學等8所港校，需要注意網上報名、面試考核的時間節點。報考港中深流程相對簡單，本科期間同樣有機會去劍橋、哈弗等名校做交流。說到這裡，地處深圳的南方科技大學對外交流也相當多，聯繫的境外學校水平很高，接觸的牛人也不少。不過這2所學校和國內的傳統的985高校不同，褒貶不一，不過從你想要的學校類型來看，對你可能比較合適。
說句實話，在大學內學不學都看你自己，我高中後面的學弟中就有考入清華被勸退的，也有普通大學考入清華大學讀研讀博的。如果不想去類似的合作辦學高校，相對來說，北京、上海等發達區域的985名校能給你你提供的機會更多，不同學校之間的交流更方便，可跨學校選修課程，期間能接觸的同學、老師更多。同時，國內外不少高端學術會議（碩士、博士跟著導師參加的比較多）都會選擇北京、上海等城市作為會場所在地，本科生也可以不用註冊，直接蹭進去聽報告，甚至向做報告的專家提問。
至於你提及的不建議報考的大學，實在沒法回答，畢竟你這個分數可以進的學校，都可以巴拉巴拉幾個大牛級的校友。當別人可以的時候，我們就不能找藉口，只能找到自己還需要努力的地方。
希望對你有所幫助:(
