微生物肥料最主要的作用就是里面所含的活性菌。 微生物菌肥的核心是有效功能活菌数，即“有工作能力”的“活体”菌种数量，而不是一般的含有多少菌数。
因此菌肥必须要保证施入土壤中是活性的，才能发挥菌肥作用。不然白搭！
菌种活性是有一定时间限制的。
菌肥标准规定包装袋上应该标注菌种的有限期，一般正常储存条件下有效期最多为两年，并且菌肥必须保存在阴凉、通风、避光处，以免失效。
有的菌种需要特定的温度范围，如哈茨木霉菌需要保存在2-8℃的恒温箱内，有效期为一年，而一些芽孢杆菌要根据生产质量高低，主要是看芽孢化水平，芽孢化高的能保存一年半甚至更久，芽孢化不好的达不到半年就失效，所以菜农应谨慎选择菌肥产品。
该图是从某菌肥产品上截取的，大家可以看到显示有效期为18个月，也就是一年半。那么超过一年半，你还敢用吗？所以大家选肥时一定要注意这一点。
附：各种菌的功能介绍
枯草芽孢杆菌：增加作物抗逆性、固氮。
巨大芽孢杆菌：解磷(磷细菌)，具有很好的降解土壤中有机磷的功效。
胶冻样芽孢杆菌：解钾，释放出可溶磷钾元素及钙、硫、镁、铁、锌、钼、锰等中微量元素
地衣芽孢杆菌：抗病、杀灭有害菌
苏云金芽孢杆菌：杀虫(包括根结线虫)，对鳞翅目等节肢动物有特异性的毒杀活性。
侧孢芽孢杆菌：促根、杀菌及降解重金属。
胶质芽孢杆菌：有溶磷、释钾和固氮功能，分泌多种酶，增强作物对一些病害的抵抗力。
泾阳链霉菌：具有增强土壤肥力、刺激作物生长的能力
菌根真菌：扩大根系吸收面，增加对原根毛吸收范围外的元素(特别是磷)的吸收能力。
棕色固氮菌：固定空气中的游离氮，增产。
光合菌群：是肥沃土壤和促进动植物生长的主力部队。
凝结芽孢杆菌：可降低环境中的氨气、硫化氢等有害气体。提高果实中氨基酸的含量。
米曲霉：使秸秆中的有机质成为植物生长所需的营养，提高土壤有机质，改善土壤结构。
淡紫拟青霉：对多种线虫都有防治效能，是防治根结线虫最有前途的生防制剂。
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