沒想到哥居然
幕後組織
組織研製這種藥的目的是為了能夠使人永葆青春的。APTX-4869的第一個試驗者其實是灰原哀，也就是宮野至保。但是藥物失敗了，雖然是人年輕了，但是卻也使人變小了。
新一也是一個失敗的例子。之前，組織也研究過一種藥物，吃了之後確實可以使人一直保持在年輕，精力充沛的狀態，這個人就是貝爾摩得。但是這個藥物也失敗了。因為雖然這個藥可以使人一直保持在最年輕力勝的狀態，但是需要定時的服用這種藥，要不然人體就會因為消耗過度而死亡。貝爾摩得一直沒有離開組織就是因為她離不開這個藥。
所以組織命令宮野至保研製了APTX-4869.不過在那些試用品當中，確實有一個成功的活體，也是唯一的活體，那就是現在身為怪盜基德的黑羽快鬥！黑羽快鬥原名應改為工藤快鬥，他是新一的雙胞胎弟弟。但是因為工藤優作很有頭腦，所以組織想利用工藤優作幫助組織尋找“潘多拉之石”，所以在工藤有希子懷孕的時候就全程的監控。
所以，當時沒人知道有希子是生了2個孩子，並且抱走了其中的一個孩子，就是快鬥，不過不久後，工藤優作就知道了，但是就只有他知道，他不能跟任何人說。
本來想威脅工藤優作的，就給快鬥吃那種藥，但是沒想到的是藥物居然在快都的體內植入成功，所以沒有威脅成。但是也不能讓快鬥死，因為他是唯一的活體，所以就交給了魔術師黑羽快鬥撫養。也正是因為塊都沒有威脅成，遍“挾持”新一，並且流放了工藤優作夫婦。
動漫聽夢軒
黑衣組織是一個籠罩在神秘色彩中的跨國犯罪組織。江戶川柯南稱其為“烏鴉軍團”。工藤新一就是因為被該組織成員琴酒灌下藥物APTX4869而導致身體縮小，開始了整個故事。
該組織的真實名稱不詳，片中一般以“黑衣（黑暗）組織”、“組織”代稱，組織的組成結構和目的也不明顯。但可以肯定，黑衣組織是一個勢力很廣的大型犯罪組織，資產雄厚，並且在日本政界、經濟界和科學界有很深的人脈。慣用手法是操控重要人物的生死，再暗中以金錢收買，開發謎樣的藥物以及足以影響全人類未來的程序。
組織的代表顏色為黑色，其成員都穿著黑色的衣服。除Boss外，主要成員都以酒名作為代號。內部有非常嚴格的紀律，不合格的成員、暴露組織身份的成員和背叛組織的成員都會被很快剷除，做事不會留下絲毫痕跡。而且保密性極強，即使成員之間也未必互相認識。
組織成立目的同樣不詳。成立時間不少於半個世紀，表現在TV 130《競技場無差別脅迫事件（前篇）》灰原的自言自語：“工藤君，也許你不知道，你已經深深地介入到我們組織從半世紀前就開始的秘密計劃當中了” 。從時間上推算，灰原說這句話大概在1995-1996年左右（按照柯南世界的時間）。往前倒推50年，剛好就是1945-1946年，這個時期剛剛好是二戰結束日本戰敗的一年以內。
計劃了半個世紀到底目的是什麼？根據他們研究出的APTX4869，該藥主要作用是誘導程序性細胞死亡，但同時強化端粒酶的活性，從而增加細胞的增殖能力。 一般情況下會導致服用者死亡，卻因為細胞自我破壞程式的偶然作用，使除了神經系統以外的骨骼、肌肉、內臟、毛髮的全部細胞都退化到了幼兒時期。研究該藥肯定不是為了製造毒藥，而是為了通過該藥控制或者籠絡一些人，根據上面推理出的那個時間，黑衣組織的頭領很有可能是某位軍國主義的頑固分子，為了日本帝國統一世界而研製APTX4869來招兵買馬然後用某種程序造成破壞或者用來控制人類。
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動漫三分鐘
說到《名偵探柯南》，最讓我們深刻的就是柯南的破案能力和黑暗組織的強大。
看過動漫的小夥伴都知道，黑暗組織裡的成員全是以酒來命名的。據我猜測可能大BOSS喜歡酒（僅代表自己觀點）
看了九百多集的柯南，我們不禁猜想這個組織為什麼要要研發APTX4869這種藥物呢
我記得我看過一個猜想，是我覺得最貼合真相的，結合一些自己的看法講述一下
-----APTX4869-----
APTX4869的主要作用是誘導程序性細胞死亡，同時強化端粒酶的活性，從而增加細胞的增值能力。因為這個藥物暫時還在研發階段，無法保證藥性，所以一般情況下會導致服用者死亡。但新一和雪莉卻是特例，因為細胞自我破壞程序的偶然作用，使他們在除了神經系統以外的骨骼、肌肉、內臟和毛髮的全部細胞都退化到了幼兒時期，從而變成了柯南和灰原。
從組織一開始就沒大面積的使用這種藥物，足以證明組織不是為了製造毒藥，更大可能性的是要保持這種藥性從而達到控制或者籠絡一些人的目的。
----黑暗組織----
而且在劇集中，黑暗組織有很多次暗殺行動，除了背叛者都是針對的政府高官，所以可以證明他們的目的是政府人員。暗殺畢竟目的性太大。如果是讓他們突然消失，對組織的危險性就會小很多。
一般有這種行為和想法的人，不是特別極端的人就是覺得自己是救世主的人，根據劇中灰原對柯南說：“工藤，你還不知道吧，組織跟半世紀前的計劃就有關係”，說明這個組織存在的時間很長了，按照劇中的時間，灰原說這句話的時間是在1995—1996年間，往前推50年，剛好就是1945—1946年，這個時間剛好是二戰之後日本戰敗的一年之內，而且根據劇中黑暗組織的表現，我們可以知道他們非常訓練有素，足可見其正規性可以和軍隊媲美，所以可見該組織是為了特定目的性專門花費大量人力物力訓練出來的殺手，說明目標群體強大。
------猜想------
所以猜測，這個黑暗組織的大BOSS是不滿日本的政府，是想重新換血，重新制造一個新的日本。所以製造APTX4869是為了想把他們籠絡到手或者是直接變小消失，製造一個按照自己意願創立的新的政府。他是把自己當做一個救世主了。
（僅代表自己觀點，喜歡動漫的小夥伴可以一起討論）
好街區
黑衣組織的成立的目的在原著中並沒有完全的說明，但可以從一些片段中能多少了解一些他們的“業務”範圍。
首先是灰色交易。在琴酒和伏特加第一次登場的時候就出現在遊樂園交易，與某公司經理赤進行裸裸金錢交易，可惜被工藤新一撞見，不過也順利的完成了交易。
其次就是殺人越貨，主要對目標人物進行暗殺行動，經常是通過團隊行動，暗殺的目標包括普通人或者政府官員等，尤其是暗殺土門康輝這個角色，只要是妨礙了組織的利益，都會想辦法把目標剷除掉。
最後就是最重要的藥品研究，這個“業務”從組織成立起就在實行，並且有了一定的實質成果-銀色子彈，並且在宮野夫婦後，宮野志保的後續研究中也研製出APTX4869藥品，從藥效可以看出，完全是為了殺人制作的。
從這些信息可以看出，黑衣組織成立的目的，最初還是在藥品的研究，在隨後幾十年的變遷了，逐漸演變成黑暗勢力，成為跨國的犯罪集團，大概是目的實現了，犯罪就成為了主要業務。
泡麵菌
不以統治世界為目的組織不是好的黑衣反派，參考一下雜燴飯大王，一開始還能治住小悟空，後期悟空秒天秒地秒空氣，還想統一世界呢，雖然最後用了七龍珠把悟空變小，不過那也是為了掃除統一世界的絆腳石。
