首先，国家支持微生物肥料发展，同时鼓励进行微生物肥料在“土壤调理”方面的技术研发。生物产业是我国七大战略性新兴产业之一，生物肥料部分则是生物产业的重要部分。
2012年12月国务院发布《生物产业发展规划》，微生物肥料被纳入到“农用生物制品发展行动计划”，明确提出要加快突破“保水抗旱、荒漠化修复、磷钾活化、抗病促生、生物固氮、秸秆快速腐熟、残留除草剂降解及土壤调理”等生物肥料的规模化和标准化生产技术瓶颈，提升产业水平。
其次，我国的微生物资源具有菌种资源丰富、微生物肥料产品种类繁多、应用范围广泛的特点。
丰富的微生物资源为发展微生物肥料产业提供了保证，同时我国微生物种类多样的特点又与土壤中的污染物种类较多的现实相对应，可以修复土壤中的多种污染物。
近年来，以秸秆腐熟剂、生物有机肥为代表的微生物产品在农业上广泛运用，为土壤生态修复立下汗马功劳。
目前，全国微生物肥料年产突破1000万吨，应用土地面积超亿亩。
最后，微生物肥料具有“四两拨千斤”的独特功能，既能活化土壤，提升肥效，又能保障农产品质量安全，是农业可持续发展不可缺失的投入品。
同样，微生物肥料功能多样，能够充当分解者（秸秆分解、土壤有毒有害物质降解）、转化者（磷、钾、钙、镁等养分的有效形态转化）、生产者（生物固氮、产生各种促生物质）等。
所以，微生物肥料的前景非常大！
其实在中国，微生物肥料已有50余年的历史，经历了从根瘤菌剂—细菌肥料—微生物肥料的发展演变过程。目前，市场最多见的微生物肥料主要分为微生物菌剂、复合微生物肥料和生物有机肥三类。
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