一說起分校，很多朋友可能會馬上想起“三本”、“民辦”，其實，這是一種以偏概全的誤解。目前，人們在稱謂上習慣把“分校”和“分校區”統稱為“分校”，其實二者有顯著差別。
區別
分校：大多是與“本校”在教學管理方面相獨立的辦學機構；
分校區：大多是指與“本校”除地理區位不同外其餘方面皆保持一致的“本校分部”，在各方面都直接受“本部”領導。
分校
根據形成過程來進行劃分，“分校”一共可以分為三類。
第一類：大學合併潮的產物
產生於“大學合併潮”並隸屬於“本校”，實際上基本保持獨立運行的“分校”。
本世紀初的大學合併，主要是將專業性較強的大學向有實力的綜合性大學合併，進行合併的學校在合併前地理位置並不重疊或臨近，合併後就轉化為了實際上的“類分校區”。一些院校經過資源重組往往會把相近的專業放在一個“分部”，此類合併學校的“分校”一般獨立性較強，實際上相當於“只是換了塊牌子”，因此在招生以及學制、行政管理方面都擁有極大的自主權。
第二類：與地方政府合作開辦
由學校本部與地方政府合作開辦，隸屬於“本校”卻基本獨立運行的“分校”。
此類“分校”由於相關政策有待完善，在性質認定的方面存在較大差異。例如，北京師範大學珠海分校是由北京師範大學與珠海市政府合作建立，教學方面長期引進本部教師進行合作，分校黨委書記由本部黨委副書記兼任。
雖然北京師範大學珠海分校官方始終不承認珠海分校為獨立學院（本科第三批），而稱之為“按獨立學院方式運作”，但實際在教育部，珠海分校已被歸類為獨立學院，並且連續六年參加了全國獨立學院排名的評選。
類似的還有北京工業大學實驗學院與北京工業大學的關係。雖然北工大實驗學院可以在北京一本招生，但是畢業證和學位證上還仍然擺脫不了實驗學院的所屬。
然而，在同樣屬於校本部與地方政府共建高等教育機構，山東大學威海分校卻成功轉化為山東大學“分校區”，在各類學歷學位證書方面實現了完全一致，並且不屬於“獨立學院”之列。
第三類：與民間資本合作開辦
由學校本部與民間資本合作開辦、完全獨立自主運行的“獨立學院”。
獨立學院具有獨立的校園和基本的辦學設施，實施相對獨立的教學組織和管理，獨立進行招生，獨立頒發學歷學位證書，獨立進行財務核算，具有獨立法人資格，即基本相當於一個獨立的學校。
目前，獨立學院（也叫二級學院）所頒發的學歷和文憑在社會認可度上低於公立院校（一級學院），由於大部分獨立學院主要還是在本科第三批次招生，少量獲得本科第二批次招生資格，其生源質量相對於一級學院還是有一定差距。
例如，廈門大學嘉庚學院歷年錄取分數線均低於本部150分以上，主要招收本科第二批次和本科第三批次考生。同時，其畢業生畢業後也將獲得的學院獨立頒發的學歷和學位證書。
最關心的畢業證問題
第一類和第二類“分校”畢業生的本科畢業證書由校本部統一頒發，證書的封皮樣式和文字與校本部毫無差別，證書內芯同樣加蓋本部公章和本部校長印。證書內芯的文字表述有兩種方式：
第一種與校本部完全一致，如北京大學醫學部、山東大學威海分校等。
第二種表述與校本部稍有不同，文字上會註明“某某校區”或“某某分校”，如北京工業大學實驗學院頒發的本科畢（結）業證書，內芯上將註明“在我校實驗學院某某專業學習”。
第三類“分校”，即由學校本部與民間資本合作開辦、完全獨立自主運行的“獨立學院”，頒發的畢業證與學位證都是獨立學院的名字。不過，憑藉強大的民間資本的介入，其在校園硬件建設、教學管理、學生服務等方面通常並不落後甚至還要優於前兩類“分校”。
分校區
明顯區別於“分校”的是，“分校區”大多指“本校分部”，即“分部不分校”，“分校區”在各方面都直接受“本部”領導，不存在獨立運行的狀況。
例如，復旦大學在上海主要分為邯鄲路校區（主校區）、楓林校區（醫學院）、張江校區（微電、軟件、藥學）、新江灣城新校區（法學），四個校區間學生除就學位置外其餘待遇皆一致。
鄭州大學分為南校區（大學路）、北校區（文化路）、新校區（科學大道），三個校區間學生除就學位置、就讀專業外，其餘待遇皆一致。
建立“分校區”也可能是學校經過長期發展出於自身教學建設的需要，將研究生與本科生分在不同校區培養，像南方醫科大學、浙江中醫藥大學就屬於這種情況，分校區畢業生與本部畢業生在各方面也享受同等待遇。
分校VS分校區辨別？
區別所謂分校或獨立學院與“分校區”的重要方法，就是查看其招生辦法。
大學“分校區”一般沒有獨立招生的權力，其生源主要依靠校本部統招，再根據專業和年級分配到各個校區，因而生源質量有極好的保證。
與此不同，分校（獨立學院）的招生工作基本獨立於校本部，通常在招錄分數線上要低於本部。
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