一、不重視有機肥和菌肥的施用
有機肥施用不足，化肥用量過多，土壤有機質含量低，導致土壤板結、酸化嚴重，很多果樹出現錳中毒現象。
二、過多施用未腐熟的雞糞、牛糞、羊糞、豬糞等動物糞便。
沒有經過發酵的糞便含有大量的有害菌、鹽分、激素和火鹼，長期施用導致果樹燒根現象時有發生，對樹體傷害很大。
三、偏重施用化肥
多數果農認為有機肥長樹長果沒有勁，單選一些氮、磷、鉀含量高，比例不合理的化肥，造成果樹病害多。
四、不重視中量、微量元素的施用
果園要平衡施肥，果樹正常生長必需中微量元素，缺乏就會影響果樹的正常代謝，直接影響果樹的產量和質量。
五、施肥方法不正確
生產中多數果農秋施基肥過淺，過於集中，且不和泥土混拌。一般正常施肥深度為30-50cm，部分果農僅施地下10-15cm，致使化肥揮發嚴重、利用率低，樹根上浮，抗旱、抗寒能力下降，最終導致根系死亡。
六、秋施基肥過晚或不施秋肥
蘋果基肥應在採收前後至落葉前施，秋施基肥重在一個“早”字，9月份溫度高，肥料入土後轉化快、利用率高，斷根後癒合快。施肥時間過晚，土壤溫度過低，果樹不能充分吸收養分，影響樹體營養積累，直接導致來年的葉、花、果不能正常生長，產量和質量都會大幅度下降。
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