“祝賀你們在最後兩天中取得的光榮成就”，儘管尼米茲向弗萊切發出了這樣的電文，但珍珠港的司令部中籠罩著陰鬱的氣氛，因為列剋星敦號沉沒了，但日本聯合海軍受到了多大的打擊還很難判斷。
但從戰略的角度，珊瑚海對無論對美國、對太平洋戰局、對世界海戰史都有深刻的意義。
首先，作為大戰前的序幕，儘管參加這次作戰的軍艦並不算多，交戰的規模不是很大，其激烈程度也不算很高。但珊瑚海海戰是第一次航空母艦之間的決鬥。眾所周知，以往的近代海戰，都是雙方軍艦接近到較近距離之內，而後用艦炮解決問題，珊瑚海海戰則全然不同，雙方的軍艦，沒有開炮或者發射魚雷，也沒有進入對方的視線之內，而是從上百海里以外的遠距離用所攜帶的艦載機來取勝。對於這樣的交戰，在世界海戰史上尚屬首次，可是並不是偶然，而是航空技術與兵器發展的必然結果。這種海戰為太平洋戰爭指出了方向。既然如此，誰能更快地更深刻地認識這一新的特點，相應地改進自己的作戰力，誰就有可能在交戰中取得較多的主動權，從隨後的發展看，顯然聯合艦隊發現這一點時已經為時以晚了。
第二，從戰術得失來看，美方被擊沉一艘大型航空母艦列剋星敦號、一艘油輪、一艘驅逐艦、65架飛機、死亡543人，另一艘航母約克城號受傷；日本損失一艘輕型航母、69架飛機、死亡1074人、另一艘航母受傷。從數字的角度，日本海軍顯然取得了珊瑚海海戰的戰術上的勝利。但是，再看遠一點，假若把1942年5月第一週週末發生的珊瑚海海戰的後果同後續的事件聯繫起來，那麼美國毫無疑問取得了決定性的勝利。弗萊切海軍少將的部隊成功地挫敗了日本南下控制珊瑚海和澳大利亞的海上通道的戰略計劃。自從珍珠港事件以來，日本海軍不可戰勝的神話第一次遭到沉重的心理打擊，這是一個使戰略力量對比發生重大變化的事件。
有部分軍事學家認為珊瑚海海戰是美軍第一次與日軍陸海空正面對抗，使其基本摸清了日本海空軍作戰特點和戰略意圖這為後期中途島戰役全面扭轉太平洋戰爭形勢起到了非常關鍵的作用，同時戰役的勝利挫敗了日本全面封鎖澳大利亞的企圖，從戰略上遏制住了日軍的進攻勢頭。
尼米茲宣佈這是“一個具有決定性深遠意義的勝利”。意義究竟多麼深遠，他在後來的一個月裡還無從知道。其實說得具體一點，翔鶴號受損、瑞鶴號嚴重減員，而第五航空戰隊的這兩艘航母原本要參加中途島計劃，但以無法實現了。那麼從算術的角度，珊瑚海海戰的對隨後太平洋戰爭進程的直接影響就是，用一艘航母的沉沒換取了兩艘航母不能參加中途島戰役。否則在中途島美日航母的比例將是4比6，而不是3比4，而從1個月後的中途島大戰看，這種差別絕對是非常重要的。
珊瑚海海戰是海戰史上第一次航母之間的較量，也幾乎是太平洋戰爭中最公平的一役，其中基本反映出雙方的戰鬥力。它可以說是太平洋史詩最恰到好處的一個引子。如果聯合艦隊是第一或第二航空戰隊參加珊瑚海海戰，那麼約克城號很有可能就回不到珍珠港，這樣中途島戰役後美國會有很大壓力；如果美軍沒有自作聰明地去襲擊東京，那麼美國就可以有四艘航母參加珊瑚海。雖然不能保證完勝，但損失也不至於失去一艘航母，那麼在中途島中也就多了一份勝利的希望。
儘管那麼恰到好處，但與每一戰役一樣，珊瑚海的戰爭仍是冰冷和殘酷的，下面就是一個例子：
在列剋星敦號的水手們同飛行甲板底下深處的可怕景象進行一場不可能取勝的戰鬥時，約克城號也中彈了，密碼室已被一顆炸彈炸得粉碎，雷達失去了效用，俯衝轟炸機攻擊隊隊長奧爾特海軍中校和他的報務員在攻擊翔鶴號後返航時飛機受損，並發現自己處於飛行員的最危險的境地－在蒼茫大海的上空迷失了方向，而油位指針在零度上面晃動。奧爾特可以用無線電呼叫到約克城號--
約克城號：最近的陸地在兩百英里開外。
奧爾特 ：我們永遠到不了那裡。
約克城號：靠你自己了。祝你順利。
奧爾特 ：請向列剋星敦號轉達。我們把一顆一千磅的炸彈丟到一艘軍艦上了。我們兩人都報告了兩、三次。敵人戰鬥機飛來了。我改向北飛行。請告訴我你們是否收聽到我的話。
約克城號：收聽到了。靠你自己了。我將轉達你的話。祝你順利。
奧爾特 ：好，再見。我們的一顆一千磅的炸彈擊中了一艘軍艦！
這是人們最後一次聽到比爾·奧爾特中校的聲音。
歷史上第一次航母和航母的對決， 是第一次雙方艦隊在視線距離外進行的海戰，也是第一次雙方戰艦沒向敵軍戰艦開火的海戰。
美國海軍從中深刻地感受到航空母艦編隊作戰將是未來海戰的主要模式，於是開始大力在隨後的實戰中進行推行，並最終贏得了太平洋戰場上的勝利。
這是一場歷史上從未有過的海戰，雙方艦隊都是在雙方視距之外進行交戰的。從戰術上看，珊瑚海海戰可以說是日軍略勝一籌。雖然日軍飛機和傷亡人數多於美國，但他們以損失1．2萬噸“祥鳳”號和在圖拉吉島外圍被擊沉幾艘小艦的較小代價，換取了擊沉“尼奧肖”號、“西姆斯”號和3．3萬噸大型航空母艦“列剋星敦”號的勝利。然而從戰略上看，則是美國贏得了勝利。開戰以來，日軍的武力擴張第一次遭到遏制，進攻莫爾茲比港的作戰計劃只得向後推遲。更為重要的是，被擊傷的“翔鶴”號航空母艦需要修理，損傷慘重的“祥鳳”號需要重建，大大削弱了日方在即將舉行的中途島海戰中的實力。
雖然從數字角度來看，美國的損失比較大，但美軍成功挫敗了日軍繼續南下的企圖，因此這場海戰的最大贏家仍然是美國，日本海軍不可戰勝的神話第一次遭到了沉重打擊。
珊瑚海海戰是太平洋戰場上戰局發生逆轉，進入戰略相持階段的標誌。尼米茲曾打算讓弗萊徹艦隊留在珊瑚海，因為哈爾西正在迅速趕往珊瑚海，可以把“約克城”號及其護衛艦併入第衛6特混艦隊，以尋找新的戰機。但是，他最終放棄了這一想法。他那富有戰略素養的目光已經投向了即將展開的中太平洋遭遇戰。於是，他命令“約克城”號必須儘快得到修繕，以便以較完整的陣容投入新的決戰。同時，尼米茲命令潛艇部隊對受傷返航的日航空母艦發動襲擊，又向普吉特海峽海軍船廠發報，敦促他們加速修復“薩拉託加”號，以備急需。
5月10日，日軍採取了一次軍事示威行動，意在挽回珊瑚海戰中丟失的面子。他們派一支部隊佔領了大洋島和瑙魯島這兩個島嶼。尼米茲將計就計，電令哈爾西趕赴東所羅門群島500海里內的海域。讓“大黃蜂”號和“企業”號及第16特混艦隊擺開陣勢，意在迷惑對方，使日軍相信太平洋艦隊的所有航空母艦都已抵達南太平洋，從而牽制日軍北上進攻的兵力。此招果然奏效，日進攻部隊發現美航空母艦之後，慌忙撤出了所佔島嶼，並在南太平洋海域排兵佈陣。至此，有關珊瑚海海戰的煙雲完全消散，日美雙方開始在表面的平靜中醞釀新的攻勢。
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