曾經，西班牙與葡萄牙二分天下。而目前，葡萄牙海軍實力在歐洲排名靠後，兵力規模僅有1.16萬人，主力艦多為外國建造或者是二手貨。
艦隊分設5個海區司令部，分別是大陸北部海區、中部海區、南部海區及亞速爾群島海區和馬德拉群島海區司令部，1個海軍作戰司令部(設在里斯本)和1個陸戰隊司令部。海軍基地設在里斯本，另在大陸北部的雷雪爾斯和南部的波爾蒂芒各設1個勤務支援點。
主力艦艇一半是德國建造，一半是荷蘭、丹麥淘汰的二手艦，主要包括5艘護衛艦、3艘法國造潛艇，及部分巡邏艦。其中主力是3艘“瓦斯科·達·伽馬”級，原型為德國Mako-200級，具有完善的作戰能力。
另一大主力為荷蘭的二手卡雷爾多爾曼級護衛艦，數量為2艘。這型經典護衛艦具有均衡的作戰能力，不過總體設計已經落後於時代。
作為少數擁有海外屬地的國家，葡萄牙海軍擁有3型巡邏艦，分別是6艘安東尼奧•埃內斯級、4艘巴蒂斯塔•德•安德拉德級、4艘胡阿•貝羅司令級。
這三型艦總體設計、主要尺寸類似，以火炮為主要武器，擁有短橋樓與連續的上層建築，以獲得良好的居住空間。續航力也均很大，達到5000海里以上。
這3型艦陸續退役後，接替者是是採用了隱身設計的維亞納堡級巡邏艦，艦體更為豐富簡潔。
自2104年，葡萄牙海軍還引進了4艘丹麥的二手飛魚級導彈艇。飛魚級是世界上最為經典的模塊化艦艇，採用可插拔的反艦導彈、防空導彈等武器模塊。
不過，葡萄牙的版本並沒有昂貴的武器模塊，葡萄牙海軍僅將這型經典艦艇降格為巡邏艇使用。
相對於泛泛可陳的主力艦隊，兩棲艦船、輔助艦船也極其有限，是一支以維護自身利益為使命的實用型艦隊。
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