干彬
这里有一个错误的表述，楼主认为可以发两次年终奖，但是在税法的概念中，只有一次是真正意义的年终奖，另一次发放的只能以工资薪金对待，因为税法规定年终奖和工资的计税方式不同。
税法规定: 纳税人取得全年一次性奖金时，用全年一次性奖金➗12，按其商数确定税率和速算扣除数，如果发年终奖的当月，员工工资低于起征点，应该用年终奖-( 起征点-当月工资)后确定年终奖适用税率和速算扣除数。
图表: 最新个人所得税率表
下面我举个例子可以让大家更好地理解年终奖的计税方式和普通工资计税的不同。
年终奖的计税方法
假设员工当月要发的年终奖为3万，个税起征点为5000元，按照发年终奖当月工资是否超5000起征点，分为两种情况讨论:
A.当月工资高于5000
假设发年终奖的当月工资为6000元，那么3万元年终奖的个税需要缴纳的金额为30000/12=2500，适用税率3%，个税为30000×3%=900元。
B. 当月工资低于5000
假设发年终奖的当月工资为3000元，那么按照上述税法规定，3万元年终奖的个税需要缴纳的金额为［30000-（5000-3000)］/12=2333，适用税率3%个税为(30000-2000)×3%=840元
所以，如果要发两次年终奖，只有一次是按照上述计税方式进行扣税，另外一次必须按照工资薪金扣税。
举例说明一下，如果员工当月工资6000元，已经发过年终奖了，你还要再发一次3万的年终奖（你认为的年终奖，实际税法不认可的），按照适用税率和速算扣除数，该员工本月需要缴纳的个人所得税为(30000+6000-5000)×25%-2660=5090元
所以楼主认为的年终奖分两次发需要缴纳的个税金额是存在很大差别的，为了避免多交税款，建议遵守法律，一次性发放，关于发放年终奖的计税方法请参照:
国家税务总局国税发[2005]9号文件。
笔记簿杏豆
税法规定，年终一次性奖金的计税方法，一个年纳税度内只能享受一次。如果某公司将年终奖金分两次发放，只能选择其中一次作为年终奖金，将这次的奖金除以12个月，按所得的商所在的应纳税所得额区间，找到对应的税率及速算扣除数，计算应纳个人所得税。另外一次奖金，则应与发放该奖金当月的工资薪金收入合并，计算个人所得税，不再享受一次性奖金的优惠政策。
年终一次性奖金政策，是以奖金金额除以12，找税率，相当于把奖金分解到全年每个月，其对应的税率较低，能最大幅度降低税负，也是个税最安全、最利于税收筹划的税收政策。建议扣缴义务人统筹个税纳税人的工薪收入，找出一次性奖金应纳税所得额的边际，使纳税人最大程度享受年终奖的税收优惠政策。
玄真子桑
税法规定每年只能申请一次发的工资作为年终奖，发两次可以以多的那次为年终奖，另外一次只能按照正常工资
