腳腐病，又叫裙腐病和褐腐病。發病橘樹根頸部皮層死亡，引起樹勢衰弱，嚴重時可致整株死亡。有時也可侵染樹冠下部的果實，在發生澇害後果實可受嚴重
為害。
開始發病時，病部樹皮呈水漬狀，發出酒糟氣味，皮層呈褐色，流出膠水。氣候乾燥時，病斑乾裂；氣候適宜時，病斑迅速發展，使樹幹一圈均腐爛，上下輸導作用被割斷，造成植株枮死。病樹部分大枝上或整個樹冠的葉片的中脈與側脈呈黃色，造成落葉。開花多而花期短，所結果實著色早，皮粗味酸。
1、用有較強抗病性的枳與酸橙作為砧木，是防治此病的根本途徑。對已發病樹也可用這兩個品種的苗木進行靠接換砧，特別是幼年樹效果更好。
2、對抗病砧木嫁接時，也要提高嫁接部位，定植不宜過深，使易感病的接穗部分離地面較高，以減少感病機會。
3、注意柑桔管理，及時防治樹幹害蟲，保持果園排水良好。
4、刮除腐爛皮層及已變色木質部，然後塗以1：1：10波爾多漿，或2％－3％硫酸銅液，或80％乙磷鋁可溼性粉劑100－200倍液，或25％瑞毒黴可溼性粉劑400倍液，或多效黴素8－10倍液加20×10ˉ6的2,4–D鈉鹽溶液。也可在木質部用刀縱劃數條刻痕，每條刻痕相距1－1.5釐米，再塗以50％託布津、多菌靈可溼性粉劑等100－200倍液。
5、果實將轉黃時，在地面鋪草，防止土壤中的病菌被雨水擊濺到枝葉及果實上。或用竹竿等將近地面枝葉撐起，使其距地面1米以上，並在地面及樹冠下部噴灑0.7：0.7：100波爾多液，或50％多菌靈可溼性粉劑1000倍液，以保護果實，避免褐腐。
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