根據《蘇德互不侵犯條約》和《秘密議定書》，1939年9月1日，德國發動了入侵波蘭的戰爭，迅速佔領了它的西部領土。9月17日，蘇軍越過蘇波邊界，迅速佔領了波蘭東部領土——西白俄羅斯和西烏克蘭。9月28日，蘇德簽訂了《蘇德邊界友好條約》，就兩國共佔波蘭秘密達成協議。11月1日和2日，蘇聯最高蘇維埃也通過決議，將西白俄羅斯和西烏克蘭併入蘇聯相應的加盟共和國。至此，波蘭第四次被瓜分，從歐洲政治地圖上消失。
當第二次世界大戰進行到1941年下半年，國際形勢又發生了劇烈的動盪和變化。1941年6月22日，德蘇戰爭爆發後，1941年7月30日簽訂了《蘇波互助協定》。在蘇波協定中，蘇聯政府籠統地承認1939年蘇德關於變更波蘭領土的條約已歸於無效，但卻迴避了1921年蘇波條約中所規定的蘇波邊界（寇松線）是否繼續有效的問題。因此，蘇波邊界爭端仍懸而未決。
蘇波邊界問題是反法西斯盟國內部一個極端敏感的問題，也是一系列紛爭的重要根源。大戰到1943年夏庫爾斯克戰役後，蘇軍開始轉入全面反攻,到年底已經形成解放全部國土和出國作戰的局面。於是在1943年11月底和12月初，蘇美英三國在德黑蘭舉行了戰時首次政府首腦會議，商討並決定了對希特勒德國作戰的若干重大事宜。這次會議也初步討論了至關重要的波蘭邊界問題。
至12月1日的全體會議上，丘吉爾率先以三根火柴形象地表達了他對戰後波蘭邊界的看法,即“第一根代表德國，第二根代表波蘭，第三根代表蘇聯。這三根火柴都應該向西撥動，以解決盟國面臨的一項主要任務——確保蘇聯西部邊界的安全”。當斯大林裝作漫不經心的樣子，追問丘吉爾所講的三根火柴究竟是什麼意思時，後者便回答說:“我們認為，波蘭的要求無疑應該由德國去滿足”。
於是斯大林也毫不含糊地聲稱：“烏克蘭的領土應該歸還烏克蘭，白俄羅斯的領土應該歸還白俄羅斯。也就是說，我們與波蘭之間的邊界線應是1939年的邊界線，就是我國憲法規定的邊界線。蘇聯政府堅持這條邊界線，認為這是正確的。”羅斯福和丘吉爾對此均未表異議，只是以為斯大林所說的實際上便是寇松線，並且一起根據地圖進行了核實。
三大國首腦有關波蘭東部邊界的協議一經傳出，就遭到以米科拉伊奇克為首的波蘭流亡政府強烈表示反對，併為此開展了一系列的外交活動。1944年2月15日，米科拉伊奇克把流亡政府拒絕承認寇松線為戰後波蘭東部邊界的決定正式通知英國政府。邱吉爾得悉後暴跳如雷，並在2月22日下院所作的演說中公開宣稱，他本人認為蘇聯對蘇波邊界的要求是正當合理的。
就在米科拉伊奇克為波蘭東部邊界四出奔走時，波蘭國內的局勢發生了很大的變化，隨著蘇軍深入波蘭境內，1944年7月22日成立了由波蘭工人黨（原共產黨）領導的波蘭民族解放委員會，8月2日便和蘇聯建立了外交關係。12月31日，波蘭民族解放委員會改名為波蘭臨時政府，工人黨領袖貝魯特出任總統，並隨即得到蘇聯的承認。
正是在波蘭邊界問題懸而未決，又出現兩個波蘭政府的情況下，於1945年上半年，蘇美英三國在克里米亞半島召開了雅爾塔會議。如果說在德黑蘭會議上談及波蘭問題時氣氛還比較輕鬆的話，那麼在雅爾塔會議上，氣氛就比較緊張了。正如丘吉爾所說的雅爾塔會議的八次全體會議中，至少有七次討論到波蘭。
羅斯福出於內外政策考慮，在會上一開始就表示贊同以寇松線為蘇波邊界，但希望在其南部稍作修改，即利沃夫和加里亞油田劃給波蘭。對此，斯大林進行了激烈的反駁，斯大林希望波蘭能在西部取得土地補償，還明確要求波蘭的西部邊界應延伸至西尼斯河。英國早已同意以寇松線作為蘇波邊界，至於波蘭的西疆，從德國東部已處於蘇聯軍事控制之下這個現實出發，不得不勉強同意奧得一尼斯河線作為德波邊界，爭論的只是邊界定在東尼斯河還是西尼斯河。丘吉爾的論點是，波蘭的西部邊疆不能過於擴增，否則會帶來種種危險。
蘇聯在波蘭邊界問題上的立場是堅決的，即必須劃定在寇松線。因為這是確保蘇聯西部邊界“安全”所絕對必要的。證據是歷史上波蘭從來就是敵人藉以進攻俄國的走廊，必須堵塞這條走廊。關於波蘭西部的新邊疆，蘇聯的提案建議，“波蘭西部的邊界線應從什切青市起，沿奧得河向南，再沿尼斯河（西尼斯河）下行。對於蘇聯的提案，經過激烈的爭論，英美方面表示基本同意，
最後，雅爾塔會議的公報在波蘭那一段中，對邊界問題作了如下聲明：“三國政府首腦認為，波蘭的東部邊界應以寇松線為準，而在若干地區作出有利於波蘭的五至八公里的外移。三國政府首腦承認，波蘭北部和西部的領土應有較多的擴增。”
雅爾塔會議文件公佈後，波蘭流亡政府指責把寇松線強加在波蘭身上是對波蘭進行“第五次瓜分”，堅決拒絕接受。1945年7月下旬召開的波茨坦會議上，有關波蘭西部邊界問題的爭論仍很激烈。杜魯門和丘吉爾都強調美英雙方在雅爾塔會議上僅同意“波蘭西部和北部領土應有較多的擴增”，並未作過其它具體的許諾，因而也就無法接受蘇聯把西尼斯河為波蘭西部邊界的建議。
杜魯門聲稱如果原來是德國一大片領土被劃歸波蘭，那末美國將來又到哪裡去索賠？斯大林反唇相譏：“你何必老是那麼擔心賠償呢？我們可以不要這些地區的賠償嘛！”丘吉爾則擔心一旦幾百萬德國人離開原來居住的地區，以後他們將弄不到足夠的糧食。斯大林回答很乾脆，德國人歷來吃進口糧，以後也可以向波蘭人買糧食。丘吉爾還提到德國失去西里西亞後，燃料也會成問題，斯大林便提醒說，德國西部有燃料基地，不必為此操心。
以貝魯特總統為首，包括米科拉伊奇克在內的波蘭代表團趕到波茨坦，參加了7月24日的三國外長會議。貝魯特在會上指出：波蘭本來是個擁有38萬8千平方公里土地的國家。但是現在即便把新邊界遠遠向西延伸，推至奧得河和西尼斯河沿岸，波蘭也不過是一個只擁有30萬9千平方公里土地的國家。如果要保持戰前的人口密度，那末波蘭至少也要有31萬4千平方公里的國土。因此波蘭代表團成員都一致強調波蘭的西部邊界定在西尼斯河是完全合理的。
最後會議的公報是這樣規定的：“原德國的東部領土，即自施維納明德稍西的波羅的海起，沿奧得河至西尼斯河會合處，再沿西尼斯河到捷克斯洛伐克邊界，包括按柏林會議決定不歸蘇聯管轄的部分東普魯士和以前的但澤自由市，均由波蘭政府管轄。”®但是，會議文件對這條邊界的最後劃定，作了某種保留：“三國政府首腦重申他們的主張，認為波蘭西部邊界的劃定，應待和會解決。”由於對德和會始終未召開，直至1950年東德才承認奧得河一西尼斯河為波蘭西部邊界；西德直到1970年才表示接受三大國在波茨坦確定的有關德波兩國邊界的協議。
在兩德統一過程中，1990年9月12日在莫斯科舉行的最後一輪“二加四”外長會議上，簽署了《最終解決德國政府問題的條約》，其中規定：兩德現有領土的邊界為永遠邊界；德國和波蘭將根據受國際法約束的一項條約確認兩國間的奧得一尼斯邊界。至此，波蘭邊界問題劃上了一個句號。
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