當前辣椒生產中問題較多，有的不坐果，有的死棵嚴重，管理上應把好以下三關，爭取豐收。
防死棵
及時進棚觀察，發現棚內有植株萎蔫，可能發生了根部病害，可以用甲霜靈、
黴靈、松脂酸銅和生根劑灌根，連灌2次。對萎蔫的植株澆水時，四周要用土擋起來，以防病菌隨水傳播。除根部病害外，疫病、莖基腐病、軟腐病等莖基部病害也易引起辣椒死棵，應注意防治。此外，應注意在每年夏季高溫悶棚，消除棚內病菌，必要時用藥處理土壤。注意施用生物菌肥。
保花保果
辣椒坐果前會出現旺長現象，多留果可以適當控制植株旺長。辣椒果實開始膨大後，應及時疏除畸形果，只保留果形周正的3～4心室果。根據植株長勢適量留果，四主枝整枝的在4根主枝都留果的情況下，每根主枝留1～2個果，留下的果均勻分佈在結果主枝上。合理疏除分佈在植株頂部和中下部的過密花和果。
防皴皮果
放風不當是造成皴皮果的主要原因。春季早晚氣溫低，晝夜溫差大，夜間蔬菜葉片和果實表面會形成露水，第二天上午不能放風過早或一次性放風過大，以免造成皴皮果，應分次放風。上午拉開草苫，在棚內溫度回升時扒開5釐米的縫隙通風換氣，保持15～20分鐘後關閉，棚溫升高至28～30℃時逐漸加大通風量。皴皮果的產生還與缺硼有關，硼元素供應和吸收不足易加重果實皴皮，應及時補充硼肥，提高果實韌度。在開花前噴施速樂硼等硼肥，連噴2次。通過覆蓋地膜、行間鋪草、使用微灌設施等措施，可以降低棚內溼度，減少果面結露，避免皴皮果發生。在辣椒核桃大時套透氣的塑料袋，能防止發生皴皮果和爛果。
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