1、深翻土壤，增施充分腐熟的有机肥
对土壤进行深翻是消除土壤板结、增加活土层的基础。在深翻的同时，大量施入充分腐熟的有机肥，不仅可以给芸豆提供长效多元素的营养，同时还可以改良土壤结构，提高土壤理化性能，为芸豆的生长提供具有良好通透性和缓冲能力的土壤条件。
2、培育多根苗和护好幼苗根系
芸豆的基本根系是在育苗期形成的。育苗期间，培育根系发达的秧苗，并在育苗过程和移栽时，保护好这些根群，不仅可提高成活率，缩短缓苗期，也为早熟高产奠定良好的基础。从护根的角度来看，因为芸豆根系木质化程度高，发生木质化时间早，伤根后难以再生，所以采用穴盘、营养钵、塑料筒或纸袋等容器育苗是非常必要的。同时，芸豆茎基部有生不定根的能力，尤其是幼苗，生不定根的能力强，不定根有助于吸收肥水， 因此，栽培上常有“点水诱根”之说，在栽培过程中，茎基部经常形成一些根原基，采取有效措施，创造适宜诱根的环境，促其根原基发育成不定根，有助于植株生长发育。育苗期间的“炼苗”、 定植后的“蹲苗”都可以诱发新根的产生和深扎。
3、采用科学配方施肥技术
不同的肥料对根系的发生与发展作用是不一样的。如腐殖酸影响根系的体积和下扎的深度；钙直接影响根尖分生组织的成长；锌决定根尖的生长速度；磷能促进根系细胞的分裂、增殖和伸展。
因此在苗床、栽培地施肥时都要注意施用优质可溶的有机营养嘉美红利、脑白金。
4、注意保护好根系
根系在其生命过程中会因低温、高温、积盐、肥烧和机械损伤等而受到伤害。低地温时根系会发生寒根和沤根，可用嘉美红利缓解；高地温会使根系过快地衰老；土壤的高溶液浓度会使根尖和根毛受到损伤和抑制，使根系的吸收能力大大降低，可用嘉美红利螯合吸附；施肥不当或不适宜的中耕松土可能会直接使根系受到损伤，可用螯合态有机活化营养套餐肥红利、海力宝、赢利来等，活化土壤，保护根系，促进根系生长发育。因此棚室芸豆的生产中，在深翻土壤、增施腐熟的有机肥的基础上，适时播种、适期嫁接、定植、适时覆盖和揭除地膜、采用科学配方施肥技术和中耕松土等，都是保护根系的重要措施。
5、及时促进受害根系的恢复
在棚室芸豆的栽培中，芸豆的根系一旦受到伤害，要尽快采取措施促使其恢复。要针对发生的病害种类选用适宜的药剂进行灌根处理，同时加入海精灵生物刺激剂根施型促发新根。另外，在日常管理过程中可以使用恶霉灵或恶甲霜灵等预防病害的发生。
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