唐昭宗天覆三年(903年)，在朱溫護送下，昭宗重新回到長安，朱溫此時吞併關中，勢力正熾，已有篡位之心，且朝臣大多受誅。朱溫乘機派部萬人駐神策軍舊營，以其侄朱友倫典掌禁軍，派遣心腹擔任宮苑使、皇城使、左右街等職，將京師、皇宮、百官全都監控起來。
宰相崔胤雖與朱溫表面親近，內心卻不甘受其控制，便以防禦李茂貞為由，募兵六千人充當京城禁衛。朱溫暗中派部卒假扮平民前往應募，控制了這支隊伍。經此事朱溫對崔胤起了猜忌之心，便產生將昭宗遷往洛陽，以就近控制的想法。
多事之秋
不久，朱友倫擊鞠（古代一種球）時墜馬身亡，朱溫疑為崔胤等謀害，於是天覆三年十二月殺崔胤等朝官，強迫唐昭宗、妃嬪以及百官遷赴洛陽，拆毀長安宮室衙署及民間房屋，取其木材順渭河漂流而下，長安從此淪為一片廢墟。當唐昭宗路過華州（今陝西華縣）時，百姓夾道山呼萬歲。昭宗哭著說：“不要再稱萬歲，我已不再是你們的皇帝。”
昭宗遷都後，侍衛六軍逃亡散盡，身邊只有小黃門打毬供奉以及內園小兒共計二百多人。朱溫擔心他們生亂，意欲除之而後安。先是挑選二百餘人，與內園小兒貌相似，爾後令醫官許昭遠告內園小兒作亂，召集到別朝，至時一人擒拿一人，縊於坑所，然後穿其衣飾，充作內園小兒。昭宗起初沒能辨別，很久方才察覺。自此，昭宗的近前皆是梁王親信。
忠而不忠的朱溫
朱溫遷昭宗於洛陽，屠其左右，使昭宗成為孤家寡人，意圖挾天子以令諸侯的打算，引得天下藩鎮群起攻之。李茂貞、楊祟本、李克用、劉仁恭、王建、楊行密、起匡凝等皆以興復唐室為號，起兵挑戰朱溫。朱溫東征西討，又恐洛陽生變，便謀劃廢昭宗，另立新君，加以控制，日後再圖謀禪代。於是派判官李振、氏叔琮赴洛陽。龍武統軍朱友恭等在天祐元年(904年)八月弒殺唐昭宗，立昭宗第九子輝王李祚為帝，改名柷，史稱唐景宗(又稱哀帝)。
唐末藩鎮割據
天祐二年，朱溫借宴會之機誅殺昭宗其餘諸子。朝中大臣結黨鬥爭，宰相裴樞等自恃出身名門，輕視同僚；柳璨進士及第，靠佞媚奉承，陷害朝臣登宰相位，雙方爭鬥不息。朱溫想要親信張廷範出任太常卿，宰相裴樞則認為太常卿按以往慣例要以清流人士充當，張廷範乃朱溫客將，不便擔當此職。朱溫聽後大怒道：“我本以為裴樞生性純厚不浮薄，現在看來裴樞亦不過如此。”
天象之說
當年四月，彗星現於西北。五月，彗星光芒大亮，掃過文昌、軒轅、天市三區。這時有占星人說：“這預示著君王大臣將有大難，應該以刑殺來應對天象。”宰相柳璨趁機將素來所厭惡的人說與朱溫：“這些人聚眾鬧事，橫加議論，且心懷怨望，不如盡殺之以消除災難。”李振也對朱溫說：“朝廷之所以綱紀紊亂不治，都是由於這些衣冠浮薄之徒所致。況且大王還要圖謀大事，這些人都是朝中難以馴服之徒，不如盡殺之。”
振臂一呼
朱溫此時正欲謀劃篡位，因此欣然同意貶斥一批朝臣要員。同年六月，聚裴樞、獨孤損、崔遠、陸扆、王溥、趙崇、王贊等被貶朝官三十餘人於白馬驛，將他們全部殺害，投屍於黃河，史稱“白馬驛之禍”。
朱溫謂之曰:“此輩常自謂清流，宜投之黃河，使為濁流。”——《資治通鑑·卷二百六十五·唐紀八十一》凡是朝中不依附於朱溫者，且又自認門第高貴，或經由科第出身而身居三省臺閣官員、地位稍微顯赫者，都被誣告為朋黨，因此被貶逐而死的有數百人之多。朝中士大夫為之一空。“白馬驛之禍”為朱溫圖謀篡奪唐政權掃清了最終障礙。
朱溫大肆屠殺朝臣後，急於代唐自立。柳璨建議按歷代易號的慣例，先受“九錫”，爾後行“禪讓”。但朱溫急不可耐，以為柳璨故意拖延時間，立刻將柳璨斬首。天祐四年(907年),朱溫廢唐哀帝，改封濟陰王，加以囚禁，改元開平，定國號梁，史稱後梁。第二年，朱溫殺哀帝，李唐皇室湮滅。
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