Tips：
- 北美有更多的流行谱系（lineage）
- 北美开始出现“RFLP 1-7-4”新近流行株，堪称北美HP。
- ORF5 的RFLP 1-7-4酶切模式跟致病性无关。
国际化势不可挡，养殖也不例外，由于我们的市场规模和发展需求，吸引着大量的技术和商品输入。美国尤盛，当前在国内红火的两大外资背景的农场托管咨询公司以及知名猪界“白求恩”都来自美国。外来的和尚会念经，外国的月亮比较圆，当然关注小兰的人应该更能体会外来的毒株会暴发。虽然至今还没有足够的证据表明CH-1a这个最早的分离株是否来自美国，但至少NADC30-like毒株的引入是板上钉钉的事。老外最喜欢戏谑的打趣说，病毒都是“偷渡客”，从来去哪都不申请签证（VISA）。那我们今天就抱着看热闹不嫌事大，咸吃萝卜淡操心的心态扒一扒美国那个屯的“美兰疫事”，也许能学到点什么，知道提防着什么。
【美兰多门派】
每次大家介绍我国PRRS流行情况的时候都喜欢说我们具有丰富的毒株多样性和广泛的毒株变异，我们VM上的综述文章也总结了有至少23种nsp2缺失模式，但如果用基于ORF5进化树的分类标准来看，美国才是流行毒株种类最多的国家。在9个谱系（lineage)中有7个含有北美洲的分离毒株，而我国只有谱系1（NADC30-like），3（FJ-1)，5（BJ-4)，8（HP，CH-1a),而大部分变异都在lineage 1和lineage 8 里面，从宏观的角度来看也可能说明大量疫苗免疫的免疫压力貌似没有压在ORF5上，或者不算太大（仅为猜想，尚无数据）。美国上世纪80年代末首发，当时除了分离到VR-2332（type2 原型株），1989-1992年间还有一批同期分离株，但那一疫之后，谱系5就不行了，风头马上被别的毒株掩盖，沦为了非主流。从mang SHI的进化树上也能看出来当年lineage 1和lineage 9都是2000+的毒株数，lineage 8的1400，这几年咱们HP和NADC30-like毒株流行相信对lineage 1和8的贡献会更大。
尤其说一说lineage 1的毒株，大部分来自加拿大的魁北克（枫叶国是PRRSV阳性血清有记录的最早发现地），这些毒株都在进化树的根部（root）起源较早，此外，2001年nsp2内有131aa缺失的MN184及其变异株在美国暴发也是lineage 1的毒株，后面和lineage 9 成为北美的重要流行毒株，但具体谁更多我还不太清楚。---原来这么多年美国一直在为小兰发源地这一骂名背锅，加拿大偷笑不语。
【美兰新流行】
在美国猪场由于没有没有猪瘟（通过国家计划法案，净化清除了）伪狂犬，蓝耳无疑成为北美（甚至整个美洲大陆）最为丧心病狂的top猪病。美国猪场的蓝耳发病主要表现为母猪的繁殖障碍，断奶和保育猪的死淘率增加，但没有HP-PRRSV感染那样的急性大规模死亡。几年前有建模统计美国蓝耳引起的直接经济损失在6.4亿美元左右，但真正统计繁殖障碍造成的损失缺只占12%左右，呼吸道疾病的损失更大。
近几年内美国有一类叫做RFLP 1-7-4的毒株开始新近流行，这个毒株最早在2014年左右发现，它应该是由RFLP1-8-4（比如MN184）那一类毒株演化而来，最大问题是除了更严重的繁殖障碍（ Dramatic Abortion “Storms”），哺乳猪的死亡率提升，它的最猛的地方是能够引起母猪群出现死亡率，育肥猪死亡率上升到50%，专家惊呼，这不就是美国HP-PRRSV吗？而且它引起的发病很多甚至是疫苗免疫做的很好的猪场。该毒株目前主要在一些养殖密度比较大的区域出现流行，而且一旦发病之后，以前的控制方案失效，猪群恢复到稳定阶段所需要的时间远远超过原来毒株所导致的疫情。从下图进化树可以看出这一类毒株在田间应该是开始大量流行了，这样的疫苗扛不住的毒株在猪群中的情况，我们最熟悉了。
为了了解RFLP1-7-4这类毒株分子特征以及致病性，来自美国农业部的/韩帅和袁世山老师的导师/发现NADC30的/杰出斜杠女科学家/KayFaaberg又出手了。她的研究表明RFLP1-7-4这类毒株同源性在81.4% to 99.8%之间，重组分析发现毒株在结构蛋白和非结构蛋白中存在谱系（lineage）间重组（重组出品，必是精品）。其毒株nsp2内的缺失模式也不相同，有和NADC30相同的131aa缺失，但大部分是有独特的100aa的缺失（对应VR-2332 的328-427位），有的除了100个缺失之外还有缺16aa，缺32aa， 缺13aa的还有插入9aa的，总之nsp2有明显突变。—一句话基因组各式各样。
她选了4个代表毒株和以前的一个中等毒力的毒株SDSU73，比了比致病性，发现其感染后的发病情况也是不一样的，像A/2014/NADC34,IA/2013/ISU-1and IN/2014/ISU-5就比较厉害，而IA/2014/ISU-2在猪体内基本不怎么涨。所以说RFLP-174的酶切模式跟致病性并没啥关系，只是正好新近厉害的流行毒株多是这个模式。
通过看了那么多变异毒株，自己总结了一个规律，凡是没节操，爱缺失，易重组的毒株，致病性及危害都低不了。—这就是病毒复制保真性影响病毒致病性的粗犷推演。
【南美新动向】
pig333上有人对爱尔兰 IPVS2016大会上拉美地区的PRRS研究报告做了个总结，虽然都是个案，但管中窥豹，也算能见到一斑。
墨西哥
J. Segalés教授（我们2018 IPVS的keynotespeaker）对墨西哥的Bajío 地区37头有消瘦体质的猪只进行剖解和分子诊断。
发现有间质肺炎的68%，38%的有不同程度的淋巴器官水肿和充血。分子检测发现这些猪只中墨西哥三大病毒病圆环，蓝耳和蓝眼病（哈哈，没怎么听过吧，蓝完耳朵蓝眼睛。porcinerubulavirus-PoRV，Mexico独享）的阳性率分别为PCV2（43%），PRRSV（49%）和PoRV（3%），蓝耳居然阳性率比PCV2高，两个共感染率在19%左右。国内可能只要有PRRSV的PCV2基本跑不了，只是引不引起发病的问题。另外一个报道则表明公猪阳性的农场32%左右，自繁自养模式（self-replacement）的PRRS阳性农场在调查农场的在65.22%，而后备猪的血清阳性率在44.21%左右。
智利
1999年第一次报道了美洲型毒株的暴发，一直在搞控制和进化，2013年2月宣布（Self-declare，感觉到了pig333作者的不怀好意，呵呵）全国范围内清除PRRS，结果8个月后又发case，测序结果表明，还是先前的本土毒株。不是外来引入，引起暴发。
哥伦比亚
哥伦比亚的毒株比较有意思，从1996首次报道以来，这次研究人员把1998年到2014的毒株都分析了一遍，发现同源性极高91.2%-99.8%之间，都属于根红苗正的lineage5（VR-2332在的那个谱系），因为他们MLV仅仅用到2004年所以，缺少大规模疫苗免疫，宿主对野毒的选择压力不大。还是我们的选择压力山大—V5。
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中国农业大学动物医学院
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