番茄的病蟲害防治的原則，應本著“預防為主，綜合防治”的植保方針，堅持以“農業防治、物理防治、生物防治為主、化學防治為輔”的無害化治理原則，這對減上番茄產品汙染，持續、穩定的番茄生產具有重要的意義。
目前來說，通過培育抗病品種、培育無病壯苗、輪作以及科學的田間管理等農學技術措施，提高番茄自身的抗病能力。在施用化學農藥時，要嚴格遵循規定的安全間隔期、施藥濃度、施藥方法用藥，避開採收時間施藥。
同時應該交替視同不同類型的化學農藥，防止它產生抗藥性。番茄的生理病害主要有畸形果、日灼果、裂果、空洞果、筋腐病、臍腐病、卷葉病等等，畸形果主要表現就是果實形狀不規則，出現瘤狀果、尖嘴果等。
畸形果發病的原因很多，比如花芽分化以及發育時期，溫度過低，發育不良，施肥過多，特別是氮含量較多的時候，累積的營養過剩，花芽的分裂太過旺盛，導致果實不規則。在育苗期間，溫度不適宜過低，施肥過程中，營養要適宜，少量施用氮肥，另外一旦發現了畸形果就要立即摘除。番茄日灼病也是番茄的生理病害之一，大多發生在果實上，形成日灼果。尤其是離地栽培或者種植密度比較稀疏的大棚裡面，病害比較常見。
發病的原因一般都和日照強度有關係，番茄受到陽光直射，果實向陽面出現大塊褪綠變白的病斑，與周圍健全組織界限比較明顯，病斑部位後期變幹、革質狀、變薄、組織壞死。目前來說，防治日灼主要有一下的幾種方法：注意陽光直射，栽培密度應該稍大，同時要適時、適度整枝打杈，使莖葉相互掩蔽，避免果實受到陽光直射。當夏天陽關直射時，溫室、大棚內溫度過高的時候，要及時通風、促進葉面、果面的溫度下降。
裂果是番茄常見的生理病害，果皮表皮出現裂口，主要有放射狀裂果、環狀裂果以及條狀裂果等，也有不規則的側面裂果和裂皮。裂果的出現不但能降低番茄的品種，還能降低商品性，極大程度上影響了儲藏和運輸，並且容易感染病蟲害，引起果實腐爛。發生裂果的主要原因， 就是在發育期間，遇到了高溫、強光照、乾旱或者暴雨等異常氣候的影響，使果肉與果皮組織的生長速度不同步，造成裂果。
不同的番茄品種，對裂果的抗性差異比較大，一般小果品種比大果品種抗裂。紅果型品種比粉果型品種抗裂，尤其是吃拿起露地栽培，番茄在採收期正是高溫多雨的季節，環境條件很容易引起裂果。目前，防治裂果的主要措施有加強田間的水肥管理，合理施肥，曾江果皮堅實度，控制好土壤的水分，避免強光下澆水，避免果實受到強光照射。以上這些就是番茄的生理病害和防治的一些辦法，希望朋友們能提高產量、增加收益。
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