在航海途中，也曾经遇到过海蛇袭击，其中一些曾扑到一艘有三层桨的战船上，把船弄翻。许多古代和中世纪的航海著作中，都描述过船只与大海蛇遭遇的情况。
近现代以来，随着动物学的发展，人们已不再相信神话和传说中的怪物。然而，有关大海蛇的报道仍时有发生。
1817年8月14日，许多人在美国马萨诸塞州格洛斯特港一带见到一条非常巨大的海蛇出现。新英格兰林奈学会组织了特别委员会调查此事，录取了看到大海蛇人的宣誓证词。据证词称，大海蛇"头像一个四加仑的桶那么大，身体有琵琶桶那么粗，身长至少四十英尺。"
在1845年，亚伯特·寇区（Albert Koch）得知在阿拉巴马州发现的巨大骨头，后来被拼成了一具完整的骨骼的故事。他后来拼凑出一具长114英呎的「大海蛇」骨骼，并且让它在纽约与欧洲来公开展览。这具所谓的「大海蛇」骨骼最后被发现其实是5具不同个体的骨骼所组成的，其中包括龙王鲸，这些骨骼最后毁于1871年的芝加哥大火。
这些有关大海蛇的报道，尽管可能有夸大不实的成份，但无论如何不可一概视为谎言。然而现代科学又告诉我们，海蛇类一般身长1—1.5米，最大 的也不过2米长。那么航海者们遇到的"大海蛇"是一种什么动物呢？
对此，生物学家们有三种不同的解释：第一种观点认为可能是巨型鳗鱼。鳗鱼是一种体形细长，看上去很像蛇 的鱼类。一般鳗鱼的幼鱼长约5厘米，而长成后可长达2米。但有人捕到过长达半米的幼鳗，以此推测，估计这样的幼鳗长成后，可能会是长达20米左 右的巨型鳗鱼。 蛇颈龙(3)但人们至今尚未捕获过一条这样的巨型鳗鱼。因此巨型鳗鱼究竟是否存在，也仍然是个谜。
第二种观点认为是巨型海藻。有些海藻可能长得很大，如巨型褐藻最长可达百米以上，是世界上最长的生物体之一。它在海里随波浪起伏，使人看 上去认为是遇上了大海蛇。这种看法有一定的道理，但植物与动物，海藻与海蛇毕竟有着根本的区别。
如果说，令许多目击者感到极端恐怖的大海蛇都 是海藻，恐怕还有待进一步证实。 第三种观点认为是至今仍在海洋中生活的蛇颈龙。对好奇的人们来说，这种观点最有吸引力，蛇颈龙的前半身看上去也确实很像蛇。但活的蛇颈龙是否存在，本身仍是个未知数。因此这种解释也不能完全令人信服。
由于这些解释都不能得出使人满意的结论，因此大海蛇是否存在，如果 不存在，航海者们看到的又是什么动物，这个问题的解答至今仍有待于人们的进一步探索。
同时许多学者现在也认为大家看到的大海蛇其实是皇带鱼，这种鱼体型庞大，多生活在深海，一般体长3-5米，个别突出者能够达到15米-18米（5-6层楼的高度）有水桶粗。皇带鱼在历史上被人类发现了多次，也有具体的图片为证。
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