密法有許多超勝顯法的方便法門，故也稱“方便乘”。其方便可概括為如下幾點：
1．修止觀的方便
止心定和妙觀察是解脫成佛的主要通道。但在修止心方面密法有絕妙的方法，如觀氣脈明點收心入內之法和修大樂息心之法，以及全蝕和後化兩種入定法等等。
簡而言之，顯宗的止心修法是一種消極的控制散亂法，而密宗的止心法是一種積極的自然入定法。密宗有很多方便法，不需要長時期很枯燥地修定、修止觀，而是從一種特殊的天瑜伽觀想中順其自然，歸入一境，自然產生止觀的結果。
2．快速修色身資糧的方便
顯宗修色身（報化身）福德資糧，需要修三個無量劫。密法能將無量劫世修色身資糧的時間縮短到數世、到一世，甚至數十年之內，這在理論上是完全可行的，代替色身福德資糧的修法主要是佛身瑜伽。
顯宗八地以上菩薩才出現與佛相似的相好莊嚴相，這種近似佛身是真佛身的直接因緣。四續部都有佛身瑜伽，而在無上密中有更殊勝的真假幻身瑜伽。這類佛身瑜伽，一上來便自觀本尊，與顯宗八地以上的近似佛身有相似作用。這就是密宗即身成佛的主要根據。
3．修菩提心的方便
修以大慈悲心為動力的菩提心，在顯宗中需要修不惜捨身之類的廣大菩薩行，需要艱苦卓絕的利眾實際行動，但在密法中有觀想捨身法、放光度眾法、觀想供養法等許多完成大行的方便法。修六度萬行的目的是為了改變淨化心田，只要能淨化心靈，無法不可取。直接用改變心理狀態的觀想法去代替廣大行，具有事半功倍之效。
密法對顯宗中捨身是絕對反對的。因為人身難得，舍後很難再得，要保持住自己的人身以發揮其更大的作用；再說，僅僅是為了某些少數眾生而捨身，整個眾生的利益就會受到妨害。經中看到的施捨眼睛、手臂、腿肉或燃指供佛等，這隻能利益少部分人，利益不了大部分人，身體傷殘了，非常的不方便，這對眾生有什麼益處？
4．改變世俗執見的方便
凡聖的差別是有無世俗心，有世俗執見者為凡眾，無世俗執見者為聖人。
淨土是什麼？心淨了，穢土也是淨土；心不淨，淨土也是穢土。“心淨則國土淨”，世俗心田中才有淨土、穢土，勝義心中萬法平等，哪有淨穢之別？
在修行中對世俗心的破除是一個難題。
顯宗通過漫長的道路，修兩種菩提心來改變世俗觀念，培養佛心，把眾生看作母親以改變世俗的情仇愛憎等心理。
密法一開始就著手消除世俗心理，視五毒盛行的器世界為天國淨土、佛世界，視眾生為比自己強的聖眾或男女勇士空行。以對待佛菩薩的尊敬態度尊敬眾生。又如佛身瑜伽，觀自身濁體為明淨佛體，以佛的慈悲規範自己的思想行為。這些都是破除世俗心的極有效的方法。
5．轉害為利的方便
貪嗔痴是汙染佛心的巨毒，因而克服、根絕貪嗔痴便成了佛教的同一目標。但在對治三毒的方法上，大小顯密各有不同。
小乘以離欲為主，修淨行；大乘有離欲和帶欲兩種修法，僧人是離欲修，在家人是帶欲修行，不破除五欲。至於無上密，化欲為道或五欲為供和“煩惱即菩提”的說法有相似之處，對欲界眾生的修行提供了更大的方便。
歷史上，印度的密修士中大部分是國王、王妃、大臣、太子、公主這類在家弟子，藏傳佛教早期的宗教大師如瑪爾巴、米拉日巴，薩迦五祖中的前三祖都是在家的居士。而且，有些大密灌頂的方式對比丘僧眾提出了限制。這都足以說明密法化欲為道的性質。
6．度化惡眾的方便
在密法中有許多度化罪大惡極之人的方便法門，如引度大惡往生佛國的頗瓦法（遷識法）、制止惡行的咒力殺度法、洗滌重罪的消業法、大惡眾即身解脫法等等。
對罪惡深重的人光用慈悲的辦法是無能為力的，所以密法中才顯出多種憤怒金剛相，用咒力等去懲罰惡人、制止他的惡行，這實際上是幫助他、拯救他。菩薩戒中允許開殺戒。比如國王、大臣、將軍等一般情況下不能開殺戒，但為了廣大眾生的利益，有時候可以開殺戒。密乘更是推廣了這方面的內容。
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