微生物发酵饲料，是指在人为可控制的条件下，以植物性农副产品为主要原料，如：豆粕、花生粕、菜籽粕、棉籽粕、次粉、麦麸、米糠、菌糠等，通过微生物的代谢作用，将植物性、动物性和矿物性物质中的抗营养因子分解、合成，产生更能被畜禽采食、吸收养分和无毒害作用的生物饲料或饲料原料，已经被广泛的应用的水产养殖中。
微生物发酵饲料的好处主要有以下几个方面：
1、提高饲料利用率，降低养殖成本
发酵饲料通过生化反应，有效的把饲料原料分解转化成葡萄糖和氨基酸，缩短了饲料在动物消化道内的转化链，进而使得饲料中各种有效的成分迅速、有效的被吸收利用，可提高饲料的利用率。发酵后粗脂肪、有机酸的增加又增加了日粮中的能量，也是提高增重和饲料转化率的因素。
发酵饲料的多种微生物活菌能大量吸收动物难以利用的有机氮、无机氮，使之转化成为多种菌体蛋白质即蛋白饲料，显着增加了饲料营养成分，降低了饲料成本。
2、改善饲料的适口性
饲料在发酵后，产生天然的酸香味，能刺激动物的食欲，促进消化液的分泌，提高消化酶的活性，加速饲料营养成分的分解，从而促进营养物质的吸收，使得所养鱼虾采食量和采食速度全面提高。
3、改善水体环境
由于水产养殖的特殊性，多种有益菌在投放到水体中，通过氧化、氨化、硝化、反硝化以及固氮作用，快速降解水体中积累的大量有机物（如残余饵料、养殖动物的排泄物）和动植物残骸产生的有毒有害气体（如氨气、硫化氢等），降解过程中能够产生的多种直接被水中浮游植物充分利用的无机盐，水中大量繁殖的浮游植物又能进一步降解有害物质，改善养殖水体的各项指标，从而净化水质。促进了鱼虾的生长。水产养殖动物长期生活在水中，受环境因素的影响较大，接触到有害菌的机会也多。在鱼虾肠道内建立一个良性循环的微生物系统，是抵御病原性感染的最有效方式之一。
4、发酵脱毒，饲料更安全
近年来研究表明，乳酸菌可抑制霉菌的生长和产毒，嗜酸乳杆菌可抑制寄生曲霉的孢子萌发。另外，多数情微生物的代谢产物可以降低饲料中毒素的含量。实验表明，采用益富源水产促长剂发酵饲料可以有效地降低发酵棉粕中游离棉酚的含量。
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