03.04 新型冠状病毒的研究进展(2020.03.04)

一、COVID-19患者的抗体反应和动力学研究

2020年3月3日,深圳第三人民医院在medRxiv上上传了一篇研究,研究在173例确诊SARS-CoV-2感染患者在住院期间连续采集的血浆样本(n = 535)并对抗SARS-CoV-2的总抗体(Ab)进行了测定包括IgM和IgG。分析了抗体与疾病进展和严重程度的动力学。在173例患者中,Ab、IgM和IgG的血清转化率分别为93.1%(161/173)、82.7%(143/173)和64.7%(112/173)。12名没有血清转化的患者样本只在疾病早期被收集。血清转换为Ab,IgM和IgG的中位时间分别为11天、12天和14天。

发病前7天患者中抗体存在小于40%,自发病后第15天起,Ab、IgM和IgG分别迅速增加至100.0%、94.3%和79.8%。相比之下,第7天之前采集的样本中RNA阳性率从第7天前的66.7%(58/87)下降到第15天至39日的45.5%(25/55)。结合RNA和抗体检测可显著提高COVID-19患者致病诊断的敏感性(p = 0.001),即使在发病后1周的早期阶段(p = 0.007)。此外,Ab的更高滴度与较差的临床分级(p = 0.006)独立相关。结果表明抗体检测在SARS-CoV-2感染过程中提供了重要的临床信息,这些发现为血清学检测在COVID-19患者诊断和管理中的常规应用提供了强有力的实证支持。


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二、美国第一例COVID-19患者的病毒分离和鉴定

2020年3月3日,由美国CDC领衔,在bioRxiv上上传了一篇研究。在2020年1月20日,华盛顿州和CDC诊断出的第一例美国COVID-19患者的鼻咽和食管标本中分离出病毒,并鉴定了病毒序列、复制特性和细胞培养特性。作者发现,在没有胰蛋白酶的情况下,病毒可以复制到高低度在Vero-CCL81细胞和Vero E6细胞中。作者将病毒存入了两个病毒库,广泛提供给公共卫生和研究社区。

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三、COVID-19的注册临床试验分析

2020年3月3日,上海交通大学第六人民医院、山西医科大学等多家机构在medRxiv上上传了一篇研究,该研究首次对COVID-19的临床试验进行了系统审查,通过检索中国临床注册中心和ClinicalTrials.gov的数据库,收集COVID-19的注册临床试验。结果显示,从 2020 年 2 月 9 日开始,共进行了75例COVID-19注册临床试验(63项介入研究和12项观察性研究)。97.3%的临床试验是由中国组织发起的。只有11项试验开始招募病人,所有已登记的临床试验均尚未完成。大多数试验是早期临床探索性试验或实验前阶段(仅有的两例III期阶段是两例Remdesivir试验),并且所招募的受试者样本规模很小,主要干预方法包括中医治疗、西医治疗和中西医结合治疗,受试者主要是非重症成人患者(大于18岁),主要结果为临床观察和检查,大多数试验的持续时间超过5个月,干预研究的中位数为180 天,观察期的中位数为334天。

总体而言,干预登记试验和观察试验的方法质量都很低。结果表明,使用中医和西医的COVID-19的临床试验正在中国进行或即将进行。然而由于质量低、样品量小、完成周期长,在未来相当长的时期内无法获得关于COVID-19治疗的可靠、高质量的临床证据。应当提高研究设计质量,优先选择可靠药物,并采用不同的设计和统计方法,才值得中国COVID-19临床试验推广。https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.03.01.20029611v1

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四、SARS-CoV-2的内切酶Nsp15/NendoU的高分辨率晶体结构识别

2020年3月2日,芝加哥大学领衔,在bioRxiv上上传了一篇研究,该研究识别了SARS-CoV-2的内切酶Nsp15/NendoU的2.20埃高分辨率晶体结构,并与SARS-CoV和MERS-CoV的Nsp15模型进行对比。

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五、淋巴细胞比例(LYM%)可用于评估COVID-19的严重程度

2020年3月3日,第三军医大学和中部战区总医院在medRxiv上传一篇研究,研究在15例COVID-19死亡病例,15例重症病例以及40例中度病例中,回顾性地分析了淋巴细胞百分比的动态变化(LYM%) 。并在92例住院病例中验证了COVID-19淋巴细胞比例的预后作用。结果表明,在死亡和重症病例中,LYM%与COVID-19的病程和严重程度成反比。中度COVID-19病例的LYM%在症状出现后10-12天仍然高于20%。相比之下,重症病例中LYM% 低于 20%。进一步的,重症病例的LYM%在发病后17-19天高于5%,而死亡病例低于5%。因此,作者建立了一个可靠的发病时间-LYM%模型(TLM),可用于评估疾病严重程度和预测住院病人的结果。淋巴细胞比例能用于指示COVID-19患者的临床过程、治疗效果和最终结果。

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六、APOBEC和AdaRs都参与了冠状病毒基因组编辑

2020年3月3日,意大利国家研究委员会和锡耶纳大学等多个机构在bioRxiv上上传了一篇研究,由于宿主脱毒酶编辑是对抗病毒的先天限制过程,作者分析了从两个武汉患者支气管灌洗液中提取的病毒RNA序列。识别了可能是RNA编辑特征的核苷酸变化:包括ADAR脱毒酶介导的A到I的变化和APOBEC介导的C到U的变化。对不同毒株的基因组进行突变分析,发现了与SARS-CoV-2中观察到的相似的RNA编辑模式。结果表明,APOBEC和AdaRs都参与冠状病毒基因组编辑,这个过程可能决定病毒和患者的命运。

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七、SARS感染可能潜在导致胰腺炎的发生

2020年3月3日,华中科技大学同济医院在medRxiv上上传了一篇研究,研究分析了多组公共数据(RNA-seq和单细胞RNA-seq),发现ACE2在胰腺中的表达水平较高且广泛分布。此外,通过临床数据分析,在轻度和严重COVID-19患者中均存在轻度胰腺炎。在67例重症患者中,有11例(16.41%)淀粉酶和脂肪酶水平升高,5例患者(7.46%)显示成像改变。轻症患者中,有一例 (1.85%)淀粉酶和脂肪酶的含量升高,没有成像变化。结果解释了COVID-19患者轻度胰腺损伤的现象和可能的原因。这表明,在SARS-CoV-2感染后的胰腺炎在临床工作中也应引起重视。

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八、血清中病毒载量与炎症因子风暴密切相关

2020年3月3日,武汉大学和中部战区总医院在medRxiv上上传了一篇研究,研究分析了48名COVID-19患者,分三组测定血清病毒载量和血清IL-6水平。除常规统计分析外,采用广义线性模型(GLM)分析建立了基于实时RT-PCR Ct值的患者状态预测模型。结果显示,血清中病毒载量反映了病情的严重程度。此外,在危重病人中,炎症性细胞因子IL-6水平显著升高,比其他患者高出近10倍。更重要的是,极高的IL-6水平与血清病毒载量(R=0.902)和COVID-19患者的生命体征(R=-0.682)密切相关。研究表明血清SARS-CoV-2病毒载量与细胞因子风暴密切相关,可用于预测COVID-19患者的预后水平。此外,研究结果强烈表明,细胞因子IL-6应被视为具有过度炎症反应的危重病人的治疗靶点。

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九、COVID-19疫情对儿童慢性肾病的治疗产生影响

2020年3月3日,重庆医科大学儿童医院领衔在medRxiv上上传了一篇研究,在中国17家小儿肾病诊疗中心进行了匿名在线问卷调查。在735份有效问卷中,555名患者 (75.5%)和他们的父母说,疫情对他们的治疗有重大影响,264名患者(47.6%)说会延迟2至4周,199名病人(35.9%)延迟4 到 8 周,510患者 (84.16%)希望通过在线咨询与专家取得联系,528名患者(84.5%)希望在线咨询以供给药物,458名患者(62.3%)说,他们最担心的是慢性肾病会加重或复发,有203名患者感染SARS-CoV,313名患者(42.5%)经历焦虑,因此需要心理学家的干预。结果表明COVID-19对儿童慢性肾病的治疗有影响。在线咨询、药物提供和心理咨询是患者及其家属的最大需求,尤其是偏远地区。


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