據2018年11月中國科學院官網顯示，全院共擁有12個分院、100多家科研院所、3所大學（中國科學院大學、中國科學技術大學，與上海市共建上海科技大學）、130多個國家級重點實驗室和工程中心、210多個野外觀測臺站，承擔20餘項國家重大科技基礎設施的建設與運行，正式職工7.1萬餘人，在學研究生6.4萬餘人；建成了完整的自然科學學科體系，物理、化學、材料科學、數學、環境與生態學、地球科學等學科整體水平已進入世界先進行列，一些領域方向也具備了進入世界第一方陣的良好態勢。在解決關係國家全局和長遠發展的重大問題上，已成為不可替代的國家戰略科技力量。一批科學家在國家重大科技任務中發揮了關鍵和中堅作用，並作為我國科技界的代表活躍在國際科技前沿。
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