濟明女天皇在西援百濟途中死後，日本抗唐復濟的舉動暫停。百濟好端端一個國，就這樣給中國人滅了，唐朝在百濟設立了熊津等五個都督府，由劉仁軌率大軍鎮守，與鎮守百濟都城的劉仁願呈犄角之時。
百濟遺民不甘覆國，從日本回來的前王子扶余豐和遺臣鬼室福信等召集餘部，突襲唐軍鎮守的百濟都城泗沘，一時反叛四起，幾千唐兵在城中困守，岌岌可危。而蘇定方率領大軍久攻平壤不克，黯然而歸。半島局勢偏向日本和百濟一方，高句麗在不遠處竊笑。
百濟故城
唐帝國遠征軍退撤還是固守？在朝中引起爭議。鎮守百濟的重臣劉仁軌上表朝廷：現在從熊津撤軍，前功盡棄，百濟將死灰復燃，而新羅也將不保，攻破高句麗更將遙遙無期。到時朝鮮和遼東作亂，大唐也將無寧日。
劉仁軌的上書扭轉了疑慮風氣，唐高宗同意不撤兵。劉仁軌出兵馳援泗沘，與鎮守百濟都城的唐軍會合，剿滅了叛軍，使這一波百濟復國夢又破滅了。
唐高宗
劉仁軌
覆國之慘，遺民屢屢哭告哀訴，日本竟惻隱大動，“大國”勇武之道義被激發，決定支援百濟復國。
這個物產當時並不豐饒的邊夷之國，拿出了“矢十萬，絲五百斤，綿一千斤，布一千端，葦一千張，稻種三千斛”支援百濟遺民復國，隨後又派軍隊渡海馳援。
日本海軍抵達朝鮮半島南端的白江口（現韓國錦江入海口），正好碰上劉仁軌和新羅的水軍。兩方在白江口對峙。
當時日軍有戰船四百餘艘，唐和新羅只有一百七十餘艘，兵力也是數倍於唐新聯軍，於是氣焰幹雲，頗輕看大唐水軍。日本統帥放言：“此一役或可讓中國軍知天朝神威”。
第一日的水戰，劉仁軌命唐軍艦隊分左右兩路夾擊，日軍艦船慌亂，水中難以掉頭，與唐艦相撞，日本的竹木船多不敵唐軍的松木巨船，隔船相戰，日本的倭刀雖鋒利，也難敵唐軍的長矛勾槍，結果日海軍人船多有損傷。一晚無話。
白江口海戰
大概唐海軍中有人想起三國時吳蜀聯軍火燒赤壁的戰法，第二日，唐朝和新羅的艦船陣中，突發火箭（燃火的矢箭），日本海軍促不及防，四百多艘戰船皆被焚燬，一時間“煙焰漲天，海水皆赤”。兵卒在船上奔突嚎叫，跌撞踐踏，大多士兵跳入滾滾江水中溺水而亡。未死的殘軍皆跪在岸邊向唐軍投降……
百濟王子扶余豐脫身逃走，所佩寶劍被繳獲。
到底是天國盛唐時，唐軍以少勝多，兵民士氣如虹，相比之下，日人那視人視己的生命都如草芥、令人膽寒的武士道還沒誕生，剖腹亦不盛行——日軍這種爭相乞命的景象在後世再也看不到了。
百濟國隨著日本海軍的覆滅而徹底滅亡，隨後孤掌難鳴的高句麗也讓唐帝國給滅了，日本讓唐帝國攆走了，剩下以中國後裔為主的新羅統一了整個朝鮮半島。唐帝國還把自己的疆界一直擴到朝鮮北部，在平壤設立安東都護府。
《日本通史》寫道：“日本“白江口海戰的慘敗，大出天智天皇為首的貴族集團的意料之外。精神上由信心百倍與唐抗衡的亢奮狀態，一下子墮入了一籌莫展的境地。”
唐朝的一舉一動，都會使日本舉國感到驚恐。生怕大軍壓境，傳說中的不可戰勝的大陸軍隊（夾雜著草原匈奴、北部契丹和南部百越山人等野性部族）將蹂躪日本的秀山麗水。
天智天皇下令修建多座烽火臺、水城、山城以防唐軍來襲。
669年，盛傳唐朝將出兵日本，日本朝野一片驚慌，派深通中原漢文化的河內鯨出使中國的長安探聽虛實，在唐高宗的大殿之下，河內鯨謹慎應對，機警環覓，有所收穫後，速回國以報。當時唐初的國勢極熾，基本上是指哪打哪，打哪勝哪，把突厥、契丹、西藏、安南、大理等野性民族一個個收服，邊界已西擴到裡海，北到貝加爾湖，今哈薩克斯坦、吉爾吉斯、阿富汗大部、俄羅斯西伯利亞大部、外蒙古等中亞、東北亞地區大都在版圖之內。這是一種很可怕的廣大。邊鋒一展，獨居一隅的小島國日本隨時可能被捲進去……
河內鯨的彙報使日本朝廷愈加害怕，他們又匆忙加固幾座城池。就是在這種惶恐的局勢下，天智天皇積憂成慮而死。
日本人對白江口慘敗進行了多年的反思，他們意識到，以當時日本的實力是絕不可能與唐朝抗衡的，要想能有朝一日再與大唐對壘，成為世界的強者，必須完備中央集權體制，改變藩領各自稱霸的局面，實行富國強民的政策……同時他們還意識到，日本在政治、經濟、文化、思想甚至宗教上全面落後於大唐，如不加緊學習、追趕，將永無出頭之日。
隨之而來的奈良時代，遣唐使風起雲湧赴長安。日本人能屈能伸、善於學習的長處開始顯現無遺。
日本遂有800年的沉默，中日遂有1000年的和平。
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