姚弋仲軍事能力，在石虎的器重下得以更加淋漓盡致的發揮。338年，姚弋仲和支雄率領前鋒，向北展開了令支戰役，討伐雄踞幽州多年的鮮卑段部。姚弋仲和支雄商議，趁段部準備不足，展開閃電戰。長途奔襲偷襲段部首都令支。段部被迅猛勇敢的後趙軍徹底壓制，不出3個月。段部全部投降，首領段遼僅率少數親友逃亡。姚弋仲也因此受到石虎的大力嘉獎。
349年，關中士兵因為不滿石虎的殘暴統治，在梁犢等人的率領下兵變。梁犢一路受到士兵的擁戴，趕到長安附近時，已經有近十萬大軍。石虎先派李農和石閔討伐，結果大敗而歸。石虎於是下令讓姚弋仲和蒲洪一起討伐。這時石虎已經病重，不能接見姚弋仲。姚弋仲率八千輕騎趕到鄴城，石虎下令先賞賜酒食。姚弋仲大怒，不肯吃賞賜的酒食，說：“陛下是召我去攻打賊寇，還是讓我來吃飯的！我不知道陛下的存亡，如果可以一見，死而無憾。”
石虎聽說後，抱病接見姚弋仲，給他大量的封賞，讓他出徵。姚弋仲數落石虎說：“孩子死了才開始發愁了麼？怎麼搞得都生病了？你呀，你呀，孩子年輕的時候不為他選擇好老師，放手讓他們互相殘殺。孩子們固然有過錯，也是你對他們要求太高，所以才反叛的。你生病這麼久，太子又年少。如果我猜的不錯，天下必然大亂。你要擔心防止這件事，不用擔心梁犢。梁犢他們就是一群想回家的士兵，這種殘破的賊寇，必然被我捉到。”
姚弋仲對誰都說“你”，一點都沒有對皇帝的尊重禮節。石虎也素知姚弋仲脾氣，不怪罪他。姚弋仲披甲上馬，說：“讓你看看我羌族老頭能不能替你消滅敵人！”一路奔馳出發，都沒有和石虎告別。姚弋仲到達前線，多次擊敗梁犢，最後在滎陽將梁犢斬殺。石虎大喜，特別封賞姚弋仲可以佩劍上朝，讓他繼續討伐梁犢殘部。
姚弋仲和蒲洪、石閔等人於是深入關中，逐步逐步的消滅梁犢殘部。凱旋而歸的路上，三位將軍在李城遇見了石遵。石遵帶來了石虎去世，石世繼位的消息。石遵是石虎比較年長，比較能幹的兒子。而石世卻是石虎的小兒子。姚弋仲極力勸說石遵歸師攻打鄴城，願意和諸位將領給與支持。姚弋仲說：“殿下年紀大而且賢能，石虎也有意立殿下為儲君。但是晚年多病昏亂，被張豺劉氏等人迷惑。現在軍隊都在上白，鄴城空虛。殿下要宣佈張豺的罪行，大張旗鼓的東進，誰不倒戈開門迎接殿下呢！”
石遵於是和石閔聯手，發兵前往鄴城。姚弋仲進軍，駐紮在灄頭。一面支援石遵，一面擁兵自保，看局面的變化。石遵雖然非常順利的登上了皇帝的寶座，卻打開了後趙自相殘殺的潘多拉魔盒。349年到350年間，冉閔先後將石遵、石鑑誅殺，自己登上了皇帝的寶座。隨後冉閔頒佈“滅胡令”，開始宣佈漢族和胡族的勢不兩立。中原地區陷入混戰。
石虎的另一個兒子石祗在襄國稱帝，和冉閔正面對抗。石祗為了拉攏姚弋仲，封姚弋仲為右丞相。350年，冉閔大敗劉顯軍，進軍將襄國團團圍住。石祗派人向姚弋仲求救，姚弋仲派姚襄率領三萬大軍支援。臨行，姚弋仲對姚襄說：“你的軍事才能比冉閔要高上十倍，這次要是沒有把冉閔捉來，就不要回來見我了。”姚襄迎擊冉閔，和前燕軍和石祗軍會師，在盧澤大敗冉閔。但冉閔卻單騎脫逃，返回鄴城。姚弋仲為此大怒，罰姚襄杖打一百。
姚弋仲雖然一心想扶正後趙的統治。但是歷史的洪流並非一人可以扭轉。351年，劉顯殺掉石祗向冉閔媾和，轉而被冉閔所殺。隨後，前燕軍開始大肆進入中原地區。352年，冉閔和慕容恪巔峰一戰，冉閔兵敗被擒。前燕迅速開始控制整個太行山以東地區。姚弋仲看中原大勢已去，率領族人南下，於351年10月派遣使者向東晉投降。東晉朝廷大大冊封姚弋仲姚襄父子，非常恩遇。
352年3月，南遷途中的姚弋仲病重。姚弋仲將他的四十二個兒子召到床前，交待他們說：“石家待我非常的優厚，我本想為他們盡力。但是如今石家已被消滅，中原混戰無主。我死了以後，你們趕快歸附晉朝。要固守臣子的忠誠氣節，不要幹不義的事情！”隨後就去世了，享年73歲。
姚弋仲一生戎馬倥傯，卻頗能招攬能人。姚弋仲部下馬何羅曾經背叛姚弋仲投奔張豺。張豺失敗後，又厚著臉皮回來。姚弋仲手下將領都說要殺掉他。姚弋仲卻說：“如今是招納賢才的時候，應當收納才子，不能殺害啊。”繼續任命馬何羅為官。姚弋仲晚年已洞察軍事政治的要義，更難能可貴的是，為感恩石虎的提拔，一直努力幫助已經衰弱到極點的石祗。直到最後石祗死亡，才放棄抵抗投降晉朝。
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