孔有德和耿仲明都是遼東蓋州人，努爾哈赤攻克遼東後，他們就跟著難民隊伍來到皮島，被毛文龍收為部下。“太祖克遼東，與鄉人耿仲明奔皮島，明總兵毛文龍錄置部下，善遇之。”毛文龍在世時，對二人很是重用，並收他們為養孫，孔有德改名為毛永詩，耿仲明改名為毛有傑。袁崇煥殺害毛文龍後，其部下人心渙散，互相攻殺兼併。“有德與仲明走依登州巡撫孫元化為步兵左營參將。”
崇禎四年(1631年),皇太極率軍伐明，圍攻大淩河，孔有德被孫元化派去支援。走到吳橋時，士兵騷擾地方，地方不予接待，致使矛盾激化。而孔有德前往支援原本就非常不情願，一路上又天寒地凍，食不依時，夜無宿處，怨氣騰湧，就縱容官兵們紛紛四出搶掠。“元化遣有德以八百騎赴援，次吳橋，大雨雪，眾無所得食，則出行掠。”而在此時他碰到了李九成，“李九成者，亦文龍步將，與有德同歸元化，元化使齎銀市馬塞上，銀盡耗，懼罪。”就鼓動孔有德叛亂。想到自己一直受到排擠加處境的危險，孔有德嘆息說：“大將軍功名卓卓，猶且不免，我悲死固晚矣，時事如此，尚可為耶。”
耿仲明也感慨“大將軍要合義旅，跋涉荒，出萬死以復疆宇，而卒以冤死。我與若直几上肉耳，可鬱郁久居此乎？”於是決定叛亂，率所部起兵反叛。孔有德自從叛亂後，所向披靡，先後破陵縣、商河、齊東、德平、青城。
崇禎五年(1632)正月，孔有德率眾到達登州，耿仲明與都司陳光福及杜承功、曹德純、吳進興等十五人為內應，引導孔有德自東門入，登州城被輕易攻陷。聽到孔有德、耿仲明叛亂的消息後，“旅順副將陳有時、廣祿島副將毛承祿亦叛應有德，勢益張。有德自號都元帥，”耿仲明號稱總兵官。攻佔登州後，孔有德繼續派軍出擊，明廷派重兵圍剿，孔有德因為寡不敵眾，突圍而出，欲從海道投奔後金。當時的東江主帥黃龍正坐鎮旅順，黃龍所管轄的防區正是孔、耿必經之道，孔有德攻陷登州之後，黃龍的家人都被孔軍所殺，因此黃龍竭盡所能的阻擊孔有德。
崇禎六年(1633)二月二十六日，孔有德軍隊經過旅順時，遭到了黃龍大炮的轟擊，孔軍損失慘重。而在此時，明朝已經完成了狙擊孔有德軍隊的軍事部署。東面是朝鮮軍隊的圍堵，西面是旅順、寧遠等地明軍的追擊，北面是沈世魁率領皮島軍民的沿海部署。為了防止孔軍在走投無路時南竄，明廷還調動了江淮水師出擊。面對明軍及朝鮮軍的層層阻擊，孔軍已經是無路可退了。於是在四月十一日聯名給皇太極寫信，信中表示：“久仰明汗網羅海內英豪，有堯舜湯武之胸襟，無片甲只矢者，尚欲投汗以展胸中之偉抱，何況本帥現有甲兵數萬，輕舟百餘，大炮火器俱全，有此武備，更與明汗同心合力，水陸並進，勢如破竹，天下有誰敢與汗為敵乎？ 朱朝之天下，轉瞬即為汗之天下，是時明汗授我何職，封我何地，乃本帥之願也。特差副將劉承祖、曹紹中為先容。 本帥不往別地，獨向汗者，以汗之高明，他日必成大事，故效古人棄暗投明也，希詳察之。”
其實，後金君臣對孔有德和耿仲明的歸降意圖是完全知悉的，之前參將寧完我給皇太極上了一份奏疏，對孔有德和耿仲明的來降做了透徹分析：“臣竊料孔耿二人攜數萬人口，敗入海島，西南無路，朝鮮不親，島中糧少，非常存之地，其勢不久必屬我也。但念耿千總、王子登等乃自我國逃去者，必懷疑懼心，徘徊苟延，若不到個絕糧失勢之日，斷不肯翻然投來也。”他認為孔、耿如果不是走投無路的話，不會輕易叛降。
皇太極對孔、耿的叛降極為重視，他用隆重的禮節迎接了孔有德和耿仲明，“上率諸貝勒出德盛門十里，至渾河岸，中設黃幄，左右各設五青幄，上與大貝勒代善及諸貝勒，率孔有德、耿仲明及各官謝天，行三跪九叩禮畢，上與諸貝勒、始就坐。議孔有德、耿仲明、相見儀注，上欲令行抱見禮。諸貝勒曰：‘皇上恐不宜抱見，但以禮相待可耳。’上曰：‘昔張飛尊上而陵下，關公敬上而愛下，今以恩遇下，豈不善乎。元帥總兵曾取登州，攻城略地，正當強盛。而納款輸誠，遣使者三，率其兵民航海衝敵，來歸於我，功孰大焉。’朕意當行抱見禮，以示優隆之意。”並給予相當高的政治地位，“命與八和碩貝勒同列，行止與俱。”
因為他知道孔、耿的來降對後金的發展意義非常重大。這次孔、耿來降，為後金帶來了一萬三千八百八十人。其中有幾位將領精通火炮的使用，如火器副將吳進盛、火器營參將潘學、管紅夷大炮參將盧之能、程縕和火藥局參將賈志強等。除此之外，孔軍還帶來了戰船和火炮等軍用物資，這些都是後金所急需但又嚴重缺乏的。孔有德、耿仲明的來降使得後金如虎添翼。
尚可喜(1605-1676),遼東海州(即今遼寧海城)人。被毛文龍收為養孫，改名為毛永喜。其父尚學禮，隸毛文龍麾下，任東江遊擊，在樓子山戰鬥中中了後金兵的埋伏，最後因為寡不敵眾而戰死。尚可喜自幼跟著父親從軍，官為東江遊擊。毛文龍被殺後，尚可喜被分配到西協，歸劉興治管轄。劉興治為亂後，黃龍出任皮島總兵，尚可喜轉隸黃龍，並累官升至副將。
崇禎六年七月，降金的孔有德、耿仲明率兵攻打旅順，總兵黃龍戰死，沈世魁繼為島帥。與尚可喜素有仇怨的沈世魁當上總兵之後，一直伺機加害尚可喜，但都被尚可喜識破。聯繫到自己多年的境遇，“乃撫膺嘆曰：‘吾家世捐軀殉國，媢嫉者反欲擠之死地，大丈夫安能俯首就戮乎！’”而且此時的明廷已經千瘡百孔、腐敗不堪了，“諸臣恣意營私，牢持門戶，厝火有形，叩閽無路”。對此時的尚可喜來說，明廷不可依靠，東江鎮又無前途，再加上沈世魁的迫害，根本沒有他的立足之地。正當尚可喜一籌莫展的時候，聽到孔有德、耿仲明降金受到了優待的消息，這使尚可喜看到了一絲光明，於是決定歸降後金。故於崇禎六年十月二十四日秘密派遣盧可用、金玉奎與後金聯繫歸順事宜。
皇太極知道尚可喜來降非常高興，立即修書讓盧、金二人帶回，書雲：“諸凡情事，前書已悉，將軍與諸將可速為籌度，即來歸我。儻荷天佑，大事克成，功名富貴，皆可圖也。機會一失，悔之何及。幸無猶豫，速賜迴音。”這充分表達了他對尚可喜來歸的熱切盼望之情。尚可喜接到回書後，積極準備歸降事宜，並向皇太極表示要立功而歸。
崇禎七年一月，尚可喜攻下數島，肅清明朝守軍，帶領3500餘名部屬降金，尚有3000餘名男女老幼留在石城島上。皇太極非常重視尚可喜的歸順，對尚可喜及其部屬給予了妥善的安置，並“授歸附副將尚可喜為總兵官，賜敕印”，頒發敕書褒揚尚可喜識時務。尚可喜對此受寵若驚，非常感激，上疏奏言“蒙皇上遣使、賜還臣親戚二十七人，聖恩優渥、體恤周詳。臣惟有闔家頂祝，誓竭力圖報於將來也！”自從尚可喜來歸之後，陸續有其舊部來歸。這些都極大的增強了後金的軍事實力，提高了他們與明朝逐鹿中原的信心。
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