除掌握腎穿刺適應症外還應仔細排除禁忌症,有下列情況時應禁忌做腎穿刺活檢:
(1)有明顯出血傾向而且未能糾正者不宜腎穿刺，以免穿刺後出血不止。
(2)血液透析未超過24h,體內肝素仍有抗凝作用。另應血透時應有意識的安排小分子肝素透析或無肝素透析。
(3) 嚴重高血壓未控制在理想範圍內者不宜做腎穿刺活檢，一般認為血壓超過160/10mmHg時，這種高壓狀況下穿刺易出血不止，或形成動靜脈瘻。
(4)精神異常不能合作的患者不宜腎穿刺。
(5)有明顯心力衰竭，周圍循環衰竭或全身狀況很差者也不能腎穿刺活檢。
(6)獨腎或一側腎功能已經喪失不宜腎穿刺活檢。
(7)慢性腎功能衰竭固縮腎者，由於腎臟萎縮皮質變薄加上腎組織纖維化，行腎穿刺已無意義，故也不宜行腎穿刺活檢術。
(8)有明顯的腎盂積水及活動性腎臟感染時，也不能腎活檢以免導致出或炎症擴散。
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